Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 172,500 | G→A | 6.9% | V347M (GTG→ATG) | fhuB → | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 172,500 | 0 | G | A | 6.9% | 379.1 / 13.4 | 115 | V347M (GTG→ATG) | fhuB | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/55); new base A (4/4); total (56/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGC > NC_000913/172353‑172648 | cTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACAtgt < 1:460619/149‑1 (MQ=255) tGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACAtgtg < 1:826164/149‑1 (MQ=255) gACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGc < 4:1380580/149‑1 (MQ=255) 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gTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTc > 4:1390235/1‑103 (MQ=255) tCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAg < 2:1245184/146‑1 (MQ=255) tCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAg > 1:1245184/1‑146 (MQ=255) cGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTaa < 2:1100516/149‑1 (MQ=255) gATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAg > 1:63903/1‑141 (MQ=255) gATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAg < 2:63903/141‑1 (MQ=255) 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cAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGtggtggtgg < 4:446091/61‑1 (MQ=255) cAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGtggtggtgg > 3:446091/1‑61 (MQ=255) cAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAAt > 1:510910/1‑149 (MQ=255) aaCATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAAtt > 3:333238/1‑149 (MQ=255) aCATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTa > 4:732754/1‑149 (MQ=255) aTGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATg > 1:331539/1‑149 (MQ=255) gtgCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATggc < 2:1297372/149‑1 (MQ=255) | CTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGGCTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGC > NC_000913/172353‑172648 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |