Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,672,640 | G→T | 7.0% | Q198H (CAG→CAT) ‡ | hcaD → | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,672,640 | 0 | G | T | 7.0% | 339.9 / 12.6 | 100 | Q198H (CAG→CAT) ‡ | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/45); new base T (3/4); total (51/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTC > NC_000913/2672493‑2672785 | tATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAgg < 2:728972/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTCTCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGgt < 3:565670/149‑1 (MQ=255) gCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCCTGCTGgtgg < 4:150828/149‑2 (MQ=255) ggAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCACACCAGCCTGCTGgtggcg < 4:449278/149‑4 (MQ=255) aaCTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTCTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCa < 1:514118/149‑1 (MQ=255) aCTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCAt > 3:682172/1‑149 (MQ=255) cTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCAtt > 1:347146/1‑149 (MQ=255) tATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTc > 1:801731/1‑149 (MQ=255) aTTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCt < 1:834810/149‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTg > 3:794274/1‑149 (MQ=255) tCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCa > 4:207688/1‑149 (MQ=255) cTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATTCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaa < 2:284472/149‑1 (MQ=255) tGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaat > 1:289297/1‑149 (MQ=255) tGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaat > 1:706636/1‑149 (MQ=255) tGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGAGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGCTGTGCGCATTCTGCTCaat > 4:92801/1‑149 (MQ=255) gAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaataa > 2:546741/1‑149 (MQ=255) gAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaataa > 2:420486/1‑149 (MQ=255) gAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCaataa > 3:16002/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGcc > 4:697484/1‑149 (MQ=255) gCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCAt < 1:756490/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGaa > 2:796479/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGaa < 2:4347/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGaa < 4:347879/149‑1 (MQ=255) ccACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACAtgtg > 1:184338/1‑149 (MQ=255) cACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTgg > 4:191875/1‑149 (MQ=255) cACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTgg > 4:643674/1‑149 (MQ=255) cgcagcgcagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTc < 4:794274/149‑1 (MQ=255) cagcgcagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGa < 1:483289/149‑1 (MQ=255) agcgcagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGAt < 2:555731/149‑1 (MQ=255) agcgcagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGAt < 3:86350/149‑1 (MQ=255) cgcagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATgg < 2:289297/149‑1 (MQ=255) gcagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGt > 1:504317/1‑149 (MQ=255) cagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTg < 4:191779/149‑1 (MQ=255) aTGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGaaa > 4:522976/1‑149 (MQ=255) gTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑GACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGaaaaa < 4:559037/149‑1 (MQ=255) aaGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGt > 1:374161/1‑149 (MQ=255) aGGTGATAGTGATTGACCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTCATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCCGCAGGCTGGTGTGCGAATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAGAAGTa < 4:156818/149‑1 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGc > 2:391918/1‑108 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGc < 1:391918/108‑1 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTa < 2:191126/149‑1 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTa < 2:801731/149‑1 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCATGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTa < 2:252656/149‑1 (MQ=255) gTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGa > 1:829273/1‑149 (MQ=255) gACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAAc < 3:196368/149‑1 (MQ=255) gACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAAc < 3:161480/149‑1 (MQ=255) aGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGa > 2:106163/1‑149 (MQ=255) gATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGc < 3:655953/149‑1 (MQ=255) ttGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTg > 4:669865/1‑149 (MQ=255) aCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCaaa < 4:447758/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCaaa > 1:305566/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGt < 1:546741/149‑1 (MQ=255) ggcggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTg < 3:218204/149‑1 (MQ=255) gcggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTgg > 1:533615/1‑149 (MQ=255) cggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTggg < 1:219554/149‑1 (MQ=255) aaCCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGaaa > 1:108500/1‑149 (MQ=255) aaCCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGaaa > 3:141252/1‑149 (MQ=255) cGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGaaa > 1:606289/1‑116 (MQ=255) atcggCCGGAATGCACCACCGCGCGAGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTTGTGTGCGCCTTCTGCTCAGTAATGCCGTGGAACATGTGGGCGATGGTGAAAAGGTAGAACGGAGGCTGCTAGGAGGTGAAAGGCttta > 4:685274/4‑147 (MQ=255) aTGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCa > 3:813771/1‑149 (MQ=255) aTGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCa < 1:443911/149‑1 (MQ=255) aTGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCa < 1:420486/149‑1 (MQ=255) aTGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTACCTTCTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGTCGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCa < 2:675509/149‑1 (MQ=255) gggCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAgg > 2:406847/1‑149 (MQ=255) gCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCt < 4:525569/149‑1 (MQ=255) gCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCt > 3:249650/1‑149 (MQ=255) gTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGAt > 3:8125/1‑149 (MQ=255) tGCACCACCGGCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtgg < 1:538594/149‑1 (MQ=255) tGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtgg < 2:376226/149‑1 (MQ=255) tGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtgg < 2:41922/149‑1 (MQ=255) gCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtggt < 4:229805/149‑1 (MQ=255) accaccGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGa > 3:405194/1‑149 (MQ=255) ccaccGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGAt < 1:796479/149‑1 (MQ=255) caccGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGAtt > 1:433132/1‑149 (MQ=255) accGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGAttt > 1:560934/1‑149 (MQ=255) accGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGAttt > 1:146234/1‑149 (MQ=255) cGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTAc < 3:669865/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACg < 4:405194/149‑1 (MQ=255) gTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTAt < 1:58413/149‑1 (MQ=255) tGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTAtt > 1:670879/1‑149 (MQ=255) gCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTg < 2:533615/149‑1 (MQ=255) aaCGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACg > 2:368420/1‑141 (MQ=255) aaCGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACg < 1:368420/141‑1 (MQ=255) aaCGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGt > 2:829491/1‑149 (MQ=255) aaCGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGt > 3:800376/1‑149 (MQ=255) aCGCTATCTTTTGCAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTAACGGTATTGGTa < 2:132714/149‑1 (MQ=255) tCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCCGGTGTGCGCATGCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAgcg > 4:228992/1‑149 (MQ=255) ttttACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGTGAATTCTGCTCAATAATGCCATTGAAAATGTCGACGATTGTGAAAAAGTAGAACTGACACCGCAAAGGGGCGCAACGCTTAAAGCTGATGTGGTGCTTTAAGGCATTCGTATCAGCGcc > 1:105887/1‑149 (MQ=255) gcgc‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGc > 1:227021/1‑149 (MQ=255) gcgc‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGc > 2:671212/1‑149 (MQ=255) gcacaccaGCCTGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTg > 4:47836/4‑91 (MQ=255) gcacaccaGCCTGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTg < 3:47836/88‑1 (MQ=255) gcacaccaGCCTGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGa < 1:383451/115‑1 (MQ=255) gcacaccaGCCTGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGa > 2:383451/4‑118 (MQ=255) acaccaGCCTGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAAc > 2:261995/2‑149 (MQ=255) caccaGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACt > 3:507916/1‑149 (MQ=255) accaGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGc < 3:256771/103‑1 (MQ=255) accaGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGc > 4:256771/1‑103 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTgg < 4:698970/149‑1 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGCTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACCCTGCAAAGCGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTgg > 4:620868/1‑149 (MQ=255) gcagGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTc < 3:272455/149‑1 (MQ=255) | TATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTC > NC_000913/2672493‑2672785 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |