| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,482,839 | C→G | 7.4% | L167F (TTG→TTC) | emrK ← | multidrug resistance efflux pump membrane fusion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,482,839 | 0 | C | G | 7.4% | 279.5 / 11.9 | 81 | L167F (TTG→TTC) | emrK | multidrug resistance efflux pump membrane fusion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/40); new base G (4/2); total (39/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
AACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCAC > NC_000913/2482695‑2482984 | aaCCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATg > 2:46209/1‑149 (MQ=255)aaCCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATg < 3:546212/149‑1 (MQ=255) aCCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGc < 3:7142/149‑1 (MQ=255) ggACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGc > 3:320581/1‑149 (MQ=255) ggACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGc > 1:302559/1‑149 (MQ=255) ctctTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCttt < 2:443147/149‑1 (MQ=255) ctTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTGAATGCCGCtatcc < 3:301562/149‑5 (MQ=255) ttAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCt > 3:343535/1‑149 (MQ=255) ttAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCt > 2:331383/1‑149 (MQ=255) ttAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCt < 1:553043/149‑1 (MQ=255) ttAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCt < 4:312630/149‑1 (MQ=255) aaTATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTAc > 3:369484/1‑149 (MQ=255) atatCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACt < 3:208740/149‑1 (MQ=255) ccGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACttatt < 1:46209/149‑1 (MQ=255) cGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACttatta > 3:125478/1‑149 (MQ=255) gTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTaa > 4:67782/1‑149 (MQ=255) tACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAAc < 2:399591/149‑1 (MQ=255) tAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCt > 3:214057/1‑149 (MQ=255) gcgcCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTg < 4:112167/149‑1 (MQ=255) cgcCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATACGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTgg > 1:18225/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGc < 4:125478/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCt < 3:435327/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTATTGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTcc > 4:220704/1‑149 (MQ=255) gCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAg > 1:117142/1‑149 (MQ=255) cttcttTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGc < 4:189033/149‑1 (MQ=255) ttcttTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCg > 4:299489/1‑149 (MQ=255) ttAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTc > 2:75547/1‑149 (MQ=255) aGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTAc > 4:209047/1‑113 (MQ=255) aGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTAc < 3:209047/113‑1 (MQ=255) gTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCttt > 1:505695/1‑149 (MQ=255) gTTGCATCCGCCGATTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCttt < 4:370546/149‑1 (MQ=255) ttGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCtttt < 1:11498/149‑1 (MQ=255) ttGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCtttt < 3:67782/149‑1 (MQ=255) ttGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCtttt > 2:509075/1‑149 (MQ=255) gCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTgg < 2:505695/149‑2 (MQ=255) aTCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGaaa < 4:158881/149‑1 (MQ=255) cgccgcTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATaa < 2:213670/149‑1 (MQ=255) cgccgcTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATaa < 2:117142/149‑1 (MQ=255) gccgcTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAAc < 3:485900/111‑1 (MQ=255) gccgcTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAAc > 4:485900/1‑111 (MQ=255) gccgcTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAAc > 1:336248/1‑149 (MQ=255) aaCGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCt > 2:489792/1‑149 (MQ=255) aCGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCtt > 4:281447/1‑149 (MQ=255) ttGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTa > 2:229122/1‑149 (MQ=255) tgtgGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTaa < 4:527822/149‑1 (MQ=255) cTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCa < 1:489792/149‑1 (MQ=255) cGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCg > 1:179614/1‑149 (MQ=255) tAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGt < 1:137380/149‑1 (MQ=255) aaTGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTc > 3:128170/1‑129 (MQ=255) aaTGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTc < 4:128170/129‑1 (MQ=255) tgtgtTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCtttt < 4:469101/106‑1 (MQ=255) tgtgtTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCtttt > 3:469101/1‑106 (MQ=255) gtgtTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAAtc > 3:166025/1‑149 (MQ=255) gtgtTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAAtc < 1:229122/149‑1 (MQ=255) ttCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAAc < 2:323823/72‑1 (MQ=255) ttCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAAc > 1:323823/1‑72 (MQ=255) ttCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAAccccc < 1:531143/114‑1 (MQ=255) ttCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAAccccc < 1:282477/114‑1 (MQ=255) ttCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAAccccc > 2:282477/1‑114 (MQ=255) ttCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAAccccc > 2:531143/1‑114 (MQ=255) ttACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTaaa > 3:491006/1‑149 (MQ=255) ttACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTaaa < 1:445437/149‑1 (MQ=255) ttACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTaaa < 2:302559/149‑1 (MQ=255) cTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAt > 1:299453/1‑149 (MQ=255) tAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAAtc < 3:510101/138‑1 (MQ=255) tAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAAtc > 4:510101/1‑138 (MQ=255) aaaGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTATAGAttg < 2:18225/149‑1 (MQ=255) aaGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgt > 1:563444/1‑149 (MQ=255) aaGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgt < 3:209514/149‑1 (MQ=255) aGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgtt < 1:509075/149‑1 (MQ=255) taAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGc < 2:563444/149‑1 (MQ=255) gATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGGATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGa > 4:482662/1‑149 (MQ=255) aaaGCGGCATTGAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGAc > 3:561152/3‑149 (MQ=255) aaaGCGGCATTGAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGAc > 4:414409/3‑149 (MQ=255) aaaGCGGCATTGAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGAc > 1:269552/3‑149 (MQ=255) aGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTTCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACtt < 2:107369/149‑1 (MQ=255) gCGGCATTGAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgtt < 2:352129/121‑1 (MQ=255) gCGGCATTGAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgtt > 1:352129/1‑121 (MQ=255) gCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgt < 2:243830/117‑1 (MQ=255) gCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttgt > 1:243830/1‑117 (MQ=255) aTTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCAc < 2:336248/149‑1 (MQ=255) | AACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTACTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCAC > NC_000913/2482695‑2482984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |