| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 615,275 | T→A | 5.4% | G373G (GGT→GGA) | entF → | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 615,275 | 0 | T | A | 5.4% | 251.6 / 3.4 | 74 | G373G (GGT→GGA) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/32); new base A (2/2); total (40/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 | |||||||||||
AACGTTACGATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGCCCAGTTCGCCGCGG > NC_000913/615127‑615423 | aaCGTTACGATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAAccggt > 2:199298/1‑149 (MQ=255) gTTACGATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAAccggtccg > 4:78578/1‑149 (MQ=255) gTTACGATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAAccggtccg < 3:27555/149‑1 (MQ=255) aCGATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGtt < 1:146491/149‑1 (MQ=255) gATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTaa < 3:78578/149‑1 (MQ=255) gATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTaa > 2:143870/1‑149 (MQ=255) gATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTaa < 1:48821/149‑1 (MQ=255) gCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGa > 2:29074/1‑149 (MQ=255) 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gggCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGa < 2:44235/149‑1 (MQ=255) gAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGGCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCGGGATGTa > 3:503184/1‑149 (MQ=255) ggCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACg > 2:302843/1‑149 (MQ=255) aGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTg < 3:138058/149‑1 (MQ=255) tgatgaACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGAtt < 1:253908/149‑1 (MQ=255) gatgaACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCACGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGAttt < 1:488664/149‑1 (MQ=255) atgaACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCGTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTg > 3:339022/1‑149 (MQ=255) tgaACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGa < 3:427284/149‑1 (MQ=255) tgaACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAAGATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAACCCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGa < 1:143870/149‑1 (MQ=255) ccGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTAt > 1:586461/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTAt > 3:393522/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTAtt > 3:106451/1‑149 (MQ=255) gCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTg > 4:133460/1‑149 (MQ=255) ttGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATc < 3:301958/149‑1 (MQ=255) cGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGcc > 2:582789/1‑149 (MQ=255) 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2:560446/1‑149 (MQ=255) atatCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAg < 2:495217/149‑1 (MQ=255) atatCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAg < 1:536096/149‑1 (MQ=255) aaGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTa > 1:519660/1‑149 (MQ=255) aaGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTa < 3:63780/149‑1 (MQ=255) aGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTaca > 3:158894/1‑106 (MQ=255) aGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTaca < 4:158894/106‑1 (MQ=255) gTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGa > 4:5393/1‑149 (MQ=255) tATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGAt < 2:427234/149‑1 (MQ=255) aTTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTaa > 2:435742/1‑64 (MQ=255) aTTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTaa < 1:435742/64‑1 (MQ=255) aCCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACTCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCACTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACg > 4:356796/1‑149 (MQ=255) ccggATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAAt < 2:172598/147‑1 (MQ=255) tGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATc < 2:418706/149‑1 (MQ=255) ccTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGc < 2:519660/149‑1 (MQ=255) cTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt > 2:303773/1‑149 (MQ=255) cTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt > 1:281241/1‑149 (MQ=255) cTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt > 1:223910/1‑149 (MQ=255) tGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAAt > 4:482099/1‑138 (MQ=255) tGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAAt < 3:482099/138‑1 (MQ=255) tGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTg > 3:127187/1‑149 (MQ=255) tGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTg > 1:455234/1‑149 (MQ=255) tGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGGATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTg > 2:97487/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGc > 1:576919/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGc > 1:410410/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGcc < 3:70162/149‑1 (MQ=255) gcAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGaaaa > 2:344367/1‑149 (MQ=255) aaaCCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCGATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATg < 4:106451/149‑1 (MQ=255) aaCCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGc < 1:477567/149‑1 (MQ=255) ccATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGa > 4:22892/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGc > 4:331018/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAAGCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGc < 2:576919/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCGCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGc < 2:410410/149‑1 (MQ=255) tcattaaCCGGACCGGTTAATGATCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt < 3:237230/118‑1 (MQ=255) tcattaaCCGGACCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt > 4:237230/6‑123 (MQ=255) cTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGCCCa > 3:494910/1‑149 (MQ=255) cattaaCCGGACCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt < 1:236137/118‑1 (MQ=255) cattaaCCGGACCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCt > 2:236137/5‑122 (MQ=255) cAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGCCCAGTTc < 1:114853/149‑1 (MQ=255) cggtccggtTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGCCCAGTTcgccg < 3:363475/149‑1 (MQ=255) tccggtTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGCCCAGTTCGCCGCgg < 4:436254/149‑1 (MQ=255) | AACGTTACGATGCCGAACAAATTGTCCGTGACAGCGGGCGAGCGGCAGGTGATGAACCGCTGTTTGGTCCGGTACTCAATATCAAGGTATTTGATTACCAACTGGATATTCCTGATGTTCAGGCGCAAACCCATACCCTGGCAACCGGTCCGGTTAATGACCTTGAACTGGCCCTGTTCCCGGATGTACACGGTGATTTGAGTATTGAGATCCTCGCCAATAAACAGCGTTACGATGAGCCAACGTTAATCCAGCATGCTGAACGCCTGAAAATGCTGATTGCCCAGTTCGCCGCGG > NC_000913/615127‑615423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |