| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,284,338 | C→T | 8.0% | N70N (AAC→AAT) | yejL → | UPF0352 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,284,338 | 0 | C | T | 8.0% | 636.3 / 34.1 | 199 | N70N (AAC→AAT) | yejL | UPF0352 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (95/88); new base T (8/8); total (103/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
ACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTAC > NC_000913/2284190‑2284486 | tGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGAc > 4:1120550/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGAc > 2:234040/1‑139 (MQ=255) gCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAgg > 3:1441525/1‑149 (MQ=255) cTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAggg < 3:925452/149‑1 (MQ=255) tCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACaaa > 3:180193/1‑136 (MQ=255) tCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACaaa < 4:180193/136‑1 (MQ=255) gaccgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGGAAc > 3:649481/1‑149 (MQ=255) accgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCAc < 2:1349577/138‑1 (MQ=255) cgaccTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGa < 1:650543/149‑1 (MQ=255) accTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATa > 4:962954/1‑149 (MQ=255) accTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATa > 4:928058/1‑149 (MQ=255) tttCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACa > 3:15454/1‑149 (MQ=255) tttCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACa < 2:729482/149‑1 (MQ=255) ttCCCCGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAg < 3:235429/149‑1 (MQ=255) cTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGGACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTa < 4:1371171/149‑1 (MQ=255) tGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGGAACAGATAACAGGTTAt < 4:649481/149‑1 (MQ=255) ggTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTa > 1:565543/1‑149 (MQ=255) ttAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTc > 2:663399/1‑149 (MQ=255) gCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATaa > 1:1014791/1‑129 (MQ=255) aaCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATgg < 1:85099/137‑1 (MQ=255) aaCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATgg > 2:85099/1‑137 (MQ=255) aaCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTc > 3:529951/1‑149 (MQ=255) aaCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTc < 4:239839/149‑1 (MQ=255) aaCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTc > 3:993761/1‑149 (MQ=255) aaCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTc > 4:1068543/1‑149 (MQ=255) aCATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAg > 3:1055957/1‑129 (MQ=255) aTGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAgc < 3:1120550/149‑1 (MQ=255) tGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAgcg > 4:1092918/1‑149 (MQ=255) gTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCt > 4:1344693/1‑149 (MQ=255) cACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTc < 1:750754/135‑1 (MQ=255) aCTAACCTTATCAACACCAGTATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTAcc > 3:1230066/1‑149 (MQ=255) aCTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAAc > 2:523637/1‑87 (MQ=255) tAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAggg > 1:326825/1‑106 (MQ=255) tAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGt > 1:521366/1‑149 (MQ=255) tAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATCGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATc > 2:762049/1‑135 (MQ=255) aaCCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCTGCGCCTGACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAgg < 3:1418913/119‑1 (MQ=255) aCCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGa > 1:678156/1‑149 (MQ=255) aCCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGa > 1:1223465/1‑149 (MQ=255) ccTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGaa > 1:484743/1‑149 (MQ=255) ttATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGa > 3:809007/1‑85 (MQ=255) aTCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGa < 3:872801/83‑1 (MQ=255) tCAACACCAGTATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGt < 4:1230066/149‑1 (MQ=255) tCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGa > 1:139940/1‑82 (MQ=255) acacCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGtctc > 2:1410962/1‑149 (MQ=255) acacCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGAGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGtctc < 1:111388/149‑1 (MQ=255) acCAGCATTGCCCCGGCCGAACGCCAGGCAATTGCCAACGCTGTTGCCCGCGACTTACACTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAAGGAAACAGGTAACAGGTTATGGTTACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTccc < 2:642168/149‑1 (MQ=255) acCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTccc < 2:1223465/149‑1 (MQ=255) acCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTccc < 3:229537/149‑1 (MQ=255) ccAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGaaa > 3:337303/1‑95 (MQ=255) ccAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATc < 4:802232/121‑1 (MQ=255) cAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTcc < 2:868983/146‑1 (MQ=255) cAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTcc > 1:868983/1‑146 (MQ=255) gCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAAc < 4:148452/68‑1 (MQ=255) cATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATg < 3:1344693/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAg < 4:896493/84‑1 (MQ=255) gCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCa < 3:1068543/149‑1 (MQ=255) cccGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCGACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGt > 1:644528/1‑149 (MQ=255) ggCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTgg > 2:785101/1‑149 (MQ=255) ccAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAAc > 1:780089/1‑100 (MQ=255) ccAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGtct > 4:1098873/1‑129 (MQ=255) ccAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGtct < 3:1098873/129‑1 (MQ=255) aCGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCAc < 3:962954/149‑1 (MQ=255) ccAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTgg < 1:633870/149‑1 (MQ=255) aGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGtct < 1:197449/121‑1 (MQ=255) aGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGtt > 3:323135/1‑149 (MQ=255) ggCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGttt < 1:41905/149‑1 (MQ=255) aaTTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGa > 4:301630/1‑71 (MQ=255) aaTTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGa < 3:245223/71‑1 (MQ=255) aaTTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCa < 4:529951/149‑1 (MQ=255) ccAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGtt > 4:760234/1‑149 (MQ=255) ccAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGtt < 3:1092918/149‑1 (MQ=255) cAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAAc > 1:815718/1‑62 (MQ=255) cAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATc < 2:722560/87‑1 (MQ=255) cAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTggg > 4:552037/1‑129 (MQ=255) cAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTggg < 3:552037/129‑1 (MQ=255) aaCTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCa > 2:482601/1‑149 (MQ=255) aaCTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCa > 1:1332003/1‑149 (MQ=255) tctTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAata > 3:204586/1‑149 (MQ=255) ttttGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATTGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATAtt < 2:362994/149‑1 (MQ=255) ttttGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTggg > 4:1038598/1‑123 (MQ=255) ttttGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGtt < 4:323416/133‑1 (MQ=255) ttttGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGc > 2:836273/1‑136 (MQ=255) ccTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCt < 3:760234/149‑1 (MQ=255) cTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTc > 4:859989/1‑145 (MQ=255) aGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGt > 1:1150225/1‑98 (MQ=255) aGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGt < 2:1150225/98‑1 (MQ=255) tCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGaaaaa > 4:232076/1‑82 (MQ=255) tCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTggg > 1:83846/1‑104 (MQ=255) tCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCt > 2:1191858/1‑135 (MQ=255) tCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCt < 1:1191858/135‑1 (MQ=255) tCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTg > 4:1188731/1‑149 (MQ=255) ctctATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGc > 2:591438/1‑149 (MQ=255) tATCAATGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTc > 4:205959/1‑119 (MQ=255) tATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGtct < 2:1047918/81‑1 (MQ=255) tCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTggg > 1:885643/1‑97 (MQ=255) tCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCg > 4:372231/1‑149 (MQ=255) aCGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGt < 4:1423661/44‑1 (MQ=255) aCGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGtt < 3:1302377/113‑1 (MQ=255) aCGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGtt > 4:1302377/1‑113 (MQ=255) aCGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGtt < 3:1035723/113‑1 (MQ=255) | ACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTAC > NC_000913/2284190‑2284486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |