| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3711574 = | 138 (0.830) | 369 (2.240) | 156/514 | 0.0 | 68.4% | coding (434/1209 nt) | yhjX | pyruvate‑inducible inner membrane protein, putative transporter |
| ? | NC_000913 | = 3828611 | 203 (1.230) | coding (55/1206 nt) | gltS | glutamate transporter | |||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
TGTTAAGTCTGGGGCTGGCAATTTCGTCTTCTGTTGCGGGCAAATTACAGGAACGTTTTGGCGTTAAACGCGTCACCATGGCTTCCGGCATTTTGCTGGGATTAGGCTTCTTCCTGACAGCGCATTCTGACAACCTGATGATGCTGTGGTTAAGCGCCGGTGTGCTGGTGGGACTGGCAGATGGCGCGGGTTATCTGCTGACGCTCTCTAACTGTGTGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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AGTCTGGGGCTGGCAATTTCGTCTTCTGTTGCGGGCAAATTACAGGAACGTTTTGGCGTTAAACGCGTCACCATGGCTTCCGGCATTTTGCTGGGATTAGGCTTCTTCCTGACAGCGCATTCTGACAACCTGATGATGCTGTGGTTAAGCGCCGGTGTGCTGGTGGGACTGGCAGATGGCGCGGGTTATCTGCTGACGCTCTCTAACTGTGTGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGC < 4:263614/276‑1 GGCTGGCAATTTCGTCTTCTGTTGCGGGCAAATTACAGGAACGTTTTGGCGTTAAACGCGTCACCATGGCTTCCGGCATTTTGCTGGGATTAGGCTTCTTCCTGACAGCGCATTCTGACAACCTGATGATGCTGTGGTTAAGCGCCGGTGTGCTGGTGGGACTGGCAGATGGCGCGGGTTATCTGCTGACGCTCTCTAACTGTGTGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAG < 3:426577/274‑1 GCAATTTCGTCTTCTGTTGCGGGCAAATTACAGGAACGTTTTGGCGTTAAACGCGTCACCATGGCTTCCGGCATTTTGCTGGGATTAGGCTTCTTCCTGACAGCGCATTCTGACAACCTGATGATGCTGTGGTTAAGCGCCGGTGTGCTGGTGGGACTGGCAGATGGCGCGGGTTATCTGCTGACGCTCTCTAACTGTGTGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTTATCTCCGCGTTCGCTATGGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAGTTGGTC > 1:492678/1‑275 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TGTGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAGTTGGTCCATTCCGTCTCCTTTTTGAAGAAATACACCATACCGGAACCTGTTGCGGGTGGTCTGTTGGTGGCGCTGGCCATACTCGTACTGAAAAAAAGCATGGGCGGGGAAGTCAACTGTGATATGTCCCATCGCGATCCGTTAATGCTGGCTTTTTTCTCTACCATTGAGCTTGAGCCCGCAC‑TTGCCAGTTTCCGTtgctgt > 4:335811/1‑270 GTGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAGTTGGTCCATTCCGTCTCCTTTTTGAAGAAATACACCATACCGGAACCTGTTGCGGGTGGTTTGTTGGTGGCGCTGGCGCTACTAGTACTGAAAAAAAGCATGGGCTGGGAAGTCAACTTTGATATGTCCCTGCGCGATCCGTTCATGCTGGCTTTCTTCGTGACACTTG‑GACTGCACGCCCACATTGACATTTTTCTTTCCGGTG > 2:509298/1‑276 TGAAGTGGTTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAGTTGGTCCATTCCGTCTCCTTTTTGAAGAAATACACCATACCGGAACCTGTTGCGGGTGGTTTGTTGGTGGCGCTGGCGCTACTAGTACTGAAAAAAAGCATGGGCTGGGAAGTCAACTTTGATATGTCCCTGCGCGATCCGTTAATGCTGGCTTTCTTCGCCACCATTG‑GCCTGAACGCCAACCTTGCCAGTTTGCGTGTCGGT > 1:357095/1‑274 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TTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAGTTGGTCCATTCCGTCTCCTTTTTGAAGAAATACACCATACCGGAACCTGTTGCGGGTGGTTTGTTGGTGGCGCTGGCGCTACTAGTACTGAAAAAAAGCATGGGCTGGGAAGTCAACTTTGATATGTCCCTGCGCGATCCGTTAATGCTGGCTGTCTTCGCCACCATTG‑GCCTGAACGCCAACATTGCCAGTTTGCGTGCCGGTGGGGGGGTGG > 2:478549/1‑276 TTCCCGGAGCGTAAAGGTCTGATCTCCGCGTTCGCTATCGGTTCTTATGGCTCGGGCGTAAGTTGGTCCATTCCGTCTCCTTTTTGAAGAAATACACCATACCGGAACCTGTTGCGGGTGGGTTGTTGGTGGCGCTGGCGCTACTAGTACTGAAAACAAGCATGGGCTGGGAAGGCAACTTTGATATGTCCCTGCGAGACTCGTTAATGCTG > 4:299161/1‑212 tgaggtTAAAGGTCTGTTCTCCTCTTTTGCTATCGGTTCTTATGGCTCCGTCGTAAGTTGGTCCATTCCGTCTCCTTTTTGAAGAAATACACCATACCGGGACCTGTTGCGGGTGGTTTGTTGGTGGCGCTGGCGCTACTAGTACTGAAAAAAAGCATGGGCTGGGAAGTCAACTTTGATATGTCCCTGCGCGATCCGTTAATGCTGGCTTTCTTCGCCACCATTG‑GCCTGAACGCCAACATTGCCAGTTTGCGTGCCGGTGGGCGTGTGGTTGGC < 4:697650/270‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |