| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3779138 | 378 (3.820) | 19 (0.200) | 13/248 | NT | 5.0% | coding (85/777 nt) | lldR | dual role activator/repressor for lldPRD operon |
| ? | NC_000913 | = 3779144 | 374 (4.020) | coding (91/777 nt) | lldR | dual role activator/repressor for lldPRD operon | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3778983‑3779138‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcgggcaACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTATA < NC_000913/3779144‑3778997 CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA < 1:717102/149‑1CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA < 3:184058/149‑1CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA < 4:10429/149‑1CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA < 4:75542/149‑1CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA > 4:411860/1‑149CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA > 4:128192/1‑149CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA > 1:461089/1‑149CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCCGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAA < 3:838462/149‑1 TGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAG > 2:236704/1‑149 TGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAG > 1:769455/1‑149 TGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCGTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAG > 2:264730/1‑149 GATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGC > 3:223143/1‑149 GATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGC > 4:851632/1‑149 ATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCG > 1:113086/1‑149 TCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG > 2:544878/1‑149 TCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG > 3:109529/1‑149 TCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG < 2:700426/149‑1 TCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG < 2:461089/149‑1 TCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG < 2:526347/149‑1 TCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG < 4:23063/149‑1 CTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGG < 3:97472/149‑1 CTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGG < 2:769455/149‑1 CTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGG > 2:783849/1‑149 CTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACAAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGG < 1:675895/149‑1 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 3:83993/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 4:866790/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 2:496933/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 4:770456/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 1:217365/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 2:89271/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 1:510621/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 2:143457/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 3:125042/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 1:645650/1‑149 TTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCGTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGC > 2:201655/1‑149 TCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCA > 1:763422/1‑149 ACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAAC > 4:262751/1‑149 TGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGGTTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCG < 4:870305/149‑1 GGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCT < 1:644698/149‑1 GGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCT < 2:101094/149‑1 GGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCT < 3:31859/149‑1 GGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCT < 3:314213/149‑1 GGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCG > 1:16766/1‑131 GGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCG < 2:16766/131‑1 GCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTT < 2:240336/149‑1 CGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTC < 3:262751/149‑1 GTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCC < 2:614882/149‑1 GTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCC < 2:394225/149‑1 GTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCC > 1:394225/1‑149 TGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGGTCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCA < 1:722846/149‑1 TGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCA < 4:834234/149‑1 GATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAG < 1:861543/149‑1 TTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG < 3:577878/109‑1 TTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGG > 4:577878/1‑109 CCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAG > 2:309962/1‑91 CCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAG < 1:309962/91‑1 AAAAAAACCTGGAAGCGGGCATGAAGTTGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAA < 3:467892/132‑1 AAAAAAACCTGGAAGCGGGCATGAAGTTGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAA > 4:467892/1‑132 AAAACCTGGAAGCGGGCATGAAGTTGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGA < 1:841743/131‑1 AAAACCTGGAAGCGGGCATGAAGTTGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGA > 2:841743/1‑131 AGCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCC > 4:28109/1‑149 GCGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCACGTTTTTTTCCTCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTGAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCC < 4:742854/149‑1 CGGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCA < 1:678152/149‑1 GGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCAC > 3:128192/1‑149 GGGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCAC > 4:192322/1‑149 GGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACT < 1:443846/149‑1 GGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACT > 1:104592/1‑149 GGCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACT > 1:848963/1‑149 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA < 2:842881/149‑1 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA > 3:871649/1‑149 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA < 2:531514/149‑1 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA > 1:302053/1‑149 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA > 1:215228/1‑149 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA > 3:215939/1‑149 GCAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTA > 1:120147/1‑149 CAACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTAT > 3:115818/1‑149 AACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTATA > 3:303957/1‑149 AACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTATA > 1:574091/1‑149 AACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTATA < 2:2592/149‑1 CTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3778983‑3779138‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcgggcaACTTCATGCCCGCTTCCAGGTTTTTTTCATCAATCAGCGCCCGCACACGATCGGCAACCTCGTCTGACAGGCGTCTGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGCCCACTATA < NC_000913/3779144‑3778997 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |