| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,048,430 | 0 | A | G | 6.5% | 293.4 / 8.5 | 92 | W88R (TGG→CGG) ‡ | gfcC | putative O‑antigen capsule production periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/48); new base G (4/2); total (42/50) | |||||||||||
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2:156564/127‑1 (MQ=255) tcAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGtt > 1:155366/1‑127 (MQ=255) tcAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGtt < 2:155366/127‑1 (MQ=255) tcAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACAtt > 1:416675/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACAttt > 2:659445/1‑149 (MQ=255) acagcttGCTTCCTGGGAAGCAGAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCg < 1:177601/118‑1 (MQ=255) acagcttGCTTCCTGGGAAGCAGAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACAtt > 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gcttGCTTCCTGGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCa > 4:76487/4‑149 (MQ=255) tCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCAc > 2:209638/1‑149 (MQ=255) tCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCAc < 4:88683/149‑1 (MQ=255) cttGCTTCCTGGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCAc > 3:594515/3‑149 (MQ=255) ttCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTcgcc > 1:423471/1‑61 (MQ=255) ttCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTcgcc < 2:423471/61‑1 (MQ=255) ccAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCaa > 4:463148/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAAc < 2:474677/149‑1 (MQ=255) aGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACg > 3:353687/1‑149 (MQ=255) aGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACg > 3:244699/1‑149 (MQ=255) | CCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACG > NC_000913/1048282‑1048578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |