Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,462,028 | 0 | G | A | 6.3% | 368.0 / 9.1 | 111 | G379D (GGT→GAT) ‡ | paaJ | 3‑oxoadipyl‑CoA/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA thiolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/50); new base A (3/4); total (57/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGT > NC_000913/1461883‑1462176 | gtACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGACCGTTACGc < 3:276341/149‑1 (MQ=255) ctccgcgAATTGGGACTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCGACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTACCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCGTGAGCTGCAACGGCGTAACGACCGTTACGccga < 4:543781/146‑4 (MQ=255) ctacGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGACCGTTACGccga < 2:587594/149‑4 (MQ=255) gcgAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc > 4:215428/1‑149 (MQ=255) gcgAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc > 2:513685/1‑149 (MQ=255) gcgAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGACTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc > 2:742130/1‑149 (MQ=255) gcgAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCACGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc > 1:638648/1‑149 (MQ=255) gAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCAc > 1:682986/1‑149 (MQ=255) 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gCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCa > 4:74164/1‑149 (MQ=255) tGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATc < 1:615994/149‑1 (MQ=255) cTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGgt > 1:146628/1‑149 (MQ=255) tgatgaTGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGgtg > 1:505285/1‑149 (MQ=255) gatgatGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGgtgt > 3:244951/1‑149 (MQ=255) atgatgCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTc < 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aaCCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCAt > 2:518691/1‑149 (MQ=255) ccccCACGGAGGCGCTATCGCCTTAAGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCCCCTGGCACTGGCTTCGCGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCACTGTGCACCGTGAGCATCGATGTCGGTCAGGGCACCGACATGa < 2:569299/149‑1 (MQ=255) ccccAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGa > 3:755286/1‑149 (MQ=255) cccAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGAt > 4:226240/1‑149 (MQ=255) cccAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGAt > 2:554584/1‑149 (MQ=255) 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tGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGa > 4:381409/1‑149 (MQ=255) ccagccaTGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGAcc > 4:219856/1‑149 (MQ=255) gccaTGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGa < 2:363366/149‑1 (MQ=255) caTGAGCTGCAACGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTAGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGAtt > 4:606308/1‑149 (MQ=255) aTGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTg < 1:327799/149‑1 (MQ=255) aGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGGCCCGATTGaaa < 2:816261/149‑1 (MQ=255) aGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGGCCCGATTGaaa > 1:816261/1‑149 (MQ=255) aGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGaaa < 1:742130/149‑1 (MQ=255) gCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACcgc < 1:59499/149‑1 (MQ=255) gCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACcgc < 4:321085/149‑1 (MQ=255) aatgCGTAACGACCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGAtt > 2:119747/4‑138 (MQ=255) aatgCGTAACGACCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGAtt < 1:119747/135‑1 (MQ=255) aatgCGTAACGACCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTc > 3:598655/4‑149 (MQ=255) cGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCt < 1:164352/149‑1 (MQ=255) atgCGTAACGACCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCt > 4:185499/3‑149 (MQ=255) gCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTAc < 2:582052/99‑1 (MQ=255) gCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTAc > 1:582052/1‑99 (MQ=255) gCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGt > 1:132743/1‑149 (MQ=255) gTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtg > 2:605514/1‑149 (MQ=255) cGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCTTATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtgatga < 4:755286/149‑1 (MQ=255) cGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTtgatga < 3:390604/149‑1 (MQ=255) ggTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAg > 3:711724/1‑149 (MQ=255) gTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGt < 3:219856/149‑1 (MQ=255) | TTGGGTGTACTACGCGAATTGGGGCTGCCTGATGATGCCCCACATGTTAACCCCAACGGAGGCGCTATCGCCTTAGGCCATCCGTTGGGAATGAGTGGTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGCACCATGTGCATCGGTGTCGGTCAGGGCATCGCCATGATTCTGGAGCGTGTTTGAGCATATCAACCTGCGAGTACCCTACAATGATAACCAATACAAAGCTTGACCCGATTGAAACCGCGTCTGTTGATGAGT > NC_000913/1461883‑1462176 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |