| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,462,029 | T→C | 6.6% | G379G (GGT→GGC) ‡ | paaJ → | 3‑oxoadipyl‑CoA/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA thiolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,462,029 | 0 | T | C | 6.6% | 645.6 / 23.5 | 193 | G379G (GGT→GGC) ‡ | paaJ | 3‑oxoadipyl‑CoA/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA thiolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (91/88); new base C (9/4); total (100/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.56e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
CGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGT > NC_000913/1461881‑1462176 | cGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGt < 1:758614/149‑1 (MQ=255) ggTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTa < 3:30998/149‑1 (MQ=255) gtgtACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTAc < 1:291694/149‑1 (MQ=255) 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aatgCGTAACGACCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGa > 3:387079/4‑136 (MQ=255) tAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtga > 4:557007/1‑149 (MQ=255) tAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtga > 2:908014/1‑149 (MQ=255) tAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtga > 4:1153112/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGAtt > 2:612847/1‑131 (MQ=255) aaCGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACcgc > 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(MQ=255) ggTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATa < 1:1136094/111‑1 (MQ=255) ggTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtgat > 2:824660/1‑146 (MQ=255) gTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGt > 4:40504/1‑149 (MQ=255) tCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtgat < 3:1061343/144‑1 (MQ=255) | CGTTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGT > NC_000913/1461881‑1462176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |