| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,703,252 | T→G | 5.1% | L199L (CTA→CTC) | dppD ← | dipeptide/heme ABC transporter ATPas |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,703,252 | 0 | T | G | 5.1% | 345.3 / 10.0 | 98 | L199L (CTA→CTC) | dppD | dipeptide/heme ABC transporter ATPas |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/49); new base G (3/2); total (47/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
ACGGGTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCGGG > NC_000913/3703104‑3703399 | aCGGGTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGt < 4:760033/149‑1 (MQ=255) gggTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAg > 4:5739/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCca < 1:326476/148‑1 (MQ=255) tGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTc > 4:536808/1‑149 (MQ=255) ggAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTc > 2:620393/1‑148 (MQ=255) gAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 3:89171/149‑1 (MQ=255) aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGTAGTAGTTCgat < 3:720468/149‑1 (MQ=255) aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga > 1:248337/1‑148 (MQ=255) aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 2:330907/148‑1 (MQ=255) aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 1:813799/148‑1 (MQ=255) aTGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCgatga > 2:496563/1‑148 (MQ=255) tGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCgatgat < 1:393828/148‑1 (MQ=255) tGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGAtt < 4:829625/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgc < 4:4586/149‑1 (MQ=255) gcgcATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgcgc > 1:235794/1‑148 (MQ=255) cgcATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCt < 4:525522/149‑1 (MQ=255) gcATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTg > 3:111701/1‑149 (MQ=255) cATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTg > 1:785117/1‑148 (MQ=255) aTCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGaa < 3:500926/149‑1 (MQ=255) cACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAAt > 2:649940/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 4:379075/1‑149 (MQ=255) ccGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 2:841182/1‑148 (MQ=255) ccGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 1:180294/1‑148 (MQ=255) cGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGt < 2:559898/148‑1 (MQ=255) ggTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgc < 2:493132/136‑1 (MQ=255) ggTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgc > 1:493132/1‑136 (MQ=255) ccaccaCCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTcc < 4:855140/149‑1 (MQ=255) accaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 4:244013/1‑149 (MQ=255) ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 1:545868/120‑1 (MQ=255) ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga > 2:545868/1‑120 (MQ=255) ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 1:613384/1‑148 (MQ=255) ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 2:35408/1‑148 (MQ=255) ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 2:270613/1‑148 (MQ=255) accTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAgcg > 1:460613/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg < 2:101714/135‑1 (MQ=255) ccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 1:101714/1‑135 (MQ=255) tGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCgg < 1:270667/148‑1 (MQ=255) gCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCggtg < 1:496563/148‑1 (MQ=255) gCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCg < 2:248337/148‑1 (MQ=255) gCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCg < 1:87725/148‑1 (MQ=255) aTACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGtt < 3:181070/149‑1 (MQ=255) tACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGtt < 2:722274/148‑1 (MQ=255) tCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATc > 2:558060/1‑148 (MQ=255) aCGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGc > 3:300360/1‑149 (MQ=255) cGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGc < 2:460613/148‑1 (MQ=255) gatTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATca < 4:756363/149‑1 (MQ=255) tttATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagc > 1:102165/1‑148 (MQ=255) tttATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagc > 1:757039/1‑148 (MQ=255) tttATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagc < 1:649940/148‑1 (MQ=255) tATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagcag < 2:613384/148‑1 (MQ=255) ccGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTgg < 2:716608/148‑1 (MQ=255) ccGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGc > 3:855439/1‑149 (MQ=255) ttCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCggtg > 3:523149/1‑115 (MQ=255) ttCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCggtg < 4:523149/115‑1 (MQ=255) ccGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACa < 1:694494/148‑1 (MQ=255) cGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAgg < 3:916623/149‑1 (MQ=255) 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gcgcCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATg > 4:559139/1‑149 (MQ=255) cATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATgccgc > 3:397782/1‑149 (MQ=255) tGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATgccgcc < 1:73890/148‑1 (MQ=255) aactactgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCAcgc > 4:304815/6‑127 (MQ=255) aactactgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCAcgc < 3:304815/122‑1 (MQ=255) aactactgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGaaa > 1:642710/6‑148 (MQ=255) ctTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg > 2:879975/1‑148 (MQ=255) ctTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg > 1:375543/1‑148 (MQ=255) ctTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGc < 3:244013/149‑1 (MQ=255) tttCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGc > 2:399891/1‑148 (MQ=255) actgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg < 1:252799/144‑1 (MQ=255) actgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg > 2:252799/2‑145 (MQ=255) gctgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATg < 1:841182/148‑1 (MQ=255) tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCgg < 4:251307/149‑1 (MQ=255) tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCgg < 3:946555/149‑1 (MQ=255) tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCgg < 3:536808/149‑1 (MQ=255) tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCg < 1:483571/148‑1 (MQ=255) tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCg < 1:715208/148‑1 (MQ=255) gTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCggg > 3:916819/1‑149 (MQ=255) | ACGGGTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCGGG > NC_000913/3703104‑3703399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |