| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,202,957 | G→T | 8.2% | intergenic (‑24/‑67) | cohE ← / → croE | e14 prophage; repressor protein phage e14/e14 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,202,957 | 0 | G | T | 8.2% | 453.5 / 22.3 | 131 | intergenic (‑24/‑67) | cohE/croE | e14 prophage; repressor protein phage e14/e14 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/59); new base T (2/9); total (63/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.65e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CTCCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAC > NC_000913/1202810‑1203105 | ctcCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCg > 2:82052/1‑148 (MQ=255)ctcCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCg > 1:264643/1‑148 (MQ=255) tcCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGtt > 4:619172/1‑149 (MQ=255) cccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGtt > 1:571032/1‑148 (MQ=255) ccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa > 3:950667/1‑149 (MQ=255) ccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa > 3:326140/1‑149 (MQ=255) ccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTa < 2:888830/148‑1 (MQ=255) cATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAg > 3:406992/1‑149 (MQ=255) cATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAg < 3:475588/149‑1 (MQ=255) cATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCCGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa < 2:775046/148‑1 (MQ=255) aTAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAgg < 4:368050/149‑1 (MQ=255) aTAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAg < 2:672388/148‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCCGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGAATGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTAc > 3:447849/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTa < 1:3771/146‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTa > 2:3771/1‑146 (MQ=255) ctgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAg > 3:185708/1‑149 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgg < 3:493003/149‑2 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgg < 4:186393/149‑2 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAg > 2:815643/1‑148 (MQ=255) gctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgg < 1:290946/148‑2 (MQ=255) tgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgggtt < 3:926124/149‑5 (MQ=255) gggTCTGGGTAGGCTCGCGATCAATCATAGTGACCAAGGAATAGTTGCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgggt < 2:735240/147‑4 (MQ=255) cTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTg > 1:35398/1‑148 (MQ=255) cTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTg > 2:567407/1‑148 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGaa < 4:18189/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGaa < 4:326140/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGa < 2:736434/148‑1 (MQ=255) gTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAgg > 2:603519/1‑148 (MQ=255) tGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTc < 4:663086/149‑1 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 3:38935/1‑149 (MQ=255) cgcgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 2:168617/1‑148 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa > 3:841200/1‑149 (MQ=255) gATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAAt > 3:928043/1‑149 (MQ=255) atcaatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAAt > 2:907649/1‑148 (MQ=255) tcaatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCa > 4:887171/1‑149 (MQ=255) atcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATg > 2:491372/1‑148 (MQ=255) tcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGt > 1:270496/1‑148 (MQ=255) caTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTaa < 4:185708/149‑1 (MQ=255) caTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTa < 2:588046/148‑1 (MQ=255) caTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTa < 2:303850/148‑1 (MQ=255) tAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAata < 3:577245/149‑1 (MQ=255) aaaGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAGCCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTacac > 4:888793/1‑149 (MQ=255) aaaGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTacac > 4:454476/1‑149 (MQ=255) aaGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTacac > 1:314742/1‑148 (MQ=255) gaagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCgg < 2:660311/148‑1 (MQ=255) gaagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGa < 4:480997/149‑1 (MQ=255) aagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGGTGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGa < 2:353334/148‑1 (MQ=255) aagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACa < 1:261758/104‑1 (MQ=255) aagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGa > 2:271427/1‑148 (MQ=255) agaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAg > 1:401238/1‑148 (MQ=255) gaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGt > 4:544843/1‑149 (MQ=255) aTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTAc > 3:776614/1‑149 (MQ=255) cccGCCAACACTATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACata > 3:762888/1‑149 (MQ=255) cGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTACAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat > 2:243837/1‑148 (MQ=255) cGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATAtt < 3:544843/149‑1 (MQ=255) ccAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGt < 4:776614/149‑1 (MQ=255) aaCACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt < 3:309563/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaa > 2:677924/1‑148 (MQ=255) cATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAg > 4:682037/1‑149 (MQ=255) aTCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAg > 1:236746/1‑148 (MQ=255) aTCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGc < 4:315119/149‑1 (MQ=255) aTCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGATCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt > 3:695676/1‑143 (MQ=255) aTCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGATCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt < 4:695676/143‑1 (MQ=255) ctcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAGCCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTAt < 3:888793/149‑1 (MQ=255) tcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTAt < 1:175390/148‑1 (MQ=255) cAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa < 1:143802/73‑1 (MQ=255) ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgg < 1:849607/73‑2 (MQ=38) ggCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAACGGTACAAgg > 2:849607/1‑72 (MQ=38) cGTTAGACCGCTGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTaa < 3:619172/149‑1 (MQ=255) gTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAAc > 3:403263/1‑149 (MQ=255) ttAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTggg < 1:738010/138‑1 (MQ=255) aGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaa < 3:700882/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa < 3:176722/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa < 3:887171/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGGATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaa < 2:509716/148‑1 (MQ=255) accaccGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAg > 3:495968/1‑149 (MQ=255) ccgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAca < 4:447849/149‑1 (MQ=255) ggATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAcag < 1:815578/148‑1 (MQ=255) gTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACATCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAggg < 3:97804/149‑1 (MQ=255) cATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGc > 1:904425/1‑148 (MQ=255) tGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGa > 2:159300/1‑148 (MQ=255) ggATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAg < 2:485700/148‑1 (MQ=255) ttGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAata > 1:623284/1‑77 (MQ=255) tGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTgg < 1:567407/148‑1 (MQ=255) aTAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGaaa < 2:361397/148‑1 (MQ=255) aCGAAATTAATACCCTTGTACCGTTAAGGTAGAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGTGGTACATATGGTATGAAAGCGTATTGGGACGCTTTAACCAAAAAACAGCAAGGCGAGTTGGCCGGAAAAGtt > 3:589054/1‑149 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGt < 2:264643/148‑1 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTAGCCGGAAAAGtt > 4:911252/1‑149 (MQ=255) gAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGCTgg > 4:7391/1‑149 (MQ=255) aTTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTc > 3:106538/1‑149 (MQ=255) tAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCa > 1:808197/1‑148 (MQ=255) ccTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATGTTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTg < 3:296573/149‑1 (MQ=255) ccTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTg < 4:928043/149‑1 (MQ=255) cTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTg > 2:125203/1‑148 (MQ=255) ttGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCa < 1:554095/44‑1 (MQ=255) ttGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGCTGGCTCAACACCTGGc < 3:7391/149‑1 (MQ=255) ttGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGAGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTgg > 1:46047/1‑148 (MQ=255) tACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTa < 1:672538/148‑1 (MQ=255) gTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTTAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAc > 3:821117/1‑149 (MQ=255) gTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAc > 3:912042/1‑149 (MQ=255) | CTCCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAAGGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAC > NC_000913/1202810‑1203105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |