Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 464,356 | 0 | A | T | 5.5% | 381.6 / 8.1 | 109 | intergenic (+48/‑46) | ybaV/fadM | putative competence‑suppressing periplasmic helix‑hairpin‑helix DNA‑binding protein/long‑chain acyl‑CoA thioesterase III |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/56); new base T (3/3); total (50/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CGAAGAGTACGGTCCGTTTAAAACTGTGGAGGATCTAAAGCAGGTGCCGGGGATGGGCAATTCGCTGGTGGAACGTAATCTGGCGGTATTAACCCTGTAATTAATTTGCATAGTGGCAATTTTTTGCCAGACTGAAGAGGTCATACCAGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTGGGATGGGT > NC_000913/464209‑464504 | cgAAGAGTACGGTCCGTTTAAAACTGTGGAGGATCTAAAGCAGGTGCCGGGGATGGGCAATTCGCTGTTGGAACGTAATCTGGCCGTAATAACCCTGTAATTAATTTGCATAGTGGCAATTTTTTGCCAGACTAAAGAGGTCATACCAg < 4:569119/149‑1 (MQ=255) gAAGAGTACGGTCCGTTTAAAACTGTGGAGGATCTAAAGCAGGTGCCGGGGATGGGCAATTCGCTGGTGGAACGTAATCTGGCGGTATTAACCCTGTAATTAATTTGCATAGTGGCAATTTTTTGCCAGACTGAAGAGGTCATACCAGt < 3:54640/149‑1 (MQ=255) gagTACGGTCCGTTTAAAACTGTGGAGGATCTAAAGCAGGTGCCGGGGATGGGCAATTCGCTGGTGGAACGTAATCTGGCGGTATTAACCCTGTAATTAATTTGCATAGTGGCAATTTTTTGCCAGACTGAAGAGGTCATACCAGTTAt < 1:773022/149‑1 (MQ=255) 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agGTCATAACTGGTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGc > 1:498005/1‑149 (MQ=255) gTCATACCAGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTg > 2:833073/1‑149 (MQ=255) gTCATACCAGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTg > 2:420211/1‑149 (MQ=255) cATACCAGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTggg < 3:667363/149‑1 (MQ=255) aTACCAGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTGGGa < 1:573823/149‑1 (MQ=255) 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aGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTGGGATGGGt < 4:81839/149‑1 (MQ=255) | CGAAGAGTACGGTCCGTTTAAAACTGTGGAGGATCTAAAGCAGGTGCCGGGGATGGGCAATTCGCTGGTGGAACGTAATCTGGCGGTATTAACCCTGTAATTAATTTGCATAGTGGCAATTTTTTGCCAGACTGAAGAGGTCATACCAGTTATGACCTCTGTACTTATAACAACAACGTAAGGTTATTGCGCTATGCAAACACAAATCAAAGTTCGTGGATATCATCTCGACGTTTACCAGCACGTCAACAACGCCCGCTACCTTGAATTTCTCGAAGAAGCCCGCTGGGATGGGT > NC_000913/464209‑464504 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |