| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 213083 = | 81 (0.690) | 7 (0.060) | 7/254 | NT | 7.9% | coding (753/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
| ? | NC_000913 | 213120 = | 84 (0.740) | coding (790/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCC > NC_000913/212981‑213266 | tGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATg > 4:559424/1‑149 (MQ=255) gAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGc < 2:668005/149‑1 (MQ=255) gAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGc > 4:492534/1‑149 (MQ=255) aaCAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCa > 4:728869/1‑149 (MQ=255) ccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgcccTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag < 2:504432‑M1/38‑1 (MQ=255) ccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgcccTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcag > 1:504432‑M1/98‑135 (MQ=255) aaGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCAcca > 1:521515/1‑148 (MQ=255) gagagCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGAt < 2:53139/149‑1 (MQ=255) gagCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGc < 4:55956/149‑1 (MQ=255) ctgctgGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGTACGCTGCATATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCGGGATGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTc < 4:644839/149‑1 (MQ=255) tgctgGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGTCAGGGCAGAAt < 1:557725/134‑1 (MQ=255) tgctgGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAAt > 2:557725/1‑134 (MQ=255) aaCTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGAcgcg < 4:272532/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGtt < 4:403361/149‑1 (MQ=255) tgctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTg > 1:683294/1‑149 (MQ=255) ctgGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt < 4:916527/149‑1 (MQ=255) ctgGCAGATCATTTAGCACACTGTCAACCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGCGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGGCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGt < 4:636486/149‑1 (MQ=255) ggCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGa < 1:48850/149‑1 (MQ=255) ggCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGa < 4:573191/149‑1 (MQ=255) gCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAg > 3:303576/1‑149 (MQ=255) 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ccagcggcggataatcgccgctggctggcaGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGttt < 4:662132‑M2/105‑1 (MQ=255) ccagcggcggataatcgccgctggctggcaGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGttt > 3:662132‑M2/31‑135 (MQ=255) ggataatcgccgcgcggcgggcaGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGt > 1:37824‑M2/24‑110 (MQ=255) ggataatcgccgcgcggcgggcaGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGt < 2:37824‑M2/87‑1 (MQ=255) gATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGc > 4:732770/1‑149 (MQ=255) gATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGc > 3:675388/1‑149 (MQ=255) tATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAAc < 4:176433/149‑1 (MQ=255) tATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAAc > 1:36707/1‑149 (MQ=255) tCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACtg > 2:164796/1‑149 (MQ=255) ccgccgCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCATCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACtgt > 3:107137/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACtgtg > 4:497506/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACtgtg < 1:786846/149‑1 (MQ=255) gccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAt > 3:480942/1‑89 (MQ=255) gccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGAt < 4:480942/89‑1 (MQ=255) gccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtgg < 2:636290/149‑1 (MQ=255) gctggctgGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGtggtgg > 2:26129/1‑149 (MQ=255) ctggctggCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGa < 1:669087/149‑1 (MQ=255) tggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTaaa > 1:17999/1‑149 (MQ=255) tggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTCGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTaaa > 2:715970/1‑149 (MQ=255) caGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATcc < 3:732770‑M2/147‑1 (MQ=255) caGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATcc < 3:901098‑M2/147‑1 (MQ=255) caGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATcc < 2:414758‑M2/147‑1 (MQ=255) | TGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCC > NC_000913/212981‑213266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |