New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 77116 = | 65 (0.860) | 4 (0.050) | 4/252 | NT | 6.2% | coding (184/1656 nt) | sgrR | transcriptional DNA‑binding transcriptional activator of sgrS sRNA |
? | NC_000913 | 77153 = | 58 (0.790) | coding (147/1656 nt) | sgrR | transcriptional DNA‑binding transcriptional activator of sgrS sRNA |
AGATGAGAAACCAGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCGCAGCATTGCCACAGG > NC_000913/76968‑77264 | tatgccatctgctcgtctgcaacaacagttcatccgcctgtggcaatgctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcaggatc < 1:679780‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaCCAGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCg < 4:395946/149‑1 (MQ=255) aaCCAGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGa > 2:606042/1‑149 (MQ=255) aCCAGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGAc > 2:179207/1‑149 (MQ=255) cAGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACtt > 4:498249/1‑149 (MQ=255) aGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTc > 1:126840/1‑149 (MQ=255) gCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCAc < 4:47647/149‑1 (MQ=255) cTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAAAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTcagccag > 4:73733/1‑149 (MQ=255) tttGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTcagccagc > 1:354068/1‑149 (MQ=255) tccgcctgtggcaatgctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcaggatCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTcagccagc > 2:320073‑M1/117‑149 (MQ=255) tGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCcg < 2:354068/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCcgc < 3:242098/149‑1 (MQ=255) gCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGAt > 1:89050/1‑149 (MQ=255) caacTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCa > 1:139595/1‑149 (MQ=255) caacTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCa > 3:185255/1‑149 (MQ=255) aatgctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcatgatcgcg < 4:228876‑M1/4‑1 (MQ=255) aatgctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcaggatcgcg > 3:228876‑M1/105‑108 (MQ=255) aatgctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcaggatCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGAt < 4:355939‑M1/39‑1 (MQ=255) aatgctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcaggatCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGAt > 3:355939‑M1/105‑143 (MQ=255) gctgcgagggtaaatcgcaggacacaacgctcaacgaactggcagcgttattgagctgctcgcgtcgtcatatgcgcaccctgctcaacaccatgcaggatCGCGCCCCACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATgg > 4:400636‑M1/102‑149 (MQ=255) aCCAGTTGATCGATACGATCCTCCTCGAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGTTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGTCTTCCGCTTCCCACGCCCGTCCGCCGCGATCCTGCATGCTGtt < 2:157799/149‑1 (MQ=255) gTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGc < 3:73733/149‑1 (MQ=255) ttGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGAt > 1:562161/1‑131 (MQ=255) ttGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGAt < 2:562161/131‑1 (MQ=255) gATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAgg < 2:126840/149‑1 (MQ=255) tACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTc < 1:393372/103‑1 (MQ=255) tACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTc > 2:393372/1‑103 (MQ=255) tACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTgcgc > 1:227597/1‑149 (MQ=255) tACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTgcgc < 3:667792/149‑1 (MQ=255) gATCCTGCTCCCGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCata > 4:124470/1‑149 (MQ=255) gATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTccc > 2:370148/1‑102 (MQ=255) gATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTccc < 1:370148/102‑1 (MQ=255) aTCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCatat > 4:631441/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCatat < 4:139841/149‑1 (MQ=255) tCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATg < 3:631441/149‑1 (MQ=255) tCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATg > 4:209417/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATga < 1:606042/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATgacga > 4:672082/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTc < 2:317482/91‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTc > 1:317482/1‑91 (MQ=255) cagcagGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGAcgcg > 3:64098/1‑149 (MQ=255) agcagGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGa < 2:139595/149‑1 (MQ=255) cagGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGagc > 1:370612/1‑149 (MQ=255) gTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGagcagc > 4:137889/1‑149 (MQ=255) tCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCt > 4:477034/1‑149 (MQ=255) cTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTc > 3:369525/1‑149 (MQ=255) cccgcTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAAc > 1:120529/1‑149 (MQ=255) ccgcTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACg < 3:672082/149‑1 (MQ=255) ccgcTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACg > 1:497937/1‑149 (MQ=255) cgcTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGc < 1:521720/149‑1 (MQ=255) tGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGc < 3:124470/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGcc > 4:19504/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCg < 4:369525/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGtt < 3:135751/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGa > 2:380972/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGc < 2:120529/149‑1 (MQ=255) cAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCg > 1:299794/1‑149 (MQ=255) aGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGGGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGt > 3:179656/1‑149 (MQ=255) gCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGtt < 3:27157/149‑1 (MQ=255) cGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTtgtg > 1:379223/1‑149 (MQ=255) ataGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCt < 1:170825/149‑1 (MQ=255) taGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTg < 4:64098/149‑1 (MQ=255) gagGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCg > 3:1017/1‑149 (MQ=255) agGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGa > 3:688892/1‑149 (MQ=255) gAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGAtt < 2:497937/149‑1 (MQ=255) tCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTAccc > 4:349586/1‑149 (MQ=255) cAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCt > 4:572786/1‑149 (MQ=255) aGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTc < 3:19504/149‑1 (MQ=255) cgcgAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCgca < 3:137889/149‑1 (MQ=255) gcgAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCgcag > 4:80148/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCgcagca > 2:248962/1‑149 (MQ=255) gCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCGCAGCAtt < 2:51204/149‑1 (MQ=255) tttACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCGCAGCATTGcc > 2:679780/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCGCAGCATTGCCACAg < 3:209417/149‑1 (MQ=255) CGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCGCAGCATTGCCACAgg < 2:414276‑M1/149‑1 (MQ=255) | AGATGAGAAACCAGCATTTGCCGCACAGTCGCTTTGTCGCCAACCAACTGCACCAGTTGATCGATACGATCCTGCTCCAGCAGGTCTTCCGCCCGCTGTTGCTGAAGCGCCAGCCCGGTATAGAGGAATGTCAGACGCGAGCGTTTACCGCGCCCGACTTCCGCTTCCCACGTCAGCCAGCCGCGATCCTGCATGGTGTTGAGCAGGGTGCGCATATGACGACGCGAGCAGCTCAATAACGCTGCCAGTTCGTTGAGCGTTGTGTCCTGCGATTTACCCTCGCAGCATTGCCACAGG > NC_000913/76968‑77264 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |