| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,844,985 | C→A | 7.0% | A341D (GCC→GAC) | adeD → | cryptic adenine deaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,844,985 | 0 | C | A | 7.0% | 304.8 / 5.6 | 91 | A341D (GCC→GAC) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/47); new base A (5/2); total (42/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
ATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCC > NC_000913/3844841‑3845130 | aTGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGc < 1:245644/145‑1 (MQ=255)aTGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGc > 2:245644/1‑145 (MQ=255) tGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGata < 4:287380/149‑1 (MQ=255) aaGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATc < 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aTCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGtt < 1:687772/149‑1 (MQ=255) aTCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGGCACCAGCTGGTCGATGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTTGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGtt > 3:592089/1‑149 (MQ=255) tCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTg > 4:661804/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCg < 2:386035/138‑1 (MQ=255) aTGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCg > 1:386035/1‑138 (MQ=255) gCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGa > 1:255924/1‑149 (MQ=255) cTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATg > 1:532494/1‑149 (MQ=255) ttAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATgc > 3:337275/1‑149 (MQ=255) aaTTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATgcgc < 1:80621/149‑1 (MQ=255) aaTTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATgcgc < 1:189693/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGtt < 1:479998/136‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGtt > 2:479998/1‑136 (MQ=255) gccgccTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAg < 3:200817/149‑1 (MQ=255) cTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAATCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCAc > 4:618741/1‑149 (MQ=255) tGATCGAACAACACAATGCGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACg > 3:350735/1‑149 (MQ=255) gATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACgg > 1:222408/1‑149 (MQ=255) tCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTg > 1:282864/1‑149 (MQ=255) aacaacACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTgcag > 1:352139/1‑149 (MQ=255) aacaacACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTgcag < 4:173272/149‑1 (MQ=255) aacaCAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGcagcag < 1:723386/149‑1 (MQ=255) acacAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAgg < 3:240708/149‑1 (MQ=255) acacAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAgg > 4:67527/1‑149 (MQ=255) acaATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTa > 1:279564/1‑149 (MQ=255) caATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTAc < 2:529417/149‑1 (MQ=255) aTGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGtt > 4:666655/1‑112 (MQ=255) aTGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGtt < 3:666655/112‑1 (MQ=255) aTGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTg < 2:425658/149‑1 (MQ=255) tgtgCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGACAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTgg < 2:90972/149‑1 (MQ=255) gtgCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGt < 1:258357/149‑1 (MQ=255) cGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGaaa < 3:661804/149‑1 (MQ=255) gCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAg < 2:185071/149‑1 (MQ=255) 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tatCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGa > 1:136310/1‑149 (MQ=255) cgcgTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATgc < 2:222408/149‑1 (MQ=255) gcgTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTgg > 2:485950/1‑126 (MQ=255) gcgTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTgg < 1:485950/126‑1 (MQ=255) gcgTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATgcg > 4:146721/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCaaa < 3:67527/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAg < 2:406520/126‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAg > 1:406520/1‑126 (MQ=255) gTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTCCTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCCTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGATACTGGTGAAAGGCGa > 3:469602/1‑123 (MQ=255) gTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGa < 4:469602/123‑1 (MQ=255) cGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCg > 2:357703/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGaa < 4:273759/149‑1 (MQ=255) 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cTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAAtccgctccgc < 4:58899/149‑1 (MQ=255) tGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCatat > 1:573789/1‑149 (MQ=255) ggCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGGTGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATg > 1:485984/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCa > 2:611390/1‑149 (MQ=255) cccGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCaa < 2:391069/149‑1 (MQ=255) cccGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCaa > 4:474895/1‑149 (MQ=255) ccGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAACCCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGCGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAac < 2:279564/149‑1 (MQ=255) tcaacAGGACGATATCGGCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCa > 4:137991/5‑149 (MQ=255) tcaacAGGACGATATCGGCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCa > 3:204059/5‑149 (MQ=255) tacAGGACGATATCGGCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGTAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAAtccgc > 1:725987/3‑127 (MQ=255) aacAGGACGATATCGGCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCTGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCAtt > 1:39785/3‑149 (MQ=255) aacAGGACGATATCGGCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGGCTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCAtt > 2:200186/3‑149 (MQ=255) aacAGGACGATATCGGCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAAtccgc < 2:725987/125‑1 (MQ=255) aGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCATAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCAtt < 2:470246/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTg < 2:282864/149‑1 (MQ=255) aGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGcc > 4:678393/1‑149 (MQ=255) | ATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTACTGGTGAAAGGCGAGCCGATTGATGCGCAAACCTTACAGGCGGAAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCC > NC_000913/3844841‑3845130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |