| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,431,550 | T→C | 6.1% | N834N (AAT→AAC) | stfR → | Rac prophage; putative tail fiber protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,431,550 | 0 | T | C | 6.1% | 376.1 / 8.5 | 111 | N834N (AAT→AAC) | stfR | Rac prophage; putative tail fiber protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/53); new base C (2/5); total (53/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGTTCTTCAAGAGACGG > NC_000913/1431405‑1431696 | caacaaAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGcc < 2:402641/149‑1 (MQ=255)caacaaAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATACGGATGGTGGCATTCCATGGAACGcc < 4:80774/149‑1 (MQ=255) aacaaAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCATTCCATGGAACGcca < 3:1363394/149‑2 (MQ=255) acaaAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCATTCCATGGAACGccac < 4:656343/149‑3 (MQ=255) aaGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCATTCCATGGAACGcc < 1:496415/144‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTgg < 1:612476/149‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTAC‑TTAACCGCCGCGCATGTGGCCTCTTTTTGCAGAAGGGCAAACGATAAATATGCCGATGCGGATGGTTGCGTTCCATGGAATGCCGGATCTGgc > 2:31269/1‑149 (MQ=255) aaaCGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCt > 1:921845/1‑149 (MQ=255) aaaCGACAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCt < 2:902036/149‑1 (MQ=255) ccAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACaa < 1:952752/149‑1 (MQ=255) cAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGa < 4:1320007/133‑1 (MQ=255) cAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGa > 3:1320007/1‑133 (MQ=255) cAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAAt > 2:612412/1‑149 (MQ=255) gggTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCAcc < 2:921845/149‑1 (MQ=255) gTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCg > 3:869663/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGct < 2:611709/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTg < 3:1370039/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTAACCCGCTCTgg < 3:860395/149‑1 (MQ=255) tgtTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTTGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTc > 4:745144/1‑136 (MQ=255) tgtTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTc < 3:745144/136‑1 (MQ=255) gtTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGa > 2:100433/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGTCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGAc > 4:796164/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGAc < 1:612412/149‑1 (MQ=255) gAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAg > 4:224547/1‑149 (MQ=255) ttGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCtat < 1:100433/149‑1 (MQ=255) tGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGc < 2:730748/136‑1 (MQ=255) tGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTACCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACTCGCTCTGGc > 1:730748/1‑136 (MQ=255) ttCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTgg > 2:210418/1‑149 (MQ=255) tCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGt < 4:1339439/149‑1 (MQ=255) aaaGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGcc > 2:1339505/1‑96 (MQ=255) aaaGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGcc < 1:1339505/96‑1 (MQ=255) aaaGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGgc > 4:697166/1‑105 (MQ=255) aaaGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGgc < 3:697166/105‑1 (MQ=255) aaaGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTaa > 3:122821/1‑149 (MQ=255) tatTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCATTCCATGGAACGcca < 1:613547/92‑2 (MQ=255) tatTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCATTCCATGGAACGcca > 2:613547/1‑91 (MQ=255) atTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCta < 4:122821/149‑1 (MQ=255) ttACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTc > 3:827969/1‑146 (MQ=255) ttACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTc < 4:827969/146‑1 (MQ=255) cTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACaa < 2:619504/103‑1 (MQ=255) cTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACaa > 1:619504/1‑103 (MQ=255) cTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTg > 4:1233736/1‑134 (MQ=255) tttAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCta > 3:672265/1‑144 (MQ=255) tttAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCta < 4:672265/144‑1 (MQ=255) tttAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCg > 4:329075/1‑149 (MQ=255) tttAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCg > 4:523067/1‑149 (MQ=255) tttAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCg > 2:762097/1‑149 (MQ=255) ttAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCgg > 1:263171/1‑149 (MQ=255) tAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGa < 3:224547/149‑1 (MQ=255) gccgcGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGa > 1:1415690/1‑144 (MQ=255) gccgcGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGa < 2:1415690/144‑1 (MQ=255) gcgcATGTGGCTGCTTTTGTCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAg < 3:796164/149‑1 (MQ=255) gtgGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTc > 3:1145600/1‑126 (MQ=255) gtgGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTc < 4:1145600/126‑1 (MQ=255) gctgctTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATc < 1:503330/71‑1 (MQ=255) gctgctTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATc > 2:503330/1‑71 (MQ=255) ctgctTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGAcc > 3:169160/1‑149 (MQ=255) ctgctTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGAcc > 4:198251/1‑149 (MQ=255) ttttGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGc > 3:1158572/1‑149 (MQ=255) ccAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATg < 1:210418/149‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATg > 2:1246396/1‑149 (MQ=255) cAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGa < 1:762097/149‑1 (MQ=255) cAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGa < 3:523067/149‑1 (MQ=255) aGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGtt > 2:712507/1‑105 (MQ=255) aGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGaa < 3:10651/127‑1 (MQ=255) aGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGaa > 4:10651/1‑127 (MQ=255) gAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTg > 1:367023/1‑101 (MQ=255) gAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTg < 2:367023/101‑1 (MQ=255) aaCGAATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATGTGGGGCTTACAATGTCACGCGCTTTGGCGACAGCTATGTTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGCCGGAAGTTGCCGGACCTTGCCGATGAAGGCGCAtt > 2:107575/1‑149 (MQ=255) aCGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTa < 2:263171/149‑1 (MQ=255) ggATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGgcgc > 2:689462/1‑143 (MQ=255) ggATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGgcgc < 1:689462/143‑1 (MQ=255) ggATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACa < 3:198251/149‑1 (MQ=255) tACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGcc < 4:84548/119‑1 (MQ=255) tACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGcc > 3:84548/1‑119 (MQ=255) atatGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCta < 3:534377/96‑1 (MQ=255) atatGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAAtg > 1:966675/1‑149 (MQ=255) atGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAg < 3:390754/131‑1 (MQ=255) atGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAg > 4:390754/1‑131 (MQ=255) tGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAAtggtg < 3:1098823/149‑1 (MQ=255) ccGATGCGGCTGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATggtggt < 1:107575/149‑1 (MQ=255) gATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTATAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTg < 3:1246175/78‑1 (MQ=255) gATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCt > 3:80124/1‑149 (MQ=255) tggtggCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTAcc < 4:1158572/149‑1 (MQ=255) gtggCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGt > 1:1286945/1‑149 (MQ=255) tggCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGtt < 2:966675/149‑1 (MQ=255) tggCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGtt > 1:1338860/1‑149 (MQ=255) gCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTc > 1:115063/1‑135 (MQ=255) gCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTc < 2:115063/135‑1 (MQ=255) gCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCt < 2:451747/136‑1 (MQ=255) gCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCt > 1:451747/1‑136 (MQ=255) cATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTc > 4:1414540/1‑57 (MQ=255) cATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTc < 3:1414540/57‑1 (MQ=255) cATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCt < 1:863034/130‑1 (MQ=255) cATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCt > 2:863034/1‑130 (MQ=255) aTGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGTTCTTCAagag > 3:1279832/1‑149 (MQ=255) gAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTa > 4:339726/1‑132 (MQ=255) gAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTa < 3:339726/132‑1 (MQ=255) gAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTAcc > 1:1154282/1‑134 (MQ=255) aaTGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGTTCTTCAAGAGACgg < 4:824649/149‑1 (MQ=255) | CAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGTTCTTCAAGAGACGG > NC_000913/1431405‑1431696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |