| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,493,563 | T→A | 5.1% | intergenic (‑309/+204) | frc ← / ← yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,493,563 | 0 | T | A | 5.1% | 476.5 / 12.3 | 137 | intergenic (‑309/+204) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase, NAD(P)‑binding/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/69); new base A (2/5); total (63/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCAT > NC_000913/2493415‑2493708 | tttCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCttttt > 4:949074/1‑149 (MQ=255)tttCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCttttt > 3:1001565/1‑149 (MQ=255)tttCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACAGTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCttttt > 3:309389/1‑149 (MQ=255) cTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTaaa < 1:1024549/149‑1 (MQ=255) cTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTaaa < 3:665922/149‑1 (MQ=255) cTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTaaa < 1:971982/149‑1 (MQ=255) cTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACA‑TTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAg < 3:403876/149‑1 (MQ=255) tGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTa > 4:330404/1‑149 (MQ=255) ggTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTAc < 3:993879/149‑1 (MQ=255) ggTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTaa < 1:238423/149‑2 (MQ=255) tagtGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGAGTACGCTTTAAAAAGCGTaatcatac < 4:544469/149‑8 (MQ=255) gtGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaac > 4:690216/1‑149 (MQ=255) tGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaaca > 2:344647/1‑149 (MQ=255) tGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaaca > 1:1012754/1‑149 (MQ=255) ggACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 1:1038226/149‑1 (MQ=255) ggACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 2:17579/149‑1 (MQ=255) ggACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 3:949074/149‑1 (MQ=255) ggACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 4:890428/149‑1 (MQ=255) aCGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataaca > 2:125443/1‑149 (MQ=255) gAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTaat > 4:727631/1‑132 (MQ=255) gAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTAAAAAGCGTaat < 3:727631/134‑3 (MQ=255) aaaGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACataat > 4:593385/1‑149 (MQ=255) aaaGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACataat < 1:644720/149‑1 (MQ=255) aagaagAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGAGTACCATAAAACAAAACataata > 4:242345/1‑149 (MQ=255) gaagaaTATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGATATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATaaa < 4:901286/149‑1 (MQ=255) gaaTATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGa < 3:859138/149‑1 (MQ=255) aaTATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAt < 2:704659/149‑1 (MQ=255) aaTATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAt > 4:518681/1‑149 (MQ=255) tGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgt < 2:204424/149‑1 (MQ=255) tGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgt < 3:61801/149‑1 (MQ=255) gATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTtgtg > 1:975561/1‑149 (MQ=255) aTAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGtga > 1:133874/1‑149 (MQ=255) aTAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGGGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGtga > 2:1022161/1‑149 (MQ=255) tAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGtgat < 2:975561/149‑1 (MQ=255) gATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACggg < 1:41116/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGa < 2:730559/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGa < 2:53222/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGa > 2:277441/1‑149 (MQ=255) tGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGattatt > 2:986012/1‑149 (MQ=255) gTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGc > 4:333303/1‑149 (MQ=255) tAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCg < 4:696101/149‑1 (MQ=255) tAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCg < 1:858477/149‑1 (MQ=255) gagagagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTAc < 1:815627/149‑1 (MQ=255) gagagagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTAc < 3:281139/149‑1 (MQ=255) agagTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACttt < 4:644614/149‑1 (MQ=255) agTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGa < 1:586331/149‑1 (MQ=255) gTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGa < 2:848791/148‑1 (MQ=255) gTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAg < 1:69096/149‑1 (MQ=255) gTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAg < 2:1012754/149‑1 (MQ=255) gTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAg < 3:330404/149‑1 (MQ=255) gcgACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAaacataa < 3:888033/97‑1 (MQ=255) gcgACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGaa < 1:590701/149‑1 (MQ=255) tgATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGc > 4:1005069/1‑149 (MQ=255) tgATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGc < 3:211856/149‑1 (MQ=255) gATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCg > 2:86124/1‑149 (MQ=255) ttGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGCGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGa > 2:904439/2‑149 (MQ=255) aTGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGa < 1:332509/149‑1 (MQ=255) aTGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGa < 4:393944/149‑1 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGacac < 4:261947/108‑1 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGacac > 3:261947/1‑108 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGttt < 1:262435/124‑1 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGttt > 2:262435/1‑124 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATaaaa > 2:474191/1‑142 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATaaaa < 1:474191/142‑1 (MQ=255) gTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGt > 1:332996/1‑149 (MQ=255) ttATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGt < 3:784588/121‑1 (MQ=255) ttATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGt > 4:784588/1‑121 (MQ=255) aTTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTta > 4:380369/1‑149 (MQ=255) ttCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtat > 2:48278/1‑149 (MQ=255) ttCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtat > 3:429020/1‑149 (MQ=255) ttCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGAATTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtat > 2:613345/1‑149 (MQ=255) ttACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAg > 1:937869/1‑148 (MQ=255) cTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTtat < 4:801439/140‑1 (MQ=255) tGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGa > 3:837247/1‑149 (MQ=255) gaagCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGcc > 3:252043/1‑149 (MQ=255) cGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAaataat > 1:729725/1‑149 (MQ=255) ggTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAAtt < 1:717184/149‑1 (MQ=255) gATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTa < 4:733521/149‑1 (MQ=255) aTTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTAt < 3:1005069/149‑1 (MQ=255) aTTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTAt < 3:642010/149‑1 (MQ=255) agcaagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACcaca > 3:558310/1‑149 (MQ=255) caagGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAc < 1:754674/149‑1 (MQ=255) gggTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAg > 3:656218/1‑112 (MQ=255) gggTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAg < 4:656218/112‑1 (MQ=255) gggTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGATTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTg > 2:5082/1‑149 (MQ=255) gTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTc > 3:254986/1‑149 (MQ=255) gTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTc < 2:62900/149‑1 (MQ=255) gTATGATTACGCCTTTTAAAGCGTACCATAAAACAAAACATAATAAATGAGTTGTGATTAAACGTGATTATTGCGGTTTAGATTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAATACCACGATCGCTAAATATTTTTATAACCACAACCTGTc > 2:860574/1‑149 (MQ=255) tATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGc < 3:781451/99‑1 (MQ=255) tATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGc > 4:781451/1‑99 (MQ=255) ttACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATtg > 1:993842/1‑149 (MQ=255) tACGCTTTAAAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGt > 4:256634/1‑144 (MQ=255) aCGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATtgtg < 1:125443/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTgg < 4:985626/149‑1 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGt > 4:777389/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGt > 2:196728/1‑149 (MQ=255) tttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAAc < 2:1049547/132‑1 (MQ=255) tttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCa > 1:839465/1‑149 (MQ=255) tttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCa > 4:225997/1‑149 (MQ=255) ttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCAt < 3:561096/149‑1 (MQ=255) | TTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCAT > NC_000913/2493415‑2493708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |