| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,208,205 | G→A | 8.9% | G61D (GGT→GAT) | ttdT → | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,208,205 | 0 | G | A | 8.9% | 278.9 / 15.0 | 90 | G61D (GGT→GAT) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/38); new base A (3/5); total (47/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
CGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTCGCCGC > NC_000913/3208058‑3208349 | cgccgcTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGt < 3:68009/149‑1 (MQ=255) gcTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTatat < 3:1299957/149‑1 (MQ=255) gTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCcaccat < 2:1273951/149‑1 (MQ=255) gTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCcaccat < 4:299125/149‑1 (MQ=255) tCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCatcatc < 1:1004646/149‑1 (MQ=255) aTCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGc > 2:1103938/1‑149 (MQ=255) aTCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGc > 1:34111/1‑149 (MQ=255) ccATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTggg < 2:650699/130‑1 (MQ=255) ccATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTggg > 1:650699/1‑130 (MQ=255) ccATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATa > 1:1100734/1‑149 (MQ=255) ccATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATa < 2:34111/149‑1 (MQ=255) ttGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATGCCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCatcatc < 1:591638/137‑1 (MQ=255) ttGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGACCCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCatcatc > 2:591638/1‑137 (MQ=255) ttGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCcat < 2:892443/133‑1 (MQ=255) ttGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCcat > 1:892443/1‑133 (MQ=255) ctctACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTccc > 4:1412395/1‑149 (MQ=255) tctACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCt > 1:1076202/1‑149 (MQ=255) tctACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCt < 2:1076202/149‑1 (MQ=255) ttCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATa > 2:1434249/1‑134 (MQ=255) ttCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATa < 1:1434249/134‑1 (MQ=255) ttCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgctg > 2:934327/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgctgct > 1:442673/1‑149 (MQ=255) cGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGta < 2:150777/114‑1 (MQ=255) cGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGta < 4:1411652/114‑1 (MQ=255) cGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGta > 1:150777/1‑114 (MQ=255) cGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGta > 3:1411652/1‑114 (MQ=255) ggTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGt > 3:518566/1‑149 (MQ=255) gTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTGCTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGtt > 4:1193680/1‑149 (MQ=255) gTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGta < 3:1173820/112‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGta > 4:1173820/1‑112 (MQ=255) tCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCa < 2:1100734/149‑1 (MQ=255) gCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGccc > 1:1015018/1‑149 (MQ=255) tGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGagcag < 3:1412395/149‑1 (MQ=255) ggAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGagcagc < 2:442673/149‑1 (MQ=255) ccATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAgctcgctc > 2:713296/1‑149 (MQ=255) cATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCaccatc < 2:464696/102‑1 (MQ=39) cATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCaccatc > 1:464696/1‑102 (MQ=39) cATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCaccatc < 2:808212/102‑1 (MQ=39) cATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCaccatc > 1:808212/1‑102 (MQ=38) tACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGc > 3:118952/1‑149 (MQ=255) ggCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGc < 1:934327/149‑1 (MQ=255) ctctACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCtt < 2:1015018/149‑1 (MQ=255) tctACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgct > 2:1101847/1‑112 (MQ=255) tctACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgct < 1:1101847/112‑1 (MQ=255) aCTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa < 1:1103938/149‑1 (MQ=255) tttGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGc < 2:810962/89‑1 (MQ=255) tttGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGc > 1:810962/1‑89 (MQ=255) cGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCAc < 2:1087579/147‑1 (MQ=255) cGTTTTTACTGCCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCAc > 1:1087579/1‑147 (MQ=255) gTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa > 2:66880/1‑141 (MQ=255) gTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa < 1:66880/141‑1 (MQ=255) tttttACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCa > 3:17099/1‑149 (MQ=255) cGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCctct < 4:118952/149‑1 (MQ=255) gTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGagcagc > 1:1194545/1‑109 (MQ=255) gTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGagcagc < 2:1194545/109‑1 (MQ=255) aTCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTg > 4:525720/1‑149 (MQ=255) aTCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTg > 3:1437601/1‑149 (MQ=255) aTCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTg > 3:367044/1‑149 (MQ=255) gTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGc > 1:354991/1‑149 (MQ=255) ggACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGt > 3:132778/1‑149 (MQ=255) gACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGa > 3:985299/1‑94 (MQ=255) gACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGa < 4:985299/94‑1 (MQ=255) gACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGtt < 4:17099/149‑1 (MQ=255) cTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTc > 2:6941/1‑149 (MQ=255) tGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTcc < 4:518566/149‑1 (MQ=255) gATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgct < 1:1053670/75‑1 (MQ=255) gATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgct > 2:1053670/1‑75 (MQ=255) gATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCg < 1:713296/149‑1 (MQ=255) aTCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCAc < 4:1072154/119‑1 (MQ=255) aTCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCAc > 3:1072154/1‑119 (MQ=255) gAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTc < 3:1193680/149‑1 (MQ=255) aCCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTa > 3:1305871/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCa > 2:643721/1‑108 (MQ=255) ccGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCa < 1:643721/108‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCg < 4:132778/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATActc < 1:1251850/48‑1 (MQ=255) ccGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATActc > 2:1251850/1‑48 (MQ=255) gTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTATTCAGCCGGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGTCTTTAAATTCGCTGCAAAATGCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATc > 3:911036/1‑149 (MQ=255) gtggtgGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCt < 4:367044/149‑1 (MQ=255) gtggtgGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCt > 1:526093/1‑149 (MQ=255) tggtggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATc > 2:1231256/1‑103 (MQ=255) tggtggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATc < 1:1231256/103‑1 (MQ=255) tggtggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGt < 2:585821/125‑1 (MQ=255) tggtggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGt > 1:585821/1‑125 (MQ=255) ggtggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTgg < 4:939332/145‑1 (MQ=255) ggtggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTgg > 3:939332/1‑145 (MQ=255) gatgatGGATATACCCACCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa < 4:1228460/82‑1 (MQ=38) gatgatGGATATACCCACCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa > 3:1228460/1‑82 (MQ=38) gATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGcc < 1:589984/53‑1 (MQ=255) gATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGcc > 2:589984/1‑53 (MQ=255) gATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTcg > 3:271838/1‑149 (MQ=255) gtggGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTcgccgc > 1:618964/1‑149 (MQ=255) | CGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTCGCCGC > NC_000913/3208058‑3208349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |