Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,814,164 | G→A | 5.2% | G78D (GGT→GAT) | dut → | deoxyuridinetriphosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,814,164 | 0 | G | A | 5.2% | 1108.0 / 32.5 | 328 | G78D (GGT→GAT) | dut | deoxyuridinetriphosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (150/160); new base A (8/9); total (158/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.57e-01 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
GACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGC > NC_000913/3814017‑3814311 | gACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGt > 1:670464/1‑149 (MQ=255) ttGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATc < 2:333744/149‑1 (MQ=255) ttGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATc > 4:567895/1‑149 (MQ=255) gACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGt > 4:17247/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGGCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTAGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTGCGGACTGGGACATAAGCAGGGTATCGTg > 3:583805/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGc < 4:337914/149‑1 (MQ=255) tGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCtt < 4:663429/149‑1 (MQ=255) tGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCtt < 2:544207/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTg < 2:604438/149‑1 (MQ=255) cGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGATACCGTGCttat < 2:212695/149‑3 (MQ=255) tGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGATACCGTGCttatgt < 3:442024/149‑5 (MQ=255) tGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCCGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCTGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGATACCGTGCttatgt < 1:525304/149‑5 (MQ=255) gCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGATACCGTGCttatgtc < 3:464797/149‑6 (MQ=255) tGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCt < 4:419798/149‑1 (MQ=255) tctcAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTg > 3:531798/1‑140 (MQ=255) tctcAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTgg > 4:231151/1‑149 (MQ=255) tcAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTa > 3:14588/1‑149 (MQ=255) tcAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTa > 1:684989/1‑149 (MQ=255) tcAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTa > 2:241186/1‑149 (MQ=255) acgacgCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGa < 3:171161/149‑1 (MQ=255) gacgCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGAtt < 3:505833/149‑1 (MQ=255) cgCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGa < 4:521294/149‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGAt < 2:228940/149‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGAt < 3:559837/149‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGAt < 3:539301/149‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGAt < 1:333596/149‑1 (MQ=255) aGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGAtt < 2:419489/149‑1 (MQ=255) gAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTc < 4:267753/149‑1 (MQ=255) aCTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTg < 1:36787/149‑1 (MQ=255) tGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTTGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTACGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGAc > 4:535868/1‑149 (MQ=255) tGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTGGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGAc > 1:449042/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCAGTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATc > 1:593587/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATc > 3:12707/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATc > 4:15856/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATc > 4:610011/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATc > 4:83121/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATc < 1:173770/149‑1 (MQ=255) tCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGATACCGTGCttat > 4:555930/1‑115 (MQ=255) ccGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCa < 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tACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtga < 1:248386/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtgat < 1:46285/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtgat < 4:407280/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtgatga > 1:18504/1‑149 (MQ=255) gCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtgatga > 1:632005/1‑149 (MQ=255) ttCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTcc > 1:101718/1‑149 (MQ=255) ttCCGACCGGGCTGGCGATTCAGATTGCCGATTCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTcc < 3:218607/149‑1 (MQ=255) ccGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgt < 2:577474/149‑1 (MQ=255) ccGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgt < 3:487729/149‑1 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt < 3:92690/149‑1 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt > 3:260296/1‑149 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt > 4:454556/1‑149 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt < 1:221292/149‑1 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGAATTCCgtgt < 3:637290/149‑1 (MQ=255) ggCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTg > 2:506506/1‑149 (MQ=255) gCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTgg < 1:557306/149‑1 (MQ=255) gCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTgg > 3:415584/1‑149 (MQ=255) ttCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGAt < 3:297696/97‑1 (MQ=255) tCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTg > 2:51891/1‑143 (MQ=255) cATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGa < 2:651925/149‑1 (MQ=255) atatTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAGCCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGAc > 4:497164/1‑149 (MQ=255) atatTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGAc > 2:691855/1‑149 (MQ=255) tatTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACa > 4:222301/1‑149 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGc > 3:678426/1‑149 (MQ=255) aTCGTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCTGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTTGTAACTTGGTAGGAATTATCGATTCTGACTATCATGGCTAGTAGATGATATCCGTGTTGAACCGTGGTCAGGACAGGTTGAcc > 2:174101/1‑149 (MQ=255) aTCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCAcc < 2:122310/149‑1 (MQ=255) aTCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCAcc < 1:296782/149‑1 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGTCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGACAGGACAGCTTCACCAtt > 4:314458/1‑149 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAg > 1:428452/1‑134 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCAtt > 1:203954/1‑149 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCAtt > 2:645047/1‑149 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCAtt < 2:101925/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAAcc < 1:28454/149‑1 (MQ=255) gcggcAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTg > 1:58266/1‑148 (MQ=255) gcAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGa > 4:36286/1‑149 (MQ=255) gatgCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAg > 4:114892/1‑118 (MQ=255) gatgCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCa < 1:506506/149‑1 (MQ=255) gctgcCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCg < 4:260296/149‑1 (MQ=255) cTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTCCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAgatga < 1:13652/149‑1 (MQ=255) tNCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAgatgat > 3:183128/1‑149 (MQ=255) tCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGccc < 2:265631/142‑1 (MQ=255) tCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGccc > 1:265631/1‑142 (MQ=255) tCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAgatgat > 4:287333/1‑149 (MQ=255) tCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAgatgat > 3:687171/1‑149 (MQ=255) cGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGAttt < 2:585308/149‑1 (MQ=255) gATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGAttttt > 2:672522/1‑149 (MQ=255) gATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGAttttt < 3:36286/149‑1 (MQ=255) ggACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTc > 1:567206/1‑148 (MQ=255) caaGCACGATACCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgtag > 3:3324/2‑149 (MQ=255) caaGCACGATACCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgtag > 2:7969/2‑149 (MQ=255) aaGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgtagt > 3:646510/1‑149 (MQ=255) aGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgtagta > 1:53743/1‑149 (MQ=255) aGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgtagta > 4:64877/1‑149 (MQ=255) gCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAgat > 1:645229/1‑129 (MQ=255) gCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgt > 3:105855/1‑144 (MQ=255) ggTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGc < 2:445059/149‑1 (MQ=255) | GACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGC > NC_000913/3814017‑3814311 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |