Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,044,330 | C→G | 5.4% | A223A (GCC→GCG) | bglA → | 6‑phospho‑beta‑glucosidase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,044,330 | 0 | C | G | 5.4% | 318.3 / 8.1 | 93 | A223A (GCC→GCG) | bglA | 6‑phospho‑beta‑glucosidase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/49); new base G (3/2); total (42/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.24e-01 |
CCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCGAT > NC_000913/3044191‑3044477 | ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCgaca < 4:13141/149‑4 (MQ=255) ttCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaa > 2:620707/1‑149 (MQ=255) tCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaaa < 2:15081/149‑1 (MQ=255) tCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaaa < 3:689359/149‑1 (MQ=255) aCGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCt < 1:748804/149‑1 (MQ=255) aCGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCt > 3:774736/1‑149 (MQ=255) aCGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCt > 3:770650/1‑149 (MQ=255) gAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTgc > 3:163265/1‑149 (MQ=255) gAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTgc < 4:618814/149‑1 (MQ=255) gAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTgc > 2:799670/1‑149 (MQ=255) aaTTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTgcgc < 1:595372/149‑1 (MQ=255) aacCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTCTACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCAt > 2:387393/1‑149 (MQ=255) aacCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCg > 1:616265/1‑129 (MQ=255) aacCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCg < 2:616265/129‑1 (MQ=255) ccAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTa > 2:466103/1‑149 (MQ=255) tAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCgg > 2:52954/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGga < 4:163265/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGga < 4:881296/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGga < 4:488657/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGgag < 3:327282/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGgaga < 1:838537/149‑1 (MQ=255) ggCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATg < 4:669787/149‑1 (MQ=255) gCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGa > 4:720416/1‑149 (MQ=255) gTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGaaa < 1:853193/149‑1 (MQ=255) gTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGaaa < 2:730314/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTca < 4:376126/149‑2 (MQ=255) aCCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCg < 1:249380/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGTTCGGTGACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGACGCCAGCGCCCTGGCGGTGAACGCTGCGCGTCGCATTAGCCCGGAGATGAAAGTCg < 2:636525/149‑1 (MQ=255) ttCGGTTCCTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAACCCCGGAAGAGACGCTGTATCAGGTGCTGCATCACCAGGTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTAt > 1:828610/1‑149 (MQ=255) ttCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGaaa < 4:8729/138‑1 (MQ=255) ttCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGaaa > 3:8729/1‑138 (MQ=255) tgctgcTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaaa > 1:64304/1‑99 (MQ=255) tgctgcTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaaa < 2:64304/99‑1 (MQ=255) tgctgcTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGAt > 4:356523/1‑149 (MQ=255) gctgctCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATg > 1:716218/1‑149 (MQ=255) tgctCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGt < 2:22130/149‑1 (MQ=255) gctCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTg < 3:247715/149‑1 (MQ=255) gctCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTg < 1:60368/149‑1 (MQ=255) tCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGcc > 1:34218/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGc < 4:601982/149‑1 (MQ=255) ggtgTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATc < 4:221914/149‑1 (MQ=255) gtgtATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATcc < 2:547312/149‑1 (MQ=255) gtATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCtt > 4:7222/1‑149 (MQ=255) ataCCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTAc > 1:367381/1‑149 (MQ=255) cGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCt < 3:309535/149‑1 (MQ=255) aGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGt < 2:874280/149‑1 (MQ=255) aTGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGga > 3:37456/1‑94 (MQ=255) aTGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGga < 4:37456/94‑1 (MQ=255) aTGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAAc > 4:12166/1‑149 (MQ=255) aTGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAAc > 2:375993/1‑149 (MQ=255) aTGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAAc > 1:582874/1‑149 (MQ=255) tGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAAcc > 4:420135/1‑149 (MQ=255) aaCCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGa < 1:193987/149‑1 (MQ=255) aaCCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGa < 1:209074/149‑1 (MQ=255) ccGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACga > 2:819175/1‑149 (MQ=255) cGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACgat < 2:771449/149‑1 (MQ=255) aaGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACgatgtg < 3:171082/149‑1 (MQ=255) agagACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTGTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACgatgtga < 1:52954/149‑1 (MQ=255) agagACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACgatgtga < 2:562987/149‑1 (MQ=255) aCGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGtt > 3:179063/1‑149 (MQ=255) gATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCg > 1:556600/1‑149 (MQ=255) aTGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGACAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGCGATGAAAGACCGCGGGATGCTGGCGATGGTGCCGCGCTATCCCTACTCCTGTAACCCGCACGATGTGATGTTCGc < 2:828610/149‑1 (MQ=255) tATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCa < 2:512104/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAg < 2:34218/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAg < 2:430010/149‑1 (MQ=255) tCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCa < 2:681341/147‑1 (MQ=255) tCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCa > 1:681341/1‑147 (MQ=255) tCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAgg > 3:298033/1‑149 (MQ=255) tCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAgg > 2:411216/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACgatgtga > 1:690226/1‑136 (MQ=255) cAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACgatgtga < 2:690226/136‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGa < 2:556600/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGa < 4:392809/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGt < 3:527452/149‑1 (MQ=255) tgctgcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCg < 2:319525/149‑1 (MQ=255) gctgcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGa > 3:806127/1‑149 (MQ=255) gctgcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGa < 2:649518/149‑1 (MQ=255) gcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATgc > 1:633890/1‑149 (MQ=255) tCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGcgcg > 4:746037/1‑149 (MQ=255) cACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAATCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGCACGATGTGATGTTCGCTCAGAAGTCGATGCGCGa > 2:298676/1‑149 (MQ=255) ccAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGa < 3:279934/114‑1 (MQ=255) ccAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGa > 4:279934/1‑114 (MQ=255) ccAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAAc > 3:673978/1‑149 (MQ=255) cAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACg > 3:134803/1‑149 (MQ=255) ctttcaccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGc > 1:184277/8‑149 (MQ=255) tttGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTa > 2:159387/1‑149 (MQ=255) ttGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTAc < 3:168876/149‑1 (MQ=255) caccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACg > 4:449017/4‑149 (MQ=255) gTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGt > 2:41974/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTc < 2:582874/149‑1 (MQ=255) ccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTAc > 4:125542/2‑146 (MQ=255) ccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTAc < 3:125542/145‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCtt < 1:799670/149‑1 (MQ=255) cccTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCGAt < 2:10425/149‑1 (MQ=255) | CCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCGAT > NC_000913/3044191‑3044477 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |