New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1907965 | 53 (0.820) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.4% | intergenic (‑374/+296) | yobF/yebO | DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
? | NC_000913 | = 1907969 | 55 (0.900) | intergenic (‑378/+292) | yobF/yebO | DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
TTCAGTTGTTCCAGGCCAGTGGGAGAAGTTATTACATAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGGGGTAAATATCTTTTTCTG > NC_000913/1907817‑1908113 | ttCAGTTGTTCCAGGCCAGTGGGAGAAGTTATTACATAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCC > 3:247770‑M1/1‑149 (MQ=255) aGTTGTTCCAGGCCAGTGGGAGAAGTTATTACATAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCaa > 4:403163/1‑149 (MQ=255) gttgttCCAGGCCAGTGGGAGAAGTTATTACATAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCaaa < 3:535389/149‑1 (MQ=255) 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gagaAGTTATTACATAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTaaaa < 3:150118/149‑1 (MQ=255) taCATAGTGCGTGCAATATCGCATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAAt < 3:481956/149‑1 (MQ=255) aTAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATaa < 3:187688/139‑1 (MQ=255) aTAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATaa > 4:187688/1‑139 (MQ=255) aTAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATtga > 3:70152/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) attaCCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAAt < 3:435947/149‑1 (MQ=255) attaCCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAAt > 1:31365/1‑149 (MQ=255) attaCCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAAt > 1:433869/1‑149 (MQ=255) ttaCCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAAtt > 4:71070/1‑149 (MQ=255) cccTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAAt < 2:433869/149‑1 (MQ=255) ccTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGttt < 2:260832/88‑1 (MQ=255) 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ctttggggattgacttctctttagggtaattaatagccgttaactgactgttttatgagaaaaagtgatataactttttattcattgcatagcaaaaaatgtgatattgcacgcactatgtaataacttctcccactggcctggaacaa < 1:28416‑M1/149‑149 (MQ=255) ccAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACTTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGGGGTAAATATCTTTTTCTg > 4:338630/1‑149 (MQ=255) ccAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGGGGTAAATATCTTTTTCTg > 1:403605/1‑149 (MQ=255) | TTCAGTTGTTCCAGGCCAGTGGGAGAAGTTATTACATAGTGCGTGCAATATCACATTTTTTGCTATGCAATGAATAAAAAGTTATATCACTTTTTCTCATAAAACAGTCAGTTAACGGCTATTAATTACCCTAAAGAGAAGTCAATCCCCAAAGGGATTGTAAATTTAAAATAAGAAAAATTGATGAATGAGCAAAAAAATCAAGAGAGAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGGGGTAAATATCTTTTTCTG > NC_000913/1907817‑1908113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |