New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3085963 | 71 (1.090) | 4 (0.070) | 3/244 | NT | 5.5% | coding (89/132 nt) | yqgB | uncharacterized protein |
? | NC_000913 | = 3085970 | 72 (1.180) | coding (82/132 nt) | yqgB | uncharacterized protein |
TTCCTGGGAGCTCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGAAACCACGAGAAAA > NC_000913/3085819‑3086110 | ttCCTGGGAGCTCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGGAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTg > 3:322642/1‑149 (MQ=255) cTGGGAGCTCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGaa > 2:197227/1‑149 (MQ=255) ggAGCTCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAActg < 3:315228‑M2/149‑4 (MQ=255) gCTCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGttccaggctgcga < 2:338986‑M1/149‑14 (MQ=255) tCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGttccaggctgcgata < 1:133387‑M1/149‑16 (MQ=255) tCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAActgcgata < 2:159174‑M2/149‑9 (MQ=255) ttGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATaaca > 3:452786/1‑149 (MQ=255) tGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATaacaa < 2:172437/149‑1 (MQ=255) cAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAAcc < 4:452786/149‑1 (MQ=255) aCCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCa > 3:541348/1‑149 (MQ=255) aCCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCa > 4:343804/1‑149 (MQ=255) cctcctGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCAt < 4:322642/149‑1 (MQ=255) cctcctGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCAt > 2:542175/1‑149 (MQ=255) cctcctGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACAAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCAt > 2:353316/1‑149 (MQ=255) ctcctGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATa > 1:335676/1‑149 (MQ=255) aTGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACAt < 4:315228/149‑1 (MQ=255) ggAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATgg > 4:418487/1‑149 (MQ=255) gAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGa < 3:48855/149‑1 (MQ=255) 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acCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCcagcag > 1:310276/1‑149 (MQ=255) ccGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAActgcga < 3:418887‑M2/115‑7 (MQ=255) ccGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAActgcga > 4:418887‑M2/1‑109 (MQ=255) cGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTGAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTg > 3:254957/1‑149 (MQ=255) tgtTCGCCCGCTGATGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGaa < 1:20768/149‑1 (MQ=255) tgtTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGaa > 4:451423/1‑149 (MQ=255) tgtTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGaa < 1:584708/149‑1 (MQ=255) cccGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGa < 1:30610/149‑1 (MQ=255) cGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACg > 3:265197/1‑149 (MQ=255) cGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACg > 1:206353/1‑149 (MQ=255) aGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTg > 3:98298/1‑149 (MQ=255) 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aCCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAAc < 4:541348/149‑1 (MQ=255) ccATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCg > 3:10589/1‑149 (MQ=255) ccATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCg > 3:295769/1‑149 (MQ=255) tAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGtt > 2:579893/1‑149 (MQ=255) aGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGttt < 3:343804/149‑1 (MQ=255) 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ttaAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAg > 4:432753/1‑149 (MQ=255) ttaAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAg > 2:111362/1‑149 (MQ=255) taAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGTTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAgt < 3:403417/149‑1 (MQ=255) taAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAgt < 3:451423/149‑1 (MQ=255) aaGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAgtg > 1:228817/1‑149 (MQ=255) 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aCGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGaaa < 4:295769/149‑1 (MQ=255) aCTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGAAACCa > 2:581124/1‑149 (MQ=255) tATCGCAGttccaggctgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctgacgacatgtctatgggtttgccttcgtcagcgggcgaacacggtgtactacgctccatgcaggaggttgcaatga < 2:159174‑M1/149‑142 (MQ=255) tATCGCAGCCTGGAActgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctgacgacatgtctatgggtttgccttcgtcagcgggcgaacacggtgtactacgctccatgcaggaggttgcaatga < 1:133387‑M2/149‑135 (MQ=255) tATCGCAGCCTGGAActgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctga > 4:36701‑M2/1‑15 (MQ=255) tATCGCAGCCTGGAActgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctga < 3:36701‑M2/75‑61 (MQ=255) tATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGAAACCACg > 2:22541/1‑149 (MQ=255) tCGCAGttccaggctgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctgacgacatgtctatgggtttgccttcgtcagcgggcgaacacgg < 3:418887‑M1/115‑110 (MQ=255) tCGCAGttccaggctgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctgacgacatgtctatgggtttgccttcgtcagcgggcgaacacgg > 4:418887‑M1/1‑6 (MQ=255) tCGCAGCCTGGAActgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctgacgacatgtctatgggtttgccttcgtcagcgggcgaacacggtgtactacgctccatgcaggaggttgcaatgagc < 2:338986‑M2/149‑137 (MQ=255) tCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGc < 1:448797/138‑1 (MQ=255) tCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGc > 2:448797/1‑138 (MQ=255) gCAGCCTGGAATTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGAAACCACGAGaa > 3:377864/1‑149 (MQ=255) cAGttccaggctgcgatagtcgttaactgttttacacttaataaaataatttgaggttcgctatgtctgacgacatgtctatgggtttgccttcgtcagcgggcgaacacggtgtactacgctccatgcaggaggttgcaatgagctcc < 3:315228‑M1/149‑147 (MQ=255) aGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGAAACCACGAGaaaa < 1:111362/149‑1 (MQ=255) | TTCCTGGGAGCTCATTGCAACCTCCTGCATGGAGCGTAGTACACCGTGTTCGCCCGCTGACGAAGGCAAACCCATAGACATGTCGTCAGACATAGCGAACCTCAAATTATTTTATTAAGTGTAAAACAGTTAACGACTATCGCAGCCTGGAACTGCGATAACAACCCATAAGCACATGGATTTTCCAGCAGTGAATGCTGACGCTCCAACTGCGCAACCGGTTTCTTTTTCATAACATTATTAAGCACATAACCGAACGTAAGTGTGAAAGTTCGGCGAAACCACGAGAAAA > NC_000913/3085819‑3086110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |