| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,230,417 | T→A | 8.8% | intergenic (‑32/‑207) | dusC ← / → yohJ | tRNA‑dihydrouridine synthase C/UPF0299 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,230,417 | 0 | T | A | 8.8% | 268.5 / 11.3 | 79 | intergenic (‑32/‑207) | dusC/yohJ | tRNA‑dihydrouridine synthase C/UPF0299 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/38); new base A (2/5); total (36/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAATGTGATC > NC_000913/2230274‑2230565 | ccaccaCGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAgcg < 3:807350/149‑1 (MQ=255) caccacGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAgcgc < 1:443007/149‑1 (MQ=255) ccacGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTAACATAGCGCCt < 1:1075753/149‑1 (MQ=255) ggACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTc < 2:441186/149‑1 (MQ=255) cAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGc < 4:102121/149‑1 (MQ=255) aCTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGa < 3:689462/149‑1 (MQ=255) tGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTAACATAGCGcc < 2:308862/130‑1 (MQ=255) aTGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTa < 4:1308152/123‑1 (MQ=255) aTGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTa > 3:1308152/1‑123 (MQ=255) gCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCt > 2:1229170/1‑149 (MQ=255) acaGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGtt < 4:947769/118‑1 (MQ=255) acaGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGtt > 3:947769/1‑118 (MQ=255) acaGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGc > 3:1142668/1‑149 (MQ=255) acaGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCACCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGc > 1:726605/1‑149 (MQ=255) aGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCaa > 1:1168912/1‑149 (MQ=255) aTCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGAt < 1:1059426/134‑1 (MQ=255) aTCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGAt > 2:1059426/1‑134 (MQ=255) gTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGAt < 2:448644/149‑1 (MQ=255) gTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtgc > 1:599692/1‑149 (MQ=255) gTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtgc > 1:1054525/1‑149 (MQ=255) gTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtgc > 3:220845/1‑149 (MQ=255) ttAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtgct < 1:981511/149‑1 (MQ=255) tAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtgctg < 2:1168912/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTg < 2:1054525/149‑1 (MQ=255) tCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtg < 4:1046064/137‑1 (MQ=255) tCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATtg > 3:1046064/1‑137 (MQ=255) tCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCa > 2:1142148/1‑149 (MQ=255) cAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCaa < 4:1142668/149‑1 (MQ=255) cAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCACCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATcc < 2:726605/149‑1 (MQ=255) aTTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTaaa < 4:568239/112‑1 (MQ=255) aTTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTaaa > 3:568239/1‑112 (MQ=255) aTTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTAACATAGCGCCtc < 1:1060501/96‑2 (MQ=255) ttCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTa < 1:584695/88‑1 (MQ=255) ttCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTa > 2:584695/1‑88 (MQ=255) aCGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAag > 1:544167/1‑119 (MQ=255) aCGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAag < 2:544167/119‑1 (MQ=255) aCCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCaaa > 2:883652/1‑114 (MQ=255) aCCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCaaa < 1:883652/114‑1 (MQ=255) gagagTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTg < 2:1207253/129‑1 (MQ=255) gagagTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTg > 1:1207253/1‑129 (MQ=255) aaGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCaaa > 4:233168/1‑119 (MQ=255) aaGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCaaa < 3:233168/119‑1 (MQ=255) aGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAagag < 3:1006347/105‑1 (MQ=255) aGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGcc < 1:1142148/149‑1 (MQ=255) aGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATCAAAGGTCTGCAAagag > 4:1006347/1‑105 (MQ=255) ctccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGAt < 4:681186/84‑1 (MQ=255) ctccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGAt > 3:681186/1‑84 (MQ=255) tccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTc > 4:693509/1‑91 (MQ=255) tccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTc < 3:693509/91‑1 (MQ=255) tccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGt > 4:1416486/1‑149 (MQ=255) ccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCaaa < 4:775681/112‑1 (MQ=255) ccctccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCaaa > 3:775681/1‑112 (MQ=255) tccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGa < 1:82177/99‑1 (MQ=255) tccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGa > 2:82177/1‑99 (MQ=255) tccATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGc < 3:1416486/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATg > 2:449379/1‑66 (MQ=255) aTCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATg < 1:449379/66‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATcc < 3:221632/114‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATcc > 4:221632/1‑114 (MQ=255) cAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAAt < 1:254968/105‑1 (MQ=255) cAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAAt > 2:254968/1‑105 (MQ=255) acacacGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCt > 1:1428770/1‑125 (MQ=255) acacacGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCt < 2:1428770/125‑1 (MQ=255) acacGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGa > 2:232577/1‑125 (MQ=255) acacGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGa < 1:232577/125‑1 (MQ=255) acGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTGTGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCt < 3:446537/130‑1 (MQ=255) acGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTGTGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCt > 4:446537/1‑130 (MQ=255) acGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAg < 3:114142/64‑1 (MQ=255) acGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAg > 4:114142/1‑64 (MQ=255) tatCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGAt < 2:415024/108‑1 (MQ=255) tatCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGAt > 1:415024/1‑108 (MQ=255) catcaCCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGcc < 1:1309993/139‑1 (MQ=255) catcaCCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGcc > 2:1309993/1‑139 (MQ=255) aaaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCt < 2:1019966/48‑1 (MQ=255) aaaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCt > 1:1019966/1‑48 (MQ=255) taGGCGCTAACATAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAgcgc > 2:331054/2‑142 (MQ=255) taGGCGCTAACATAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAgcgc < 1:331054/141‑1 (MQ=255) ggCGCTAACATAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCggg > 1:896005/1‑122 (MQ=255) ggCGCTAACATAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCggg < 2:896005/122‑1 (MQ=255) gcTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCAtt < 1:199640/106‑1 (MQ=255) gcTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCAtt > 2:199640/1‑106 (MQ=255) ttAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAATGTGATc > 4:729932/1‑149 (MQ=255) | CCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAATGTGATC > NC_000913/2230274‑2230565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |