| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,070,413 | 0 | T | G | 6.3% | 378.8 / 11.0 | 119 | intergenic (‑12/+102) | yihR/yihS | putative sulphoquinovose mutarotase/sulphoquinovose isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/48); new base G (3/5); total (66/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAG > NC_000913/4070266‑4070558 | ccTGAAAGGTTAATTCAGCCAGATCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGt < 1:855677/148‑1 (MQ=255) cTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACGAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTg > 1:618969/1‑148 (MQ=255) cTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGa < 3:888772/149‑1 (MQ=255) cTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATCAACGACATACAGCCTCCCGTg < 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ctttaattaaCGACATACAGCCTCCCGGGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCca < 3:700779/147‑1 (MQ=255) ttaattaaCGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCcag > 2:449090/1‑148 (MQ=255) ttaattaaCGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCcag > 1:848246/1‑148 (MQ=255) taaCGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGAc > 2:440993/1‑148 (MQ=255) taaCGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGAc > 1:100504/1‑148 (MQ=255) 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ccttccAGCCCCCCGGGAGGTTGATGTCAAACCCAAAACCGGCACCGGAGGGACCCCTCGCCCCTTTGGGGAGGGGGTTAGGGGGAGGGAAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTg < 4:743168/144‑1 (MQ=255) aTACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCa > 4:170419/1‑149 (MQ=255) tACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGc > 2:628258/1‑123 (MQ=255) tACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCaa > 4:4036/1‑149 (MQ=255) atcAGCCTCACGGGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCaa > 3:429682/3‑149 (MQ=255) atcAGCCTCACGGGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCaa > 3:848092/3‑149 (MQ=255) aCAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCaa > 1:492969/1‑148 (MQ=255) aCAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCaa > 1:303284/1‑148 (MQ=255) gCCTCCCGTGAGGCTGATGCCAAACCCAAAACCGGCCCCGGCCGGTCCCCCCGCCCTTTTGGGGAGGGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCg < 1:95245/148‑1 (MQ=255) cTCCCGTGAGGCTGATGTAAAACCCAAAACCTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTg < 3:55362/149‑1 (MQ=255) ccGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACGGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACAGCTGGAg < 4:688234/149‑1 (MQ=255) | CCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAG > NC_000913/4070266‑4070558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |