| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1612087 | 49 (0.760) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.8% | coding (239/360 nt) | yneG | DUF4186 family protein |
| ? | NC_000913 | = 1612092 | 49 (0.810) | coding (234/360 nt) | yneG | DUF4186 family protein | |||||
CGTTTTCCGCAATTCTCATGGCTGATTCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGATGACTGGCGCGCCTTTCTCCAG > NC_000913/1611951‑1612235 | cGTTTTCCGCAATTCTCATGGCTGATTCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGgtcgcgg > 1:287548‑M2/1‑142 (MQ=255) ttttCCGCAATTCTCATGGCTGATTCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTAGCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTg < 1:102689/149‑1 (MQ=255) ttttCCGCAATTCTCATGGCTGATTCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATTACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGGGACAGCAGGTCGCGGTg > 2:240327/1‑149 (MQ=255) ccGCAATTCTCATGGCTGATTCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGt < 3:367353/149‑1 (MQ=255) ttCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGgtcgcggt > 1:346029‑M2/1‑117 (MQ=255) ttCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGgtcgcggt < 2:346029‑M2/125‑9 (MQ=255) tCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCt < 4:435793/132‑1 (MQ=255) tCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCt > 3:435793/1‑132 (MQ=255) aTCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATg > 1:23907/1‑149 (MQ=255) aTCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATg > 3:26980/1‑149 (MQ=255) cagccagTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATgg > 1:469543/1‑149 (MQ=255) tccagTGATAGATTACCGCCACGATATAATGTTGTTGTTCTTCGCTTAAGGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGAGAACCGCGACATCAGGTCGTGGTGGCGTGCTGAGTGATAAACACTGAATGCCCGCGCATgtgg < 2:287450/148‑1 (MQ=255) gccagTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATgggg < 3:86142/149‑1 (MQ=255) gTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGttt < 3:160421/149‑1 (MQ=255) gATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGc < 2:314382/149‑1 (MQ=255) tAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCtt > 3:410175/1‑149 (MQ=255) tAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCtt < 4:314227/149‑1 (MQ=255) aTTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGgt < 3:296940‑M2/92‑3 (MQ=255) aTTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGgt > 4:296940‑M2/1‑90 (MQ=255) ttACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCg > 3:6084/1‑149 (MQ=255) ccACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTAc > 4:134812/1‑141 (MQ=255) ccACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTAc < 3:134812/141‑1 (MQ=255) ccACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTa < 4:26980/149‑1 (MQ=255) ccACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTa > 4:197626/1‑149 (MQ=255) ccACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTACTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTa < 3:262116/149‑1 (MQ=255) cACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAg > 2:260323/1‑149 (MQ=255) gATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCg < 1:228837/149‑1 (MQ=255) gttgttgttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGcc < 3:197626/149‑1 (MQ=255) gttgttgttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGcc > 4:272243/1‑149 (MQ=255) gttgttgttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGcc > 3:6152/1‑149 (MQ=255) gttgttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGa < 1:67252/149‑1 (MQ=255) gttgtgCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGa > 4:146362/1‑149 (MQ=255) ttgttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAg > 2:132485/1‑149 (MQ=255) gttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACCTGCTgtcgcggttgtctggct < 3:116961‑M2/82‑18 (MQ=255) gttCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACCTGCTgtcgcggttgtctggct > 4:116961‑M2/1‑65 (MQ=255) ttcGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGAc > 4:170226/1‑149 (MQ=255) ttcGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGAc > 3:292684/1‑149 (MQ=255) cTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGATAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGttt < 2:475795/149‑1 (MQ=255) aaCGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGc > 2:396396/1‑149 (MQ=255) gAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGAc < 1:458612/149‑1 (MQ=255) aaaCACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACa > 2:448143/1‑149 (MQ=255) acCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAAt > 1:579980/1‑149 (MQ=255) cTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCTGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATccg > 3:293970/1‑149 (MQ=255) gAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCa > 3:220547/1‑149 (MQ=255) tATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCCAGAc < 2:356265/120‑1 (MQ=255) tATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGAc > 1:356265/1‑120 (MQ=255) aTGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATgttgtt > 3:67174/1‑149 (MQ=255) cACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGAt < 1:260323/149‑1 (MQ=255) cACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGAt < 4:300133/149‑1 (MQ=255) cACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGAt < 4:292684/149‑1 (MQ=255) aGACAACCGCGACAGCAGgtcgcggttgtctggctaagtggcataacattccgcagggtgtttcgttaagcgaaga < 3:160680‑M2/76‑59 (MQ=255) aGACAACCGCGACAGCAGgtcgcggttgtctggctaagtggcataacattccgcagggtgtttcgttaagcgaaga > 4:160680‑M2/1‑18 (MQ=255) aGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGcc > 4:7415/1‑87 (MQ=255) aGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGcc < 3:7415/87‑1 (MQ=255) aGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAg < 4:458429/112‑1 (MQ=255) aGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAg > 3:458429/1‑112 (MQ=255) aCAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGATGACTGgcgcgc < 4:6152/149‑1 (MQ=255) cAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAGGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTGCGATGACTGGCGCGcc < 4:67174/149‑1 (MQ=255) aCAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGATGACTGgcgcgc > 1:402349/1‑140 (MQ=255) aCAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGATGACTGgcgcgc < 2:402349/140‑1 (MQ=255) cagcagGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGATGACTGGCGCGCCTTTCTCCAg < 1:240327/149‑1 (MQ=255) agGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTc > 1:574052/1‑121 (MQ=255) agGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTc < 2:574052/121‑1 (MQ=255) | CGTTTTCCGCAATTCTCATGGCTGATTCATCTGTACAACCAGCCAGTGATAGATTACCGCCACGATATAACGTTGTTGTTCTTCGCTTAACGAAACACCCTGCGGAATGTTATGCCACTTAGCCAGACAACCGCGACAGCAGGTCGCGGTGGCGTGCTGAGCGATAAACACCGGATGCCCGCGCATGGGGGTTTGCTTACCGTCATTAGCCGGTAATGCCGGAGCAAGACGTTTAGCGACAAAATCCGCCGCATGTTGTTCGATGACTGGCGCGCCTTTCTCCAG > NC_000913/1611951‑1612235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |