New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3973794 = | 82 (1.260) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 4.9% | coding (187/882 nt) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
? | NC_000913 | 3973807 = | 75 (1.190) | coding (200/882 nt) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTC > NC_000913/3973646‑3973940 | aagccctgaccgaagaagatgttatcgcccagcaccagacaagaaggttcaccattaaggaaggtttcaccgatgataaaggcctgcgccagaccgtccgggctgggctgttcggcatattccagctggataccgaactcactaccatc > 4:231038‑M1/149‑149 (MQ=255) cATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCc‑t > 1:492782/1‑149 (MQ=255) aTCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGTTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCc‑tg > 3:202552/1‑149 (MQ=255) tCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCc‑tgc > 2:424526/1‑149 (MQ=255) cgaagaagatgttatcgcccagcaccagacaagaaggttcaccattaaggaaggtttcaccgatgataaaggcctgcgccagaccgtccgggctgggctgttcggcatattccagctggataccgaactcactaccatCGCC‑TGCTggg < 3:556255‑M1/11‑1 (MQ=255) aCGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGGAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGa < 4:286611/149‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGAt < 2:34164/149‑1 (MQ=255) gcgcgGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATg > 4:206016/1‑149 (MQ=255) gcgcgGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATg < 3:213961/149‑1 (MQ=255) gcggcgTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGt > 1:28641/1‑149 (MQ=255) cggcgTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTa < 3:436365/149‑1 (MQ=255) atgttatcgcccagcaccagacaagaaggttcaccattaaggaaggtttcaccgatgataaaggcctgcgccagaccgtccgggctgggctgttcggcatattccagctggataccgaactcactaccatCGCC‑TGCTGGGCGATGGTa > 4:556255‑M1/131‑149 (MQ=255) gcgTATAGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGACGGTAGt > 4:140278/1‑149 (MQ=255) atcgcccagcaccagacaagaaggttcaccattaaggaaggtttcaccgatgataaaggcctgcgccagaccgtccgggctgggctgttcggcatattccagctggataccgaactcactaccatc > 3:542872‑M1/126‑126 (MQ=255) atcgcccagcaccagacaagaaggttcaccattaaggaaggtttcaccgatgataaaggcctgcgccagaccgtccgggctgggctgttcggcatattccagctggataccgaactcactaccatc < 4:542872‑M1/1‑1 (MQ=255) gAAGCAACTGTTGCCGATTTAGGACAAGCTCATGACTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGATATCCCCGAACTTCTCGTCACCACTACGCCGGAAGATAAAGGTGATTTCCGGCTTC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCg > 4:362765/1‑149 (MQ=255) gAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCg > 2:95744/1‑149 (MQ=255) aaGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTa < 3:529674/139‑1 (MQ=255) aaGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTa > 4:529674/1‑139 (MQ=255) aGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGt < 2:585847/149‑1 (MQ=255) gCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTa > 2:311639/1‑149 (MQ=255) aaCTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATc < 4:160953/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGc < 1:42420/149‑1 (MQ=255) ttGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCCGCt < 4:306073/149‑1 (MQ=255) ttGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCt < 4:405174/149‑1 (MQ=255) gCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTgg < 1:109636/149‑1 (MQ=255) cGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGaa > 3:204602/1‑149 (MQ=255) gATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAat > 3:140331/1‑149 (MQ=255) ttACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATg > 1:65270/1‑149 (MQ=255) ttACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATg > 2:429780/1‑149 (MQ=255) gATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGa > 1:87266/1‑113 (MQ=255) gATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGa < 2:87266/113‑1 (MQ=255) gATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGa > 3:475673/1‑149 (MQ=255) aTAAGCCAATGATTTAGTATCCGCTGTCGGTGCTGATGTTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGTCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGaa > 2:476901/1‑149 (MQ=255) aTAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGaa < 3:563909/149‑1 (MQ=255) tAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTa > 1:280943/1‑116 (MQ=255) tAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTa < 2:280943/116‑1 (MQ=255) aaGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAca < 1:264006/149‑1 (MQ=255) aaGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAca < 2:84458/149‑1 (MQ=255) ccAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagcc > 4:301213/1‑149 (MQ=255) ccAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagcc < 1:577275/149‑1 (MQ=255) aaTGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagccca < 3:215296/149‑1 (MQ=255) aaTGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagccca > 3:435661/1‑149 (MQ=255) aaTGATTTACTATCCCCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagccca > 4:433087/1‑149 (MQ=255) aTGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAata < 3:355304/134‑1 (MQ=255) aTGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAata > 4:355304/1‑134 (MQ=255) tATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACgg > 4:577297/1‑149 (MQ=255) aTCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGt > 3:195380/1‑149 (MQ=255) cGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTg > 4:560713/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAg < 1:32502/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAg > 1:250060/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAgg > 3:521388/1‑149 (MQ=255) gCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCt < 1:424526/149‑1 (MQ=255) gATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGa > 2:475622/1‑87 (MQ=255) gATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGa < 1:475622/87‑1 (MQ=255) tGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatcatc < 1:58985/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatcatc > 1:92953/1‑149 (MQ=255) gaccgtccgggctgggctgttcggcatattccagctggataccgaactcactaccatCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGa < 2:464424‑M1/23‑1 (MQ=255) tATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGaaa < 2:10030/149‑1 (MQ=255) tATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGaaa > 1:10030/1‑149 (MQ=255) cgcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAatat < 1:258862/93‑1 (MQ=255) cgcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAatat > 2:258862/1‑93 (MQ=255) cgcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcctt < 3:206016/149‑1 (MQ=255) gcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttc > 1:381368/1‑149 (MQ=255) gcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttc < 3:433087/149‑1 (MQ=255) gcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttc > 2:84072/1‑149 (MQ=255) cgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcc < 4:204602/149‑1 (MQ=255) cgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcc < 3:301213/149‑1 (MQ=255) cgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcc < 2:381368/149‑1 (MQ=255) gAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcct < 4:475673/149‑1 (MQ=255) ttCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAAt < 4:140331/149‑1 (MQ=255) ttCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAAt < 1:311639/149‑1 (MQ=255) ttCTCATCATCACTACGCAGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGTTGGTAGTTAGTTCGGTATCCAGATGGAATATGCCGAACATCCCAGCCCGGATGGTGTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAAt > 4:47815/1‑149 (MQ=255) catcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTg > 1:405947/1‑149 (MQ=255) catcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCAGGAATATGCCGAACAGCTCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTACCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTg < 3:362765/149‑1 (MQ=255) atcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGa > 2:205447/1‑149 (MQ=255) tcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 4:126582/1‑149 (MQ=255) tcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 4:431055/1‑149 (MQ=255) tcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 2:578432/1‑149 (MQ=255) tcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCAAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACct > 4:338340/1‑149 (MQ=255) aCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 2:492782/149‑1 (MQ=255) aCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 3:406428/149‑1 (MQ=255) tACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttctt < 2:28641/149‑1 (MQ=255) aCGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTg > 2:103375/1‑149 (MQ=255) aaGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCTAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGc > 4:449402/1‑149 (MQ=255) aaGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGc > 1:178452/1‑149 (MQ=255) gTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGAt < 2:65270/149‑1 (MQ=255) tcactaccatCGCCCAGCAGG‑CGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTc < 1:464424‑M1/70‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAAc > 2:124445/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAt < 1:280096/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtc < 3:431055/149‑1 (MQ=255) aGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtcttc < 2:178452/149‑1 (MQ=255) | ATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCC‑TGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTC > NC_000913/3973646‑3973940 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |