| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 169,748 | T→A | 10.1% | intergenic (+21/‑30) | fhuA → / → fhuC | ferrichrome outer membrane transporter/iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 169,748 | 0 | T | A | 10.1% | 412.7 / 27.6 | 128 | intergenic (+21/‑30) | fhuA/fhuC | ferrichrome outer membrane transporter/iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/54); new base A (6/7); total (67/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGCCGGGAAAGTGAC > NC_000913/169602‑169896 | aaCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCg > 3:648834/1‑149 (MQ=255) cGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGt > 1:878458/1‑148 (MQ=255) ggCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGccc > 3:96173/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTGcc < 2:929058/148‑1 (MQ=255) cATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTGccccaaaaga < 3:448706/149‑8 (MQ=255) aTGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca > 4:83154/1‑149 (MQ=255) tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca < 2:878458/148‑1 (MQ=255) tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca < 1:465024/148‑1 (MQ=255) tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca > 2:168045/1‑148 (MQ=255) tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACaa > 3:938471/1‑149 (MQ=255) tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACaa > 4:868416/1‑149 (MQ=255) gTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACaa > 2:187674/1‑148 (MQ=255) tAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGt < 1:168045/148‑1 (MQ=255) aacaacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTg < 3:752883/149‑1 (MQ=255) acaacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTg > 1:471698/1‑148 (MQ=255) aacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGc < 2:511444/148‑1 (MQ=255) aacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGc > 1:511444/1‑148 (MQ=255) cTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGtt > 4:300374/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGt > 2:549013/1‑148 (MQ=255) gATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAg < 3:66401/149‑1 (MQ=255) gATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAg < 3:868416/149‑1 (MQ=255) gATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTGc > 3:532159/1‑122 (MQ=255) gATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTGc < 4:532159/122‑1 (MQ=255) aTCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAg > 2:447980/1‑148 (MQ=255) aTCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAg > 2:351417/1‑148 (MQ=255) tCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGa > 4:140411/1‑149 (MQ=255) tCGTGAATACGTCACCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGa > 3:792143/1‑149 (MQ=255) gTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGaa < 1:623243/148‑1 (MQ=255) aTACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATacac < 3:525425/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTg < 1:74774/108‑1 (MQ=255) tCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTg > 2:74774/1‑108 (MQ=255) cAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTc < 4:139784/149‑1 (MQ=255) ctgctTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCg < 1:549013/148‑1 (MQ=255) ctgctTTAACACTTATGGCTGCTTCGTGGTCGCAGACCGTCAGGTCGTTGCAACCGCAATCTTTCGTTTCTAATATCTCTCTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAACTTGGCGGTTAGGCGGGAATTCACGAATCATTCCGa < 4:592841/149‑1 (MQ=255) tgctTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGa < 2:18851/148‑1 (MQ=255) tgctTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGa > 2:521076/1‑148 (MQ=255) tgctTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTGc < 4:253487/101‑1 (MQ=255) tgctTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAAATCCGTGc > 3:253487/1‑101 (MQ=255) gctTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGAt > 2:445356/1‑148 (MQ=255) tttAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATAcc > 3:406139/1‑149 (MQ=255) ttAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATAcc > 2:438772/1‑148 (MQ=255) aaCACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCAc < 1:553183/148‑1 (MQ=255) acacTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGc < 1:319175/111‑1 (MQ=255) acacTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGc > 2:319175/1‑111 (MQ=255) acTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACttt < 2:8886/148‑1 (MQ=255) ttATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGc > 3:671659/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCAc < 3:868519/149‑1 (MQ=255) gctgctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGt < 3:617955/98‑1 (MQ=255) gctgctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGt > 4:617955/1‑98 (MQ=255) gctgctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTg < 2:73927/148‑1 (MQ=255) tgctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACttt < 2:606203/139‑1 (MQ=255) tgctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACttt > 1:606203/1‑139 (MQ=255) tgctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCg < 1:187674/148‑1 (MQ=255) gctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGt > 1:32698/1‑148 (MQ=255) ctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTaa < 4:857584/149‑1 (MQ=255) ctTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTa < 1:78073/148‑1 (MQ=255) tCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAata < 3:402956/149‑1 (MQ=255) tGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATAtc < 3:206340/149‑1 (MQ=255) ggggCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATAtct > 3:300777/1‑149 (MQ=255) gggCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATAtct < 1:869197/148‑1 (MQ=255) gAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTcc > 3:854870/1‑143 (MQ=255) aCGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCgtgt < 3:4759/149‑1 (MQ=255) aGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTAGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCg > 4:625888/1‑149 (MQ=255) ggTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCgg < 3:313820/149‑1 (MQ=255) gTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCggg > 3:153007/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCggg > 3:272957/1‑149 (MQ=255) tCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGgc > 4:185072/1‑149 (MQ=255) tCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGgc < 3:186463/149‑1 (MQ=255) aaccgcaaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCt > 3:741120/1‑149 (MQ=255) accgcaaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCtt > 4:427309/1‑149 (MQ=255) ccgcaaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCttt > 4:88145/1‑149 (MQ=255) cgcaaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCttt < 2:291104/148‑1 (MQ=255) gcaaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCtttt > 2:221000/1‑148 (MQ=255) gcaaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTg > 3:103720/1‑149 (MQ=255) aaccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCa > 3:938753/1‑149 (MQ=255) accTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCa < 1:599276/148‑1 (MQ=255) ccTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATc < 3:668922/149‑1 (MQ=255) ccGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCt > 4:729407/1‑149 (MQ=255) gTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTg < 2:191574/148‑1 (MQ=255) tttCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGt < 1:438772/148‑1 (MQ=255) tttCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGt > 1:76786/1‑148 (MQ=255) tttCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGt < 1:180826/148‑1 (MQ=255) tttCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTc < 3:355321/149‑1 (MQ=255) ttCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTc > 1:399575/1‑148 (MQ=255) aaTTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTaa < 3:114498/149‑1 (MQ=255) tttCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCAt < 3:828543/134‑1 (MQ=255) tttCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCAt > 4:828543/1‑134 (MQ=255) tctcTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCt < 2:287526/148‑1 (MQ=255) ctctTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCttt > 4:517894/1‑149 (MQ=255) tctTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCttt < 1:909937/148‑1 (MQ=255) tctTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCttt < 1:447980/148‑1 (MQ=255) tctTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTc < 4:792143/149‑1 (MQ=255) ctTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTc > 2:340741/1‑148 (MQ=255) ctTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTc > 1:152996/1‑148 (MQ=255) aaatgggCACGGAAATCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTc < 4:169847/142‑1 (MQ=255) ggggCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGcc < 2:362478/148‑1 (MQ=255) gggCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGCCgg < 3:300374/149‑1 (MQ=255) gggCACGGAAATCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGCCgg > 3:6731/1‑149 (MQ=255) aCGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGCCGGGaa < 2:719722/148‑1 (MQ=255) tttCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGCCGGGAAAGTGAc > 4:194635/1‑149 (MQ=255) | TCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCATCCGCTGTCGTTAACCTTTCCTGCCGGGAAAGTGAC > NC_000913/169602‑169896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |