New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3890165 | 78 (1.200) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 4.0% | intergenic (+20/‑71) | tnaA/tnaB | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent/tryptophan transporter of low affinity |
? | NC_000913 | = 3890174 | 73 (1.220) | intergenic (+29/‑62) | tnaA/tnaB | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent/tryptophan transporter of low affinity | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGT > NC_000913/3890019‑3890313 | caTATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATaa < 4:271059/149‑1 (MQ=255) caTATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATaa < 4:178821/149‑1 (MQ=255) atGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGa < 4:569011/149‑1 (MQ=255) tGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAt < 3:514832/149‑1 (MQ=255) gACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGt < 4:522666/149‑1 (MQ=255) gACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGt > 2:417382/1‑149 (MQ=255) aCTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTt > 2:130990‑M2/1‑148 (MQ=255) aCTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTt < 2:154582‑M2/149‑2 (MQ=255) cTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTta > 4:454981‑M2/1‑147 (MQ=255) cTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTta > 4:120400‑M2/1‑147 (MQ=255) ttCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTtag < 4:16754‑M2/149‑4 (MQ=255) tCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTtagc < 4:217755‑M2/149‑5 (MQ=255) attattGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTtagcca < 4:42808‑M2/149‑7 (MQ=255) ttattGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTtagccac < 4:259167‑M2/149‑8 (MQ=255) tGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCActctc < 4:382147/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCtt > 3:358763/1‑149 (MQ=255) aGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTa < 3:259167/149‑1 (MQ=255) gCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAc > 3:217583/1‑149 (MQ=255) cTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAccc > 2:500385/1‑149 (MQ=255) tttAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCt > 1:564337/1‑149 (MQ=255) tgAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCaa < 2:212025/149‑1 (MQ=255) gAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAAt > 3:162678/1‑149 (MQ=255) aaaGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATa < 2:513580/149‑1 (MQ=255) aaGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATaa < 4:326407/149‑1 (MQ=255) gagaACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACa > 3:175971/1‑149 (MQ=255) gcggcgAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATa < 2:331098/149‑1 (MQ=255) gcggcgAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATa < 3:453406/149‑1 (MQ=255) cggcgAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAg < 4:162678/149‑1 (MQ=255) gAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCtt > 4:410983/1‑149 (MQ=255) aaTATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTc < 1:244237/149‑1 (MQ=255) tatTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCct < 3:217755/149‑1 (MQ=255) atTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGcc < 2:40023/143‑1 (MQ=255) atTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGcc > 1:40023/1‑143 (MQ=255) ttAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCctct > 3:38233/1‑149 (MQ=255) ttAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCctct > 3:172234/1‑149 (MQ=255) aaGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTaaa > 4:184868/1‑149 (MQ=255) aaGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTaaa > 3:198897/1‑149 (MQ=255) aaGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGCTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTaaa > 4:182726/1‑149 (MQ=255) aGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTCCATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAg < 1:206387/149‑1 (MQ=255) gATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGt < 3:129521/149‑1 (MQ=255) ccTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGcatc > 3:121345/1‑149 (MQ=255) cTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGcatca > 3:558329/1‑149 (MQ=255) tacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagccactctgta > 1:296021‑M1/1‑71 (MQ=255) tacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagccactctgta < 2:296021‑M1/93‑23 (MQ=255) acgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTtagcca > 4:40170‑M2/1‑79 (MQ=255) acgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACCTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTtagcca < 3:40170‑M2/85‑7 (MQ=255) aaCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCaa < 4:217583/149‑1 (MQ=255) cGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCt < 4:74524/149‑1 (MQ=255) gAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTg > 3:54877/1‑149 (MQ=255) gAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTg > 3:501966/1‑149 (MQ=255) gAAAGTATTGCGTCACTCCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCGACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTg > 2:426055/1‑149 (MQ=255) aaaGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGa > 1:557739/1‑149 (MQ=255) tGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAg < 4:261249/149‑1 (MQ=255) gTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCAc > 1:17188/1‑149 (MQ=255) tCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCAct > 3:111532/1‑149 (MQ=255) cACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCActc > 3:502089/1‑149 (MQ=255) ttCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGc > 2:311345/1‑149 (MQ=255) ttCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGc > 4:209155/1‑149 (MQ=255) ttCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGc > 2:428199/1‑149 (MQ=255) gCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTg < 3:184868/149‑1 (MQ=255) cAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTgg < 4:558329/149‑1 (MQ=255) aaaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTggg < 3:257440/149‑1 (MQ=255) aaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTgggg > 2:583880/1‑149 (MQ=255) cTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGgtgt > 3:246396/1‑149 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGACATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGtt > 1:506640/1‑149 (MQ=255) ttAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGtt > 4:51440/1‑149 (MQ=255) agaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATgg < 4:38233/149‑1 (MQ=255) agaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATgg > 1:196357/1‑149 (MQ=255) agaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCGCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATgg < 1:238636/149‑1 (MQ=255) agaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACACTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTAGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATgg < 3:409360/149‑1 (MQ=255) tttAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTtata < 1:79760/149‑1 (MQ=255) tttAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTtata < 4:111532/149‑1 (MQ=255) aattaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCCCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCa < 2:520860/149‑1 (MQ=255) attaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACaa < 3:180001/64‑1 (MQ=255) attaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACaa > 4:180001/1‑64 (MQ=255) attaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAg < 4:175971/149‑1 (MQ=255) ttaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAgg < 4:406698/149‑1 (MQ=255) tacAGAGTGGCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgta > 1:296021‑M2/1‑22 (MQ=255) tacAGAGTGGCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgta < 2:296021‑M2/93‑72 (MQ=255) agagTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAAtt < 4:198897/149‑1 (MQ=255) gTGGCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataa < 4:259167‑M1/149‑143 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGAt > 1:376248/1‑86 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGAt < 2:376248/86‑1 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATc < 1:360275/87‑1 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATc > 2:360275/1‑87 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCa > 3:113466/1‑103 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCa < 4:113466/103‑1 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATtggt < 3:89066/149‑1 (MQ=255) tGGCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaggttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgt < 3:40170‑M1/85‑80 (MQ=255) tGGCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataat < 4:42808‑M1/149‑144 (MQ=255) tGGCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgt > 4:40170‑M1/1‑6 (MQ=255) ggCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATtggtgg < 3:209155/149‑1 (MQ=255) gCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatga < 4:217755‑M1/149‑146 (MQ=255) gCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatga < 1:457516‑M2/149‑137 (MQ=255) cTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatgaa < 4:16754‑M1/149‑147 (MQ=255) tAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatgaag > 4:454981‑M1/1‑2 (MQ=255) tAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatgaag > 4:120400‑M1/1‑2 (MQ=255) ataAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGt > 3:465550/1‑149 (MQ=255) aacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatgaagt > 2:130990‑M1/1‑1 (MQ=255) aacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatgaagt < 2:154582‑M1/149‑149 (MQ=255) | ACATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGT > NC_000913/3890019‑3890313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |