| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,015 | IS1 (+) +8 bp | intergenic (‑93/‑505) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1293015 = | 1 (0.010) | 129 (0.990) | 77/518 | 0.3 | 99.2% | intergenic (‑93/‑512) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 4519239 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1293022 | 1 (0.010) | 114 (0.880) | 69/518 | 0.5 | 99.1% | intergenic (‑100/‑505) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AGTTTACGAGTGCGCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1292750‑1293022‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCTTGCCGTAAAACATGGCAACTACAGTTCACTTACACCGCCTCTCAGCCCGGTAAGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTCGGATGTCGCGCCAGTGCACG > NC_000913/4518472‑4518738 GTTTACGAGTGCGCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGT > 1:254321/1‑275 gTACGAGTGCGCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTA < 1:176178/273‑1 TACGAGTGCGCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGT > 3:613497/1‑272 cctCTCTTCAACTTCAGCACCATCCGCGCTTTCTTCTTCTTGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATCTTTCCCGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTCTACATTCTCTTGCCTGCGCACGGAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACT < 4:113148/275‑1 CGCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAA > 3:479989/1‑275 CGCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAA > 3:729791/1‑275 GCTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTA < 2:402056/278‑1 CTCTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAAAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACT > 3:256578/1‑275 CTCTTCAACGTCAGCAGCAGCCGCGCTGTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATGTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCGCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTA < 2:362260/277‑1 CTTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATCTGTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTTACTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTA < 1:639459/275‑1 TTCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTA < 1:247803/274‑1 TCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACATCAACTTCTAATTTTTCCAGCAGTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTCCATTCTCTTGCCTTCGCACTAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGTGTGGTTNGTTGGGATAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGAT < 4:319361/278‑1 TCAACTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACT < 1:361204/275‑1 CTTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:483602/277‑1 TTCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATT < 3:254321/274‑1 TCAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAAGTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTGATCTCAAACTTATATTGAGGTGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAAATCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:503529/272‑1 CAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGATGGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:571634/1‑275 CAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:129495/1‑275 CAGCAGCAGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACT > 1:17639/1‑268 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AGCCGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTTATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:77890/278‑1 ctCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAAGAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTGCAAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTGCAGAATTTTAGTTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGGGCCTTAAATTCAGTTGTGCCATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 3:628423/273‑1 ccgGCTTTCTTCTTTGCGGCGTTCTTTAACAACAACTTCTGATTGTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGGTTCGATTCTTTTGCCTGGGAACGAAGAGTACGGATGTTGGTAAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCGCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAACGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 3:27210/272‑1 CGCGCTTTCTTCTTCGCGACGTTCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 1:479989/275‑1 AACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTACTGATGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCAAT > 2:512656/1‑277 AACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCC < 3:129495/275‑1 ACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTAATGATTTAGTGTAGGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTTGCTTCCCTTTactt > 4:465354/1‑272 CTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGTTGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTC > 1:463160/1‑272 CAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCC < 1:729791/275‑1 CATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTG > 3:600009/1‑274 TTTGTTTCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCTCGAAGAGTACGGTTGTTGTTTAGAAGTTTAAGTGGTTCGCTCATTGTAGTAAACTGTAACTTATATTGGAGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAGTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATGGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTTATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTC < 3:452445/275‑1 TCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCG < 1:600009/275‑1 TCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTGGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCG < 1:405388/275‑1 CCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTAC < 1:226394/275‑1 AGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTG > 1:261422/1‑275 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |