New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4102365 = | 108 (0.980) | coding (676/984 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAGA > NC_000913/4102217‑4102513 | aCCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTgg < 1:123890/149‑1 (MQ=255) aCCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTgg < 4:44217/149‑1 (MQ=255) gcgataatcaacggaataccggtcacgataattactgccacacccaacaggatcccCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTggg > 4:641479‑M1/57‑149 (MQ=255) gcgataatcaacggaataccggtcacgataattactgccacacccaacaggatcccCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTggg > 2:995434‑M1/57‑149 (MQ=255) ccGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTggg < 1:140974/149‑1 (MQ=255) gTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGa < 2:887839/149‑1 (MQ=255) gtggGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGtt < 1:94743/149‑1 (MQ=255) gtggGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGtt > 4:392330/1‑149 (MQ=255) gtggGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGtt < 3:931513/149‑1 (MQ=255) gtggGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGtt < 4:295787/149‑1 (MQ=255) gggCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTgg < 2:165015/149‑1 (MQ=255) gggCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTgg < 2:33984/149‑1 (MQ=255) tttGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGgtgt < 3:982603/149‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTgg < 4:864954/149‑1 (MQ=255) ccTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGgt < 1:584182/142‑1 (MQ=255) ccTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGgt > 2:584182/1‑142 (MQ=255) ccTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAg > 3:267941/1‑149 (MQ=255) ccTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCACCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTGGGGTGTGGCAg > 3:438764/1‑149 (MQ=255) 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ccATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTcc < 2:680097/149‑1 (MQ=255) aTTGATTTGACTGTGACTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCa > 3:174564/1‑142 (MQ=255) aTTGATTTGACTGTGACTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCa < 4:174564/142‑1 (MQ=255) ttGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCa > 3:803491/1‑149 (MQ=255) ttGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCa > 2:168535/1‑149 (MQ=255) ttGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCa > 4:497812/1‑149 (MQ=255) ttGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTACCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCa > 1:905133/1‑149 (MQ=255) tttGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAgggg > 2:678256/1‑149 (MQ=255) tGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGcc > 4:197751/1‑149 (MQ=255) gACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCa > 2:79037/1‑134 (MQ=255) gACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCa < 1:79037/134‑1 (MQ=255) cTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCcgcg > 4:756756/1‑149 (MQ=255) tgtgATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCgg > 2:804530/1‑149 (MQ=255) tgtgATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCgg > 3:726377/1‑149 (MQ=255) tgtgATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCgg > 3:331630/1‑149 (MQ=255) ttGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCg > 1:373558/1‑149 (MQ=255) gCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGac > 4:180973/1‑149 (MQ=255) ccAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGacac > 3:691887/1‑149 (MQ=255) ccAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGacac > 3:601746/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCtgt < 1:685373/149‑1 (MQ=255) tttgctgGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGa < 1:503099‑M2/142‑1 (MQ=255) gGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAg > 1:959020‑M2/2‑149 (MQ=255) gGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAg > 1:20912‑M2/2‑149 (MQ=255) gggATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAGa > 1:59475/1‑149 (MQ=255) | ACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAGA > NC_000913/4102217‑4102513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |