Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,569,436 | 0 | G | A | 5.1% | 423.4 / 7.7 | 131 | H628H (CAC→CAT) | glgX | glycogen debranching enzyme |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATT > NC_000913/3569289‑3569579 | gcgcCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGC‑GGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTg < 4:289866/149‑1 (MQ=255) cAACATTACGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTTGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCa > 4:133681/1‑149 (MQ=255) aaCATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCa > 1:421833/1‑148 (MQ=255) ttAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAGTGGCACGCCATTcc 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aGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGt < 1:420486/148‑1 (MQ=255) cGAATGGGGGAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGTCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGa < 4:586853/149‑1 (MQ=255) aaTGGGGGAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAg < 1:114219/148‑1 (MQ=255) aaTGGGGGAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAg > 2:697397/1‑148 (MQ=255) ggggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAg > 4:692034/1‑77 (MQ=255) ggggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAg < 3:692034/77‑1 (MQ=255) ggggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCatat > 3:135176/1‑149 (MQ=255) ggggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCata < 1:865268/148‑1 (MQ=255) gggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTc < 2:294938/106‑1 (MQ=255) gggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTc > 1:294938/1‑106 (MQ=255) ggAGTGGCACGCCATTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCg > 3:452126/1‑149 (MQ=255) ggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGt > 2:310885/1‑138 (MQ=255) ggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGt < 1:310885/138‑1 (MQ=255) ggAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATc > 2:308962/1‑148 (MQ=255) gAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGa < 4:287945/149‑1 (MQ=255) | GCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACTCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTG‑CAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATT > NC_000913/3569289‑3569579 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |