Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 100,158 | C→T | 5.8% | P172L (CCG→CTG) | murG → | N‑acetylglucosaminyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 100,158 | 0 | C | T | 5.8% | 320.5 / 5.2 | 98 | P172L (CCG→CTG) | murG | N‑acetylglucosaminyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/45); new base T (4/2); total (51/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
TTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAG > NC_000913/100011‑100304 | ttCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCg > 3:449774/1‑149 (MQ=255) ttCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCg > 4:681944/1‑149 (MQ=255) aTGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgcag > 3:465205/1‑149 (MQ=255) aCAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAAc < 4:532807/149‑1 (MQ=255) aaaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGTGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGtt < 4:600057/149‑1 (MQ=255) aaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGttt > 2:80755/1‑149 (MQ=255) aaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGttt < 1:614017/149‑1 (MQ=255) aCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTATTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTg > 1:96931/1‑149 (MQ=255) cGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTgg < 1:735040/149‑1 (MQ=255) gCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGAGATTTCCCTAATGAGGAAGAAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTAGTCGTGaa > 4:591482/1‑149 (MQ=255) cTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAg < 1:403297/149‑1 (MQ=255) ttAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAgg > 1:546642/1‑149 (MQ=255) tAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGt < 3:489328/149‑1 (MQ=255) cAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCgg > 3:451945/1‑149 (MQ=255) cAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCgg > 1:653939/1‑149 (MQ=255) cAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCgg > 3:237606/1‑149 (MQ=255) cAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCgg > 3:198981/1‑149 (MQ=255) cAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCgg > 1:252779/1‑149 (MQ=255) aaTAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGt > 1:641376/1‑149 (MQ=255) tAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTc < 3:32972/149‑1 (MQ=255) aaaTGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCg < 3:667361/149‑1 (MQ=255) aaaGGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCg < 1:80755/149‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCgt < 1:499256/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCgtg > 2:302129/1‑149 (MQ=255) gctggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGc < 4:48042/149‑1 (MQ=255) gctggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGc > 3:513217/1‑149 (MQ=255) gctggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGc < 4:744141/149‑1 (MQ=255) tGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAgtgggtg < 2:333981/149‑1 (MQ=255) tGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAgtgggtg < 1:112581/149‑1 (MQ=255) tGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTACAGGTGCTTTCCCTAATGCGGCAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAgtgggtg < 4:449774/149‑1 (MQ=255) ccaccaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGggtggt > 2:55336/1‑149 (MQ=255) accaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTTATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtc > 4:551317/1‑149 (MQ=255) accaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtc < 2:653939/149‑1 (MQ=255) accaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtc > 1:671686/1‑149 (MQ=255) accaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtc > 3:97019/1‑149 (MQ=255) accaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtc < 4:237606/149‑1 (MQ=255) aaaGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCa < 2:563848/149‑1 (MQ=255) aaGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAg < 1:549682/149‑1 (MQ=255) aGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAgg < 1:625867/149‑1 (MQ=255) gTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCTGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAggg > 1:427068/1‑149 (MQ=255) cAGGCGTTTCCAGGTGCCTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGcgcacg > 1:512604/1‑149 (MQ=255) cGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCAtt < 2:483340/149‑1 (MQ=255) gTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGAGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTc < 4:192797/149‑1 (MQ=255) tttCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCt < 2:252779/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCt < 3:397061/88‑1 (MQ=255) tCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCt > 4:397061/1‑88 (MQ=255) cttgTGCTGTCCCTCATGCGGAAGTCGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGCTGGCGCTTCCGTTGACGGAACAACGTTTGGTTGGACGTGGAGGTCCGCTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTAATCCGGGCACACGCCTTCTTAAc < 2:456660/146‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc > 1:384190/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc > 3:200470/1‑149 (MQ=255) ggTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCa < 4:200470/149‑1 (MQ=255) gCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCt < 1:39098/140‑1 (MQ=255) gCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCt > 2:39098/1‑140 (MQ=255) cTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACa > 3:707697/1‑149 (MQ=255) ccTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGcc > 1:493993/1‑149 (MQ=255) ccTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGcc > 3:45051/1‑149 (MQ=255) cTAATGCAGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTgg > 3:727477/1‑102 (MQ=255) cTAATGCAGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTgg < 4:727477/102‑1 (MQ=255) tAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGc < 4:465205/149‑1 (MQ=255) aaTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCa < 4:513217/149‑1 (MQ=255) tGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAgg > 2:242253/1‑149 (MQ=255) gCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTc < 1:411753/88‑1 (MQ=255) gCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTc > 2:411753/1‑88 (MQ=255) ggAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtg > 1:729766/1‑149 (MQ=255) ggAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtg > 3:562025/1‑149 (MQ=255) aaGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtgct > 1:372959/1‑149 (MQ=255) aaGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtgct < 3:230628/149‑1 (MQ=255) gtagtGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtgctgc < 4:244556/149‑1 (MQ=255) gtagtGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtgctgc > 3:797/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |