| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,314,876 | T→G | 6.1% | D380A (GAC→GCC) ‡ | infB ← | translation initiation factor IF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,314,876 | 0 | T | G | 6.1% | 536.4 / 20.8 | 147 | D380A (GAC→GCC) ‡ | infB | translation initiation factor IF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/72); new base G (5/4); total (71/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
ACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCCGCTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCAGTTTCATCATCGCTTTGATGAC > NC_000913/3314728‑3315021 | tgtgCTGGGTAATGCCGCCCGCTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTc < 3:840354/149‑1 (MQ=255) tAATGCCGCCCGCTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGcc > 3:932613/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCCGCTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCctct < 1:625333/149‑1 (MQ=255) ccgcccgcTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTc < 4:253757/149‑1 (MQ=255) cccgcTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAg < 4:112121/149‑1 (MQ=255) gcTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTc < 4:519678/149‑1 (MQ=255) ttCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGc < 4:1430725/125‑1 (MQ=255) ttCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGc > 3:1430725/1‑125 (MQ=255) gCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGtttt > 3:1368963/1‑149 (MQ=255) ccAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCAtt > 2:1128218/1‑126 (MQ=255) ccAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCAtt < 1:1128218/126‑1 (MQ=255) agagGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCac > 4:1343012/1‑149 (MQ=255) ccACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGc > 3:462849/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGa > 2:1443946/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGa > 3:1151768/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGa > 1:529787/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGa < 4:932613/149‑1 (MQ=255) ttCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGc > 1:365131/1‑109 (MQ=255) ttCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGc < 2:365131/109‑1 (MQ=255) gTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAAc < 3:1064290/149‑1 (MQ=255) tGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACtt < 4:462849/149‑1 (MQ=255) aaCGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTc > 1:464031/1‑104 (MQ=255) aaCGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCAt < 3:880578/106‑1 (MQ=255) aaCGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCAt > 4:880578/1‑106 (MQ=255) aCGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTAt > 1:112597/1‑149 (MQ=255) cGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATg < 4:1368963/149‑1 (MQ=255) cGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATg < 3:1343012/149‑1 (MQ=255) gAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACtt < 4:612252/144‑1 (MQ=255) gAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATgg > 2:526141/1‑149 (MQ=255) aTGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTAt > 3:477030/1‑145 (MQ=255) aTGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTAt < 4:477030/145‑1 (MQ=255) tGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGccc < 1:1424459/149‑1 (MQ=255) tAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCAt > 3:129768/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCAtct < 1:122266/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCAtct > 1:906494/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAg < 4:743270/128‑1 (MQ=255) agcagAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCctct > 4:485518/1‑102 (MQ=255) agcagAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCctct < 3:485518/102‑1 (MQ=255) gcagAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCa < 2:906494/149‑1 (MQ=255) gagagGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCa > 3:163236/1‑149 (MQ=255) gagGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAAc < 1:1443946/149‑1 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAg > 2:784567/1‑97 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAg < 1:784567/97‑1 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGtt < 3:422889/103‑1 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGtt > 4:422889/1‑103 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCAtctc < 3:1272094/136‑1 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCAtctc > 4:1272094/1‑136 (MQ=255) ttttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGCGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCtt > 3:588592/1‑93 (MQ=255) tttACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGATCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCt < 4:129768/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAATTTTATGGCCCa < 3:836241/127‑1 (MQ=255) ccGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCa > 4:836241/1‑127 (MQ=255) tCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCg > 1:1365559/1‑144 (MQ=255) aaCGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCacg < 3:1224394/96‑1 (MQ=255) aaCGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCacg > 4:1224394/1‑96 (MQ=255) aaCGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCt < 2:112597/149‑1 (MQ=255) aCGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTc < 4:15925/80‑1 (MQ=255) aCGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTc > 3:15925/1‑80 (MQ=255) tGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATc < 1:527433/149‑1 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTcc < 1:482003/74‑1 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTcc > 2:482003/1‑74 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGttt < 3:391026/83‑1 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGttt > 4:391026/1‑83 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCa < 3:532678/111‑1 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCa > 4:532678/1‑111 (MQ=255) ccATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATa > 3:916573/1‑149 (MQ=255) cATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATaa < 2:529787/149‑1 (MQ=255) atgatgGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGAt > 2:1421920/1‑146 (MQ=255) tgatgGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATg < 3:1442281/103‑1 (MQ=255) tgatgGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATg > 4:1442281/1‑103 (MQ=255) ggTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGt < 4:163236/149‑1 (MQ=255) tCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTg > 3:7887/1‑149 (MQ=255) tCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTg > 3:715353/1‑149 (MQ=255) acaACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGttt > 3:169202/1‑72 (MQ=255) acaACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGAt > 1:1372709/1‑149 (MQ=255) aaCCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATgg < 2:586688/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGtt < 1:333007/149‑1 (MQ=255) gcgcgcgcGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGcc < 4:7887/149‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGccc > 1:599429/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGccc < 2:599429/148‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCa > 3:325269/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTcc > 3:689411/1‑111 (MQ=255) tCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTcc < 4:689411/111‑1 (MQ=255) gCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATaa < 1:104214/118‑1 (MQ=255) ccGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCAGTTtc < 4:1151768/149‑1 (MQ=255) gagcgaccGTGACACGGGTGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTgcgc > 4:830046/7‑138 (MQ=255) gcgaccGTGACACGGGTGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGtt > 2:37971/5‑126 (MQ=255) gaccGTGACACGGGTGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTc < 4:1121160/97‑1 (MQ=255) gaccGTGACACGGGTGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTc > 3:1121160/3‑99 (MQ=255) aCCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCATGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTc > 3:887268/1‑78 (MQ=255) aCCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTc < 4:887268/78‑1 (MQ=255) cccGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTg > 2:1357162/1‑113 (MQ=255) cccGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTg > 2:944518/1‑113 (MQ=255) cccGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTg < 1:944518/113‑1 (MQ=255) gtgtCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCAGTTTCATCATCGCttt < 4:916573/149‑1 (MQ=255) gtCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCAGTTTCATCATCGCTTtga < 2:77060/149‑1 (MQ=255) gtCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCAGTTTCATCATCGCTTtga > 1:77060/1‑149 (MQ=255) tCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGccc > 3:788906/1‑63 (MQ=255) cACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTgc < 2:560262/124‑1 (MQ=255) aCGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTc < 1:1297174/90‑1 (MQ=255) aCGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTc > 2:1297174/1‑90 (MQ=255) | ACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCCGCTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGTCCAGCAGAGAGGTTTTACCGTGGTCAACGTGACCCATGATGGTCACAACCGGCGCGCGCGGTTCAGCCGCAGCACCCGTGTCACGGTCGCTCATTACCGCCTCTTCCAGCTCGTTTTCACGACGCAGGATAACTTTATGGCCCATCTCTTCAGCAACCAGCTGTGCGGTTTCCTGATCGATAACCTGGTTGATGGTTGCCATTGCGCCCAGTTTCATCATCGCTTTGATGAC > NC_000913/3314728‑3315021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |