| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,685,527 | A→G | 100% | G354G (GGT→GGC) | fumC ← | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,685,527 | 0 | A | G | 100.0% | 196.3 / ‑6.7 | 60 | G354G (GGT→GGC) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (27/29); minor base T (2/1); total (30/30) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGC > NC_000913/1685258‑1685784 | tACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgc < 1:81202/278‑1 (MQ=255) cgcgcAATGGCCGCAGCTTTTAAGGTCATCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGcccccc < 1:82187/278‑1 (MQ=255) gcgcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCATGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGcc > 2:418058/1‑274 (MQ=255) aatggCCGCAGCTGTGAAGGTCAGCCCTTCTGTTTGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTGTTCATAACCAATGTGGGTGGTAAGGGCAGTCACCAGCAACAGCGATTCATTGAGTAAGTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTGCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCa < 4:229294/272‑1 (MQ=255) aaGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCa < 2:475203/275‑1 (MQ=255) ggcgaggCTTTTAAGGTGGGCCGTTTTTTGTGGGCTTTTGTGGCGGTCTCGGCGGCGTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAATCGGAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGGGGATCAGCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGtt < 4:57724/269‑1 (MQ=255) tttAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGTGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCTCCAGCATCAGCGATTCATTTAGTAATTTCTTGATTCGCTCACGCTTCGGTTCCATACCCACTGCGAAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATTTGCCAGCACGGCCTCCGCTTGCAGTACATTGTGGATCCCCATCTGACGGAAGACTTTCAATTCAATGTTTCCGGAACCCCCACCCATGTTTCTCGCCa > 4:509665/1‑274 (MQ=255) ttAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCCGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCCCCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGAAGGACTGCGTTCAGTTCAAAGTACCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGACCCCCag > 4:355181/1‑273 (MQ=255) agtacggccTTGTTTTTGGGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGACTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCAcgtcg < 4:317952/267‑1 (MQ=255) ttcttTTTGCGCTGTTTTGGCGATCTCGGAGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCa < 4:207999/275‑1 (MQ=255) ttcttTATGCGCTTTTTTTGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAATCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAAGTGATTGCGTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCa < 4:18263/275‑1 (MQ=255) ttttttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTACGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATTCCATCTGCCAGCAATCGCCCCGATTGCAGGAAATTGTTGATCCCCATTGGCCGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCCTGTTTATCGCAACCTCCGTCCCCATCCTCTGAcagcag > 4:230082/1‑274 (MQ=255) ttttttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagc < 2:355182/272‑1 (MQ=255) gATCTCTGCGGCTTTTTCTAAACCCATGTGGGTGTTAAGCGCTGTCCCCAGCATCAGCGATTCATTTAGTAATTGATTGATTCGCTCACTATTCGGTTCAAGACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAACGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGGTCGCCATTAGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTGGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCAACACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 4:124027/275‑1 (MQ=255) aagtccggcggCTTTGTCATAACCAATGTTGGGGTTAACCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGAATCGCACACCATTGGGTTCAACACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGCCGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCAGGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 4:418057/270‑1 (MQ=255) aTCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTTGATAACCATTGGACGGAAGACGTCCAGTTCAAAGTTTCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCCCTTCCTTCCCCAGCACCTGCCAGCAGACCATGGt > 4:126250/1‑272 (MQ=255) tgcTTTGTCGTAACCAAGGTTGGTGTTAAGCGGCATTACCATCATCCGGGATTCATTGCGTATTTGATTGATTTGTTCACGATTCGGTTCACTATCCCCTGCGCGGTGGTTGTTAAATCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGTAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGGGCCCCCCATGTTAGTCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcac < 4:282754/274‑1 (MQ=255) tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACt > 2:279470/1‑275 (MQ=255) tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACt > 2:22598/1‑275 (MQ=255) tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAAAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCAAACTGTGTTGGGTTCACt > 2:505774/1‑275 (MQ=255) tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGACCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCCCCTGACGGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGCTGGCTTCAc > 4:307822/1‑274 (MQ=255) ggTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTgtgt < 2:307823/261‑1 (MQ=255) gtgtTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTcc < 2:211873/274‑1 (MQ=255) ttAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCCTCACCTGACAGACGAGCATGGTTAATCCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCg > 2:31064/1‑274 (MQ=255) ttAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCCCCCTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCg > 2:372538/1‑274 (MQ=255) ttAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg < 2:188901/275‑1 (MQ=255) aGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCACAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTg > 2:131901/1‑275 (MQ=255) cAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCt > 2:450097/1‑275 (MQ=255) tgttgattGGCTCACGGTTCGATTCAATACCCACTGTGCAGTGTTTGTTAAAACGTTCCATGCCAACAGCCGACAAGCGCAACGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACTTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGAt < 4:131901/272‑1 (MQ=255) attCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagca > 4:180538/1‑185 (MQ=255) attCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGAATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCAcc > 2:355621/1‑275 (MQ=255) gCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGc < 2:180539/185‑1 (MQ=255) tgcGGATCAATAACCACTGCGCAGGGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCAGCGATTGCAGGGAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAgcg < 2:509666/273‑1 (MQ=255) aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccag > 2:618479/1‑275 (MQ=255) aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGACCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCGCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCAGGCTTGAGCTGCCCGGCTCCTTTTCCGGGAGTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCagcgccccg > 4:357176/1‑268 (MQ=255) tGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCAc > 2:635370/1‑132 (MQ=255) cgtaGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCAGCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCATGAAATTGTGTATCACCTTTGGACGGAAGACTTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 2:638071/167‑1 (MQ=255) cAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCAcgtcg < 4:635369/132‑1 (MQ=255) tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCGGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGCCATCATTGGCGAttt > 2:125808/1‑274 (MQ=255) tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGa > 4:380562/1‑103 (MQ=255) tGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGc < 2:380563/103‑1 (MQ=255) tcggCCAGCAAGAGCACCGATGGCAGGAAATTGTGGGTCACCATTGGACGGGAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTGCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACGTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATGGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa < 4:52643/272‑1 (MQ=255) ggAAATTGGGGATCCCCCTGGGACGGACGGCGTGCAGTTCAAAGTTTCCGGAAGCGCCCCCCAGGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCCCCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCAGACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCTGCATGATTGAGCGGCCCGGCTCATGTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCg < 4:154340/275‑1 (MQ=255) aaaTTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGt < 2:88643/274‑1 (MQ=255) ttttgGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGCCAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGAGTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTgcgc < 4:607576/272‑1 (MQ=255) tgtgGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGCCGCAGCCAACCCTTTCAAcgaccagttcgcc > 4:534082/1‑264 (MQ=255) gtgtATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCCGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAAc < 1:22936/279‑1 (MQ=255) ggagaaacagtGGGCGGATGGCGTTCAGTTCAAAGGTGCCGGAGGGGCCCCCCATGTTGATCGCCACGGCTTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGGTTCACACTGTTTGGGGTTCACTTGACCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCTCCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATTAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGcc < 4:254868/262‑1 (MQ=255) ttGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCCGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATCGGCGCTTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAAccctggc > 4:293545/1‑269 (MQ=255) ttGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGc > 2:506680/1‑274 (MQ=255) gACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagca > 4:700519/1‑79 (MQ=255) gACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGTGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGTCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGACCACGGCCCTCACAg > 1:136706/1‑278 (MQ=255) gAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGc < 2:700520/79‑1 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc > 1:113463/1‑90 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 3:113463/90‑1 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGAtt > 3:111659/1‑153 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGAtt < 1:111659/153‑1 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTCCCGGGCTTGAGATTTCAATAATTCCGCAGCGCGTGCCAGATGCCAGCCACCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCCACCCTCTACACGCCCCTTTCGCCTGACCCAgtgtctcccagtg > 4:170942/1‑263 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCAGGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTGCGGGCTTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGTGTGCCAGAGGCCCGCCAGCGGCCATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACCCCGCCAACCCTTTCCACNNNCCGTGGGCCTGCACAACGGCaaccccagtcca > 3:194104/1‑267 (MQ=255) aaGACGTTCAGTTCAAAGCTGCCGGAAGCGCCCCCCCGGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGCTTCACTTTCCACGGCATGATTGAGCTGCACGGCCCATTTTCCGTGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCACGGCCCAGCGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCTACCACCCCATTAACCGCGCCGTGCTCCTGAAACAGGgcagcaacggt > 4:638431/1‑270 (MQ=255) | TACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGC > NC_000913/1685258‑1685784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |