New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3778171 = | 292 (3.860) | 6 (0.080) | 4/250 | NT | 1.9% | coding (773/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease |
? | NC_000913 | 3778215 = | 348 (4.780) | coding (817/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 403 total aligned reads displayed.
GTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTA > NC_000913/3778067‑3778362 | gTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc > 4:245102/1‑149 (MQ=255) ggCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgt < 1:206061/149‑1 (MQ=255) cGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTc < 2:474439/149‑1 (MQ=255) gTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCg > 1:294240/1‑149 (MQ=255) tCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGt > 1:466659/1‑149 (MQ=255) tCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGt > 2:24304/1‑149 (MQ=255) cGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 2:398798/149‑1 (MQ=255) aggcacgtaacacctgacccgcagtgtaaccggtgtgggccagcgtcatatcaacctgtgacgcccccaaatcaccaaaacggaatacacgCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTa > 3:98921‑M1/92‑141 (MQ=255) aggcacgtaacacctgacccgcagtgtaaccggtgtgggccagcgtcatatcaacctgtgacgcccccaaatcaccaaaacggaatacacgCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGttt > 2:410297‑M1/92‑149 (MQ=255) aggcacgtaacacctgacccgcagtgtaaccggtgtgggccagcgtcatatcaacctgtgacgcccccaaatcaccaaaacggaatacacgCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGttt < 1:410297‑M1/58‑1 (MQ=255) tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtttt > 4:217124/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGTCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTg > 1:395258/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTg > 2:514679/1‑149 (MQ=255) gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGa < 3:287566/149‑1 (MQ=255) gggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTTCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCTGTTTTGGTGAtt > 3:638810/1‑149 (MQ=255) gggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAtt > 1:124690/1‑149 (MQ=255) cggcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg < 3:155783/149‑1 (MQ=255) tCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGc < 4:431638/149‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGt > 3:354294/1‑149 (MQ=255) ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgt < 3:222943/116‑1 (MQ=255) ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTcc < 2:625489/123‑1 (MQ=255) ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCACAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAg < 4:474425/149‑1 (MQ=255) cATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAgg > 4:331014/1‑149 (MQ=255) tCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGtt > 4:678771/1‑149 (MQ=255) 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3:19540/1‑149 (MQ=255) aaaCGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGacac > 1:536235/1‑115 (MQ=255) aaCGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTgg < 2:60353/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGa < 3:77342/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAg < 3:13849/149‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGt > 2:354064/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTAt > 2:253085/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTAt > 3:527400/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTAt > 2:385414/1‑149 (MQ=255) gCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATcc < 3:479399/149‑1 (MQ=255) cAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATccc < 4:172034/149‑1 (MQ=255) tgCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGttt < 1:514679‑M2/147‑1 (MQ=255) | GTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTA > NC_000913/3778067‑3778362 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |