Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2103891 | 2104188 | 298 | 26 [25] | [25] 30 | wbbK | lipopolysaccharide biosynthesis protein |
CTTACCTCGCTCTTTAGCTTCAGACAACGGCAATCCCCATGTTTCTAACCTAGAGGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACA > NC_000913/2103616‑2104061 | cTTACCTCGCTCTTTAGCTTCAGACAACGGCAATCCCCATGTTTCTAACCTAGAGGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTg > 4:317371/1‑275 (MQ=255) gcactTTAGCTTAAGAAAACAGCAATCCCCATGTTTATAACCTAGAGGGAAAAACAACGATATCTGAAATAATATAACAATGAACGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTACTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAAGTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATGTTTAAATACTCGTGGAAcagca < 4:107045/272‑1 (MQ=255) gagGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTgaga < 2:317372/275‑1 (MQ=255) gTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAatga > 4:294987/1‑275 (MQ=255) ccGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAatgat < 2:294988/272‑1 (MQ=255) aGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTAt > 4:233309/1‑166 (MQ=255) aCTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTTTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAat < 1:90073/179‑1 (MQ=255) tGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCtt < 2:233310/166‑1 (MQ=255) ataatTTTGCATACGCATTTTCTGGACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGTGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAatgat < 4:553047/226‑1 (MQ=255) tatTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcatcatc > 1:194040/1‑176 (MQ=255) tatTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcatcatc < 3:194040/176‑1 (MQ=255) tGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAA‑TTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACt > 4:456710/1‑212 (MQ=255) tACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcat > 3:142976/1‑163 (MQ=255) tACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAA‑TTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACa < 2:456711/212‑1 (MQ=255) gaCGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcat < 1:142976/162‑1 (MQ=255) ttttCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTa > 2:241136/1‑113 (MQ=255) ttCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTgg < 2:323009/99‑1 (MQ=255) cTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAat < 4:241135/113‑1 (MQ=255) aGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGAc > 2:235367/1‑185 (MQ=255) cAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcttcatc > 3:179663/1‑138 (MQ=255) cAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcttcatc < 1:179663/138‑1 (MQ=255) gAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCGTCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAatg < 4:235366/185‑1 (MQ=255) ttAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGaacaaaca > 3:101338/1‑184 (MQ=255) ttAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGaacaaaca < 1:101338/184‑1 (MQ=255) gTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCg < 3:184877/103‑1 (MQ=255) gTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCg > 1:184877/1‑103 (MQ=255) | CTTACCTCGCTCTTTAGCTTCAGACAACGGCAATCCCCATGTTTCTAACCTAGAGGGAAAACAAACTATATCTGAAATATTATAACAATGATCGATTTTTTCTTTATCCAAGTACCCGAGGAAATGAACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTTTCATCCAGAATTGTTGAACAAACA > NC_000913/2103616‑2104061 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |