New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 756522 | 130 (0.910) | 9 (0.060) +GGC |
4/500 | 11.9 | 6.5% | coding (616/1767 nt) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
? | NC_000913 | 756523 = | 131 (0.900) | coding (617/1767 nt) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ATCAACGTCCGTTTGGCGGTCAGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCG‑AAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCT‑GCTGAACAAACATGGCG‑AACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAA > NC_000913/756250‑756795 | atcCACGTCCGTTTGGCGGTCAGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCCGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTTGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAg‑‑‑g < 2:655256/274‑1 (MQ=255) atcAACGTCCGTTGGGCGGGCAGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGCCCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAg‑‑‑g < 2:312856/274‑1 (MQ=255) accAACGCCCGTTGGGCGGTCAGGCGAAAGACGTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTGCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAg‑‑‑g < 4:477541/272‑1 (MQ=255) aCGGCCGGTTGGCGGTCAGTCGAAAAGCTGCGGCGGCGGGCAGCCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTAGGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTa < 3:213718/275‑1 (MQ=255) tCCGTTTGGCGGTCAGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTAtt < 2:363614/274‑1 (MQ=255) ccGTTTGGCGGTCAGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTa < 2:415012/275‑1 (MQ=255) tttGGCGGTCAGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGGGGAGTGGGTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGGGTTTAtg > 1:669653/1‑273 (MQ=255) aGTCGAAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGCTCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGTGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGCCGACTGGCGGAGCCG‑‑‑GGCGTATTTATTCGTccaccac > 3:681123/1‑274 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACg < 1:764167/274‑1 (MQ=255) aaacCTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAGCCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGcc < 2:586366/275‑1 (MQ=255) aaaaCTGCGGCGACAGGACGGCGGACCGCCCAGAGGCAGCAGCGGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGCACCTGAGAAACCACACGACCATTTTCGCCGGGTGATATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGTATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACGGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCGAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGcc < 3:232948/275‑1 (MQ=255) aacctacgccggcgAGCAGGCGGAACGCACTGCGGCAGCAGGTGACCGTACCGGTCACGCCCTGTTGAACATGCGTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTGCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGcc < 4:510343/265‑1 (MQ=255) aaaCTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACCGACTGCGGCAGACACTGACCTTACCGTTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGcc < 1:447659/274‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTTCACCACCAACGCCCACAtt > 1:782931/1‑275 (MQ=255) tCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACAtt > 1:599511/1‑275 (MQ=255) gcacgcgcGGGGGCAGCAGCTGACCGTAACGGTAGCGAACGGTTGCACACGATTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACCCCGCCATTTTCGCGGAGGGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGgtg < 4:445403/274‑1 (MQ=255) cacTGCGGCAGCAGCTGACCGGACCGGTCACGCACTGTTGCACACGATTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCGTTTTCACCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAGCCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCAGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGc < 1:638341/274‑1 (MQ=255) gcTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTCCCGTGCTGGCGCCTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGACCACATTAACACCGGCCACGGTGTCGGCCTGGCTATCCggg > 2:560490/1‑272 (MQ=255) tGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCCCATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCCACCCGTTCCg > 3:73605/1‑275 (MQ=255) tGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCAGTGCCg > 3:387848/1‑275 (MQ=255) gACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTAGTTATCAGTCTACCACCAACGCCCACATTACCACCGGCGACGGTGCCGGCAGGGCTATACGTGCCgc > 2:137038/1‑274 (MQ=255) aCCGCTCACGCAAGGATGCACACGGAGTATAAGCAAAACCTGAAAAACCAGACAACCATGGTCTCCGAGGGGTATGCGCTGGAGCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGTTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAGACGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTAc < 4:172103/274‑1 (MQ=255) gcagacACTGTTGCACACCCTTTATCCGCAAAACCTGAAAAACCACGCCCCCTTGTTCTCCGAGTTGGATGCGCTGGATCGGGTGAAAAGCCCGGATGGCGAGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 4:428938/269‑1 (MQ=255) cagCACTTTTGACCAGGCTTTATCACCAGACACTGAAAAACCACTCCCCCATTTGTTCCGGGTGGTATGGGCTGGATCTGGTGAAAAGCTAGGATGGCGAGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCAGCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCa < 4:345658/272‑1 (MQ=255) acggccTGTTGCCCACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 1:588705/267‑1 (MQ=255) acccACTGGTGCACCCGCTTGTACACAAGAACCTGGAAAACCCCACCACCAGTTTGTCCGAGTGGTATGCTCTTGATCTGGTGAAAAAACAGGATGGAGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAACCCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGNGGAGCAG‑‑‑GGCTTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 4:395887/269‑1 (MQ=255) aCGCATAGTTTCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCGCCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 3:621000/272‑1 (MQ=255) aCGCACTGTTGCCCACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 2:133216/272‑1 (MQ=255) aCGCACTGTTGCACACGCTTTATCAGCACAACCGTAAAAACCACACCGCCATTTTCTCCGAGGGGTATGCGCTGGATCTGGGGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 3:228226/272‑1 (MQ=255) aCGCAATGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGAGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCGGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGc < 2:355061/273‑1 (MQ=255) aCGAACTGGTGCCCACCCCTTATCAGCAGAACCCGAAAAACCCAACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTg < 1:638479/272‑1 (MQ=255) tGTTGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATGTATCCGTCCACCACCAACGCCCACATTACAACAGGCGACGGTGTGGGCCGGGCTATCCGGTCCGTCGTAACGGGGCTGGagat > 4:186160/1‑274 (MQ=255) ttGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACg > 3:3207/1‑229 (MQ=255) gCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAG‑‑‑GGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACCTTAACACCGGCGACGGTTGCGGCATGGCTATCAGTGCCGGCCTCCCGGTGCAGACTGGGGAAATGTGGc > 3:34446/1‑275 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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