| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,610,720 | T→A | 6.2% | L436Q (CTG→CAG) | prfC → | peptide chain release factor RF‑3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,610,720 | 0 | T | A | 6.2% | 1051.5 / 40.4 | 287 | L436Q (CTG→CAG) | prfC | peptide chain release factor RF‑3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (134/135); new base A (10/8); total (144/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
TTCACCGGTATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGAAGAGTTC > NC_000913/4610572‑4610868 | ttCACCGGTATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCt > 3:874005/1‑149 (MQ=255) aCCGGTATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGAt > 2:727552/1‑149 (MQ=255) ccGGTATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCACCAACGATCAGATc > 3:1264439/1‑149 (MQ=255) gTATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGtt < 2:1339787/149‑1 (MQ=255) tATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTg < 3:6569/149‑1 (MQ=255) ttCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGt < 1:765151/149‑1 (MQ=255) tCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTg > 2:533366/1‑149 (MQ=255) cGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCACCAACGATCAGATCGTTgttgga < 4:1264439/149‑6 (MQ=255) cGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCa > 1:1150216/1‑149 (MQ=255) aCCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCACCAACGATCAGATCGttgttggagattg > 1:395946/1‑137 (MQ=255) aGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGTTCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGtgctgc < 3:934630/149‑1 (MQ=255) aaCTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGgt < 1:477007/140‑1 (MQ=255) cTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGtt < 3:1215505/149‑1 (MQ=255) tGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGa > 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aaaGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCt < 3:24133/149‑1 (MQ=255) aGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGgtgt < 1:1000589/117‑1 (MQ=255) gATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGaa < 3:764686/149‑1 (MQ=255) aTCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGTTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAag > 3:1004296/1‑149 (MQ=255) cGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGc < 2:1150216/149‑1 (MQ=255) tGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCt > 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aaaaaCAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTACGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGCTGGTGCAGt > 4:903377/1‑97 (MQ=255) aaaaCAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCACCAACGATCAGATCGttgttgga > 1:920876/1‑92 (MQ=38) aaaaCAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCACCAACGATCAGATCGttgttgga < 2:920876/94‑3 (MQ=38) aaaCAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGt < 2:1405461/149‑1 (MQ=255) gctgctCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGc < 4:559299/133‑1 (MQ=255) gctCAAAGAGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAg < 3:298723/149‑1 (MQ=255) tCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGaa < 1:573674/131‑1 (MQ=255) aaaGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTg < 2:929074/76‑1 (MQ=255) aaaGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTg > 1:929074/1‑76 (MQ=255) aaaGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGt < 1:639067/78‑1 (MQ=255) aaaGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGtt > 3:462079/1‑138 (MQ=255) aaaGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGtt < 4:462079/138‑1 (MQ=255) aaaGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTa > 2:587945/1‑149 (MQ=255) aGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTAt > 2:621846/1‑148 (MQ=255) gggCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGa < 1:598653/149‑1 (MQ=255) tACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGaa > 3:71349/1‑112 (MQ=255) tACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGaa < 4:71349/112‑1 (MQ=255) tACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAg < 1:1351152/135‑1 (MQ=255) cTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGt > 1:160210/1‑149 (MQ=255) tttCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGtt > 4:1457281/1‑149 (MQ=255) tCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGc < 1:1260977/149‑1 (MQ=255) cGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCa > 2:841740/1‑149 (MQ=255) aaGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGaa < 2:276981/119‑1 (MQ=255) aaGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGcc > 3:507845/1‑146 (MQ=255) agagGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTg > 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accaacGATCAGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAAtt > 4:124310/3‑149 (MQ=255) aacaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGcc < 3:1422011/61‑1 (MQ=255) aacaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGaa > 4:668628/1‑72 (MQ=255) aacaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCTAAGAAAtt > 2:1187834/1‑149 (MQ=255) aacaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAAtt > 2:1082580/1‑149 (MQ=255) aacaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAAtt > 1:1321815/1‑149 (MQ=255) acaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGaa > 4:1107173/1‑71 (MQ=255) acaacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGaa < 3:1107173/71‑1 (MQ=255) caacGATCAGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGc > 2:207382/1‑132 (MQ=255) aacGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGagtcagtc < 1:1426325/99‑1 (MQ=255) acGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGaa < 1:1082580/149‑1 (MQ=255) acGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGaa < 1:814324/149‑1 (MQ=255) cGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGAag < 1:882255/149‑1 (MQ=255) gATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGAaga > 1:694788/1‑149 (MQ=255) aTCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGaa < 1:634992/146‑1 (MQ=255) tCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGtt < 1:1462371/73‑1 (MQ=255) tCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGAAGAGt > 4:488875/1‑149 (MQ=255) tGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGAAGAGTTc < 2:1270379/149‑1 (MQ=255) | TTCACCGGTATTCCGAACTTCGCACCAGAACTGTTCCGTCGTATCCGCCTGAAAGATCCGCTGAAGCAAAAACAGCTGCTCAAAGGGCTGGTACAGCTTTCCGAAGAGGGCGCGGTGCAGGTGTTCCGTCCAATCTCCAACAACGATCTGATCGTTGGTGCAGTTGGTGTGCTGCAGTTTGATGTGGTGGTAGCGCGCCTGAAGAGCGAATACAACGTTGAAGCAGTGTATGAGTCAGTCAACGTTGCCACTGCCCGCTGGGTAGAATGTGCAGACGCGAAGAAATTCGAAGAGTTC > NC_000913/4610572‑4610868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |