| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,557,663 | C→T | 5.1% | L209L (TTG→TTA) | hypT ← | hypochlorite‑responsive transcription factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,557,663 | 0 | C | T | 5.1% | 390.5 / 8.3 | 117 | L209L (TTG→TTA) | hypT | hypochlorite‑responsive transcription factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/57); new base T (3/3); total (57/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CTGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAATGTGGTCAAACGGCGCTTCC > NC_000913/4557517‑4557810 | cTGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaa < 2:250437/149‑1 (MQ=255)cTGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaa < 3:1429173/149‑1 (MQ=255)cTGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaa < 3:679652/149‑1 (MQ=255) tGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaat > 3:169167/1‑149 (MQ=255) tGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTAGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaat < 1:250834/149‑1 (MQ=255) tgttgGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatc < 3:294903/135‑1 (MQ=255) tgttgGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatc > 4:294903/1‑135 (MQ=255) ttgGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAgg > 4:945406/1‑149 (MQ=255) ttgGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAgg > 4:919787/1‑149 (MQ=255) tgGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGa < 1:78523/149‑1 (MQ=255) ggCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGc > 4:691862/1‑149 (MQ=255) aCTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTg > 2:257367/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCACCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAAt < 2:397780/149‑1 (MQ=255) cAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCa < 3:945406/149‑1 (MQ=255) cAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCa < 3:471126/149‑1 (MQ=255) aGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAg < 3:691862/149‑1 (MQ=255) aGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAg < 1:408424/149‑1 (MQ=255) gCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaatc < 3:820170/112‑1 (MQ=255) gCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaatc > 4:820170/1‑112 (MQ=255) aaTCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaa > 2:1125481/1‑149 (MQ=255) aTCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaaa < 1:1125481/149‑1 (MQ=255) ccACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaat < 1:777559/105‑1 (MQ=255) ccACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaat > 2:777559/1‑105 (MQ=255) ccACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtg < 1:257367/149‑1 (MQ=255) acaGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaat < 3:1184693/103‑1 (MQ=255) acaGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaat > 4:1184693/1‑103 (MQ=255) gCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGcccc > 2:583662/1‑106 (MQ=255) tCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcgc > 3:1200303/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaa > 2:447189/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTaa < 3:113797/121‑1 (MQ=255) cTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaaa < 3:919787/149‑1 (MQ=255) cTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGt < 3:703832/148‑1 (MQ=255) tttAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtgt > 4:479665/1‑126 (MQ=255) aaaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTa > 4:579009/1‑89 (MQ=255) aaaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTa < 3:579009/89‑1 (MQ=255) aaaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtc < 3:520936/149‑1 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGcccc > 1:1186590/1‑83 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGcccc < 2:1186590/83‑1 (MQ=255) gctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGtt < 1:447189/149‑1 (MQ=255) tcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAg > 1:1338553/1‑133 (MQ=255) tcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCg > 1:521993/1‑149 (MQ=255) aaGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCAt < 4:225643/70‑1 (MQ=255) aaGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGtgtg < 1:147839/108‑1 (MQ=255) aaGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGtgtg > 2:147839/1‑108 (MQ=255) agagACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAg > 2:312998/1‑117 (MQ=255) agagACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTgg > 2:1329467/1‑149 (MQ=255) aCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTaa > 3:294367/1‑84 (MQ=255) aacaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCa > 2:844703/4‑139 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaatc < 3:1274531/56‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTaatcaatc > 4:1274531/1‑56 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc > 2:1217072/1‑129 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc < 1:1217072/129‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTc < 3:746914/135‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTc > 4:746914/1‑135 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGa < 4:169167/149‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc < 3:1044499/128‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc > 4:1044499/1‑128 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc < 4:337719/128‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc > 3:337719/1‑128 (MQ=255) aaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgt < 2:604553/96‑1 (MQ=255) aaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgt > 1:604553/1‑96 (MQ=255) aaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGgcg < 4:1212779/142‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAgg < 1:1329467/149‑1 (MQ=255) tGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAAt > 2:1256576/1‑149 (MQ=255) gAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGaa < 4:1220321/144‑1 (MQ=255) gAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGaa > 3:1220321/1‑144 (MQ=255) aCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTgg > 2:1373442/1‑87 (MQ=255) aCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAAtt > 1:265342/1‑146 (MQ=255) cTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTgaga > 4:789080/1‑149 (MQ=255) ttAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGAt < 2:445519/149‑1 (MQ=255) aCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGc < 2:553693/103‑1 (MQ=255) aCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGc > 1:553693/1‑103 (MQ=255) tCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCaaa > 3:132972/1‑149 (MQ=255) cTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATaa < 1:609671/149‑1 (MQ=255) tgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCg > 3:506419/1‑149 (MQ=255) gcgcGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTga > 1:1456299/1‑133 (MQ=255) gcgcGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTga < 2:1456299/133‑1 (MQ=255) gcgcGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATaa < 2:329050/144‑1 (MQ=255) gcgcGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATaa > 1:329050/1‑144 (MQ=255) gTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCTCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGaa > 4:109737/1‑145 (MQ=255) tCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAATGTgg < 1:1256576/149‑1 (MQ=255) ggggCGATTGATTAATCGCACCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTga > 1:1036590/4‑124 (MQ=255) ggggCGATTGATTAATCGCACCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTga < 2:1036590/121‑1 (MQ=255) ggggCGATTGATTAATCGCACCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATaa < 4:217145/132‑1 (MQ=255) ggggCGATTGATTAATCGCACCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATaa > 3:217145/4‑135 (MQ=255) gTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGaa < 2:1316974/139‑1 (MQ=255) gTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGaa > 1:1316974/1‑139 (MQ=255) gTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGCAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAATGTGGTCaaa > 3:110995/1‑149 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGAt < 2:712952/122‑1 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGa > 4:703035/1‑134 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAAtgtg < 4:1158170/139‑1 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAAtgtg > 3:1158170/1‑139 (MQ=255) aTTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc < 3:31333/58‑1 (MQ=255) aTTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc > 4:31333/1‑58 (MQ=255) aTTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGaa > 1:791889/1‑134 (MQ=255) aatcaatcGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGAc < 3:1310074/102‑1 (MQ=255) aatcaatcGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGAc > 4:1310074/1‑102 (MQ=255) tcaatcGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAAt < 3:1067259/130‑1 (MQ=255) tcaatcGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAAt > 4:1067259/1‑130 (MQ=255) tcaatcGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAATGTGGTCAAACGGCGCTTcc < 4:132972/149‑1 (MQ=255) | CTGCGAATTTCTTGTTGGATGGCGTACTCCGGCAGCCAGGCAATCCCACAGCCGTCGAGGGCAACCTGCTTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAACAATTGAGATTCAAATAAGCGAATGTGGTCAAACGGCGCTTCC > NC_000913/4557517‑4557810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |