| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,551,422 | T→A | 7.1% | intergenic (‑126/‑214) | gntP ← / → uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,551,422 | 0 | T | A | 7.1% | 576.9 / 26.8 | 169 | intergenic (‑126/‑214) | gntP/uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/84); new base A (4/8); total (77/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.21e-01 | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCCGGA > NC_000913/4551278‑4551568 | gaATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTg > 1:414444/1‑148 (MQ=255) tAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaa < 4:217688/149‑2 (MQ=255) tAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaa < 1:894516/148‑1 (MQ=255) gCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCaacaac < 3:274858/149‑1 (MQ=255) aTGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCAt > 2:216698/1‑148 (MQ=255) cATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgag > 1:607299/1‑148 (MQ=255) aTAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCAt < 3:679553/144‑1 (MQ=255) aTAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGagag > 4:643058/1‑149 (MQ=255) aaCGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGt < 1:395834/148‑1 (MQ=255) ttttACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgaga > 4:740397/1‑142 (MQ=255) ttttACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgaga < 3:740397/142‑1 (MQ=255) ttttACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAAt > 4:542520/1‑149 (MQ=255) ttttACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTgcag < 4:884280/128‑1 (MQ=255) ttttACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTgcag > 3:884280/1‑128 (MQ=255) ttacctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTAACCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtgtg > 3:807215/1‑149 (MQ=255) tacctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtgtg < 2:268910/148‑1 (MQ=255) acctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGa < 2:607299/148‑1 (MQ=255) cctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGAGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAAACATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCATCAACCATGAGAGTGGAATTCTTGTGAtg > 4:104177/1‑149 (MQ=255) ctGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGACAGTGAAATTCTTGTGAtgt > 4:650956/1‑149 (MQ=255) tGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCtt < 1:182219/141‑1 (MQ=255) tGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCtt > 2:941828/1‑141 (MQ=255) tGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCtt < 1:941828/141‑1 (MQ=255) tGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaa < 2:204172/119‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGACATTCTTGTGATGTGGTTAACCaa < 3:650956/149‑1 (MQ=255) ttgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCtt > 4:150191/1‑130 (MQ=255) ttgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCtt > 4:275257/1‑130 (MQ=255) ttgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCtt < 3:150191/130‑1 (MQ=255) tgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAAttt > 4:367907/1‑149 (MQ=255) ttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCaacaac < 4:794434/109‑1 (MQ=255) ttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCa > 3:803862/1‑149 (MQ=255) ttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCa < 4:665289/149‑1 (MQ=255) ttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCACTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGCTAACCAATTTc < 2:385751/148‑1 (MQ=255) gggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTc > 1:478318/1‑148 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCgg < 3:762162/149‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCgg < 4:355373/149‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCg < 2:398104/148‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCg < 2:881086/148‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCg < 1:783500/148‑1 (MQ=255) atatGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGC‑ATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGa < 4:279569/149‑1 (MQ=255) atgttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGa < 1:277210/148‑1 (MQ=255) tatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGt < 4:479480/149‑1 (MQ=255) tgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATg > 4:861250/1‑146 (MQ=255) tgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATg < 3:861250/146‑1 (MQ=255) tgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCt < 4:751884/149‑1 (MQ=255) gtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCg < 2:808717/135‑1 (MQ=255) gtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCg > 1:808717/1‑135 (MQ=255) tAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTa < 3:643577/149‑1 (MQ=255) tAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTa < 3:363989/149‑1 (MQ=255) aaaTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAc < 3:592707/149‑1 (MQ=255) atcggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAcc > 1:554426/4‑148 (MQ=255) aTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTg < 2:221523/136‑1 (MQ=255) aTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTg > 1:221523/1‑136 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaa < 3:307860/149‑1 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaa < 1:222150/148‑1 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTAACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaa < 2:149222/148‑1 (MQ=255) gTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACGTGTCTTACCAAAAg > 4:181186/1‑149 (MQ=255) gTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaa < 1:34325/148‑1 (MQ=255) tCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaagg < 3:87254/78‑4 (MQ=255) cAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAgg > 2:704051/1‑148 (MQ=255) cAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGt < 4:57089/149‑1 (MQ=255) aaCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTa > 3:90500/1‑149 (MQ=255) aCCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTa > 1:737/1‑148 (MQ=255) cATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGa < 2:294794/148‑1 (MQ=255) ttgttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCggg < 2:862104/121‑1 (MQ=255) ttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTgc < 3:295850/60‑1 (MQ=255) gCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATAc < 4:519974/149‑1 (MQ=255) gCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATAc < 4:713859/149‑1 (MQ=255) aTGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGcc < 3:104177/149‑1 (MQ=255) aTGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGc > 1:847104/1‑148 (MQ=255) tGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGcc < 2:177789/148‑1 (MQ=255) tGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCAtctc > 4:465484/1‑149 (MQ=255) tCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCa > 2:617205/1‑148 (MQ=255) aTCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCg < 2:843659/148‑1 (MQ=255) tCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTa > 2:489475/1‑114 (MQ=255) tCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGa < 1:691787/148‑1 (MQ=255) ccTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGAt > 2:86198/1‑148 (MQ=255) ctctGATCAATAACCATCGATAACTCTTTACTGCAGTTTGCAGCAACAACCATGAAAGTGAAATTCTTTTGATGTGGTTGACCAAGTTCTGAATTCGGGTTGACAGGTCTTACCAAAAGCTATGACTTATACGCCATCTCATCCGATGc > 4:593095/1‑149 (MQ=255) tctGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCa > 4:732188/1‑149 (MQ=255) tGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAAc > 4:12665/1‑149 (MQ=255) aTCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACg < 1:704051/148‑1 (MQ=255) aaTAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCAc > 3:415092/1‑149 (MQ=255) tAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGt < 2:536884/90‑1 (MQ=255) tAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGt > 1:536884/1‑90 (MQ=255) aaCCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGc > 3:334981/1‑149 (MQ=255) ccATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTg > 3:693707/1‑149 (MQ=255) aTCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGc < 1:100109/148‑1 (MQ=255) aTCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGc > 2:117117/1‑148 (MQ=255) aTCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGc < 2:461023/148‑1 (MQ=255) aTCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCg > 3:455701/1‑149 (MQ=255) tCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATg < 2:777279/91‑1 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgtt > 4:597244/1‑149 (MQ=255) cccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgtt < 3:77601/149‑1 (MQ=255) cTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGGGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGgttg < 1:193363/148‑1 (MQ=255) tgcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATcc > 4:236469/1‑149 (MQ=255) tgcAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATc > 2:568267/1‑148 (MQ=255) gcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATcc > 2:503436/1‑148 (MQ=255) aaTTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCCgg < 1:914947/148‑1 (MQ=255) aaTTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCCGGa < 4:933883/149‑1 (MQ=255) aaTTTGCAGCAAAAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGACACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCCgg < 1:763575/148‑1 (MQ=255) tttGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGAtgtg > 4:345182/1‑40 (MQ=255) | GAATGTTAAGCACATGCATAACGTTTTACCTTACCTGGTTGAACCGTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATCGATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCCATCTCATCCGATGCAACGCCACGGCTGCGGTCTGGTTGTTCATCCGGA > NC_000913/4551278‑4551568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |