| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3726014 | 968 (4.020) | 6 (0.020) | 5/516 | 17.8 | 0.62% | coding (128/996 nt) | wecH | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA) |
| ? | NC_000913 | 3726018 = | 953 (3.960) | coding (132/996 nt) | wecH | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 959 total aligned reads displayed.
TATTATTTATATCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAGCGCAATCGCACTGCTCTACATTGCGCTGTTTACCTCCATCAATATGGAGTTAGCGCTGAAAAACCTGCTGCAAAAGCCAGTGTTTTACCACTTGTGGTTTTTCTTCGCGATTGCGGTGATTTATCTGGTTTCACCGCTGATTCAGG > NC_000913/3725743‑3726292 | tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGCATAATGCTCATAGTTTTAGCCACGTCACATGGGATATGCCCATTGTTCTg > 3:1174680/1‑275 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGATCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCACTGTTCTg > 1:10149/1‑275 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGAGTGTTTAATGGAGGTGATTATTAACACCACTACCTGGTAACTTACCAAGTCTCATAGTTTTACCCCCGTCCAATGGGTTATGCCCAATGTTCTCACTTc > 4:1060295/1‑280 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGAAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGGGATGATTCACACTCCTACCTGGTTTGTGACCAATGCTCATTGTTTTTGTCCCTTCACTTGGGCTATCGCCAGTGTTCTg > 3:1313120/1‑275 (MQ=255) tGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTTTGCctct > 1:1222327/1‑274 (MQ=255) gCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCAAACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTGGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGGATTCTGCCTCCCgt > 1:472873/1‑275 (MQ=255) gATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCg < 2:724706/279‑1 (MQ=255) ttCCTTAAGACTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCa < 2:984705/280‑1 (MQ=255) ttataATCTTAAGTTATGAAAATCAGGTTAGTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGGCAGACTTTTTTTACCCAGATACAGCGGAACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGGTAACCTGCGGGGGATAGCGTGTTTTATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGAttt < 3:567231/273‑1 (MQ=255) tataAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGTTTCACACCACTACCTGGTATTTGACCAATGCTATTAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGTTATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCACCGTGCCGCTATTTTTCTTGATTTcc > 1:876214/1‑275 (MQ=255) tataAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTTTGAATTCTTCCCCTCGGTTCAGCTTGCCCCTTTTTTTcttcttttctgccta > 4:80829/1‑266 (MQ=255) tataAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTcc > 1:764132/1‑275 (MQ=255) tGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTTTTTTTCATGATTTCCGGCTac > 3:1334473/1‑273 (MQ=255) tcgTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCTAATGATTTATCGGTAAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAAATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATACTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGATTTCTGCCTCTCGTGTCAGTGTGCCCTTATTTTTATTGAttttccgtctttt > 3:1044116/3‑264 (MQ=255) aGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCTTCACATGGGATATCGCCAATCTTCTGCATTCGTCACGTCGTGTCATCGTGCGGGCATTTTTCCTTCTTTTCGGCTTTCTCttttt > 4:340538/1‑279 (MQ=255) aGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTTTCAGCCTGCCGGTATTTTTCATGATTTCCGGCTAtctc > 3:186874/1‑274 (MQ=255) 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gttattGCAGGGCGACAACCAAATAAGTTATCGGTAAGACTTTTTTTAAGCAGATAAAGAGAAAAAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCTGGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGcc < 4:655028/279‑1 (MQ=255) ttCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGc < 2:938608/280‑1 (MQ=255) tCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGCTTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCCATGACCATAGTGTTAGCACCGTCACATGGGAACACGCCACTGTGCTGAATTCTGCCTCCCGTGTCATCGTGCCCCTATTTTCTCTGATTTCAGGCAATCTCTGTTTTTGCGCACTCacggg > 3:809357/1‑270 (MQ=255) 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cTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTc < 3:718693/275‑1 (MQ=255) aTACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTTTGGCTATCTCTTTTTTTGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTCCTTTCGTATCGGCTTATGTCTGTTTTTTTATAGCGTaa > 2:1021546/1‑279 (MQ=255) aTACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAg < 3:1105971/274‑1 (MQ=255) 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agagACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAGCGCAATCGCa < 2:904761/280‑1 (MQ=255) agaCACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGTCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAGCGCAATc > 1:910580/1‑275 (MQ=255) agaCACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAGAGCaacc > 3:347292/1‑273 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |