Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 374,689 | 0 | A | G | 5.8% | 273.7 / 5.4 | 86 | R274R (CGA→CGG) ‡ | mhpE | 4‑hyroxy‑2‑oxovalerate/4‑hydroxy‑2‑oxopentanoic acid aldolase, class I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/39); new base G (2/3); total (44/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.30e-01 |
CGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGG > NC_000913/374541‑374837 | cgGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGa < 2:297752/149‑1 (MQ=255) cgGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGa < 1:250956/149‑1 (MQ=255) gggcgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATc < 1:71992/149‑1 (MQ=255) 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cTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCt < 1:859896/149‑1 (MQ=255) ggTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTgg < 3:377838/149‑1 (MQ=255) gTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTCGAGCTGGGCaaa > 2:657712/1‑149 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAAc > 2:305974/1‑149 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAAc > 4:59367/1‑149 (MQ=255) aGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATg > 1:536664/1‑149 (MQ=255) aGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATg > 4:785539/1‑149 (MQ=255) aTCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGtt < 1:665904/149‑1 (MQ=255) aCCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggcg > 4:1034227/1‑149 (MQ=255) tACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCag > 3:884937/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCGGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCagga < 4:713239/149‑1 (MQ=255) gAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCaggag > 2:719564/1‑149 (MQ=255) gAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCaggag > 1:460714/1‑149 (MQ=255) aGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCaggagg < 4:76390/149‑1 (MQ=255) | CGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGG > NC_000913/374541‑374837 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |