| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3788249 | 401 (3.820) | 4 (0.040) | 4/260 | NT | 1.5% | coding (149/960 nt) | yibQ | putative polysaccharide deacetylase |
| ? | NC_000913 | = 4229700 | 120 (1.140) | coding (443/690 nt) | pepE | peptidase E, alpha‑aspartyl dipeptidase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 428 total aligned reads displayed.
TGTTTCCATTTCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCGGAGATGAGC > NC_000913/3788102‑3788397 | tCCATTTCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGATATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCg > 4:530073/1‑149 (MQ=255) tttCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCg < 1:850187/148‑1 (MQ=255) tttCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGc < 3:338160/149‑1 (MQ=255) ttCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGc > 2:546783/1‑148 (MQ=255) ttCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCt < 3:542988/149‑1 (MQ=255) ttCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGCCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCt < 4:623660/149‑1 (MQ=255) cgtcgtAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTg < 2:855254/148‑1 (MQ=255) cgtAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTAt > 2:304039/1‑148 (MQ=255) aCGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTAccc < 4:147858/149‑1 (MQ=255) aCGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTAcc > 1:247531/1‑148 (MQ=255) gTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCg < 2:820782/148‑1 (MQ=255) tCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGAt > 1:359659/1‑148 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCa > 3:460366/1‑149 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCa > 4:847655/1‑149 (MQ=255) ttGCATTTACCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCGCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGACTATTGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCAGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCa < 3:590753/149‑1 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCa < 1:22142/148‑1 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCa > 1:625739/1‑148 (MQ=255) tttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGc > 1:752624/1‑148 (MQ=255) 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gTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCagagag > 2:35317/1‑148 (MQ=255) ggCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATgg > 3:761364/1‑149 (MQ=255) gcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGa < 3:819698/149‑1 (MQ=255) ctcctcCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCACTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGAcc > 2:159389/1‑148 (MQ=255) ctccCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAg > 4:129911/1‑149 (MQ=255) cccccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTAtc < 1:172125/95‑1 (MQ=255) ccccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAgcgc < 3:147369/149‑1 (MQ=255) cccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAgcgc > 1:105427/1‑148 (MQ=255) cccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAgcgc < 1:504447/148‑1 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCa > 2:19677/1‑148 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTAATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCa > 1:676979/1‑148 (MQ=255) cTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACa > 1:444980/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGc < 4:870332/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGc > 3:379537/1‑149 (MQ=255) tGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGc > 4:758550/1‑149 (MQ=255) gCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCa < 2:511751/148‑1 (MQ=255) 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aTCGTCATTGATGATTTTGGATATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGAt < 3:530073/149‑1 (MQ=255) tCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGAtt > 4:291276/1‑149 (MQ=255) tCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGAt > 2:938161/1‑148 (MQ=255) tCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCAt > 4:579620/1‑149 (MQ=255) tCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCAt > 4:338926/1‑149 (MQ=255) 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aCCGGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACACGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGgag > 3:510831/1‑149 (MQ=255) cTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAta < 2:393110/148‑1 (MQ=255) ggCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtacg < 1:142996/148‑1 (MQ=255) gccagtGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtacgc > 4:242156/6‑149 (MQ=255) gATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtacgctac > 3:925304/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtacgctacg > 3:212372/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtacgctac > 2:294243/1‑148 (MQ=255) tGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATCGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtacgctacg < 1:716842/148‑1 (MQ=255) cTTCCGCTATCTGCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCg > 3:72780/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCgg > 4:190188/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCg < 2:676979/148‑1 (MQ=255) ttCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCg > 2:113553/1‑148 (MQ=255) tCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCTCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATCGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCGga < 3:653037/149‑1 (MQ=255) tCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCAACGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCgg > 1:818067/1‑148 (MQ=255) gCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAAtac < 3:437714/134‑1 (MQ=255) gCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCg > 1:133070/1‑144 (MQ=255) cTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCGGAGAt > 1:900624/1‑148 (MQ=255) cTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCGGAGATg < 3:842309/149‑1 (MQ=255) tctcCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCGGAGATGagc < 3:400842/149‑1 (MQ=255) | TGTTTCCATTTCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGATGATTTTGGGTATCGCCCGCACAACGAAAACCAGGTGCTGGCGATGCCTTCCGCTATCTCCGTCGCTGTATTACCCGATTCACCGCACGCCAGAGAGATGGCGACCAAAGCGCATAACAGCGGGCACGAAGTGTTGATTCATCTCCCGATGGCACCGTTGAGTAAACAGCCGCTGGAGAAAAATACGCTACGCCCGGAGATGAGC > NC_000913/3788102‑3788397 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |