| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4295832 = | NA (NA) | 4 (0.030) | 3/436 | 11.6 | NA | intergenic (+38/+604) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| ? | NC_000913 | = 4296394 | NA (NA) | noncoding (560/600 nt) | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑C‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGAAATACCAGGTTGCCTTGTCATCGTCGGCCTTAATGCCCACGCCGT > NC_000913/4296148‑4296665 | gCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCTACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCGACGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCAGCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGt < 2:316419/275‑1 (MQ=255) gctataagcGCCTGATGCTACGCTCAACGGGTCGTATCGGGCCTA‑GTCCGACAACCGCAAGGGCCTGAGTTAGGGTGCTGTGGTGGTGCG‑GTTAAGGCTGTTATGCGGCTTCCGACATCAACGCCTGATGAGACGCTTAACGCGTTTGATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAAGAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCGGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCt < 3:50446/266‑1 (MQ=2) aTGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGCCGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGttca > 1:788447/1‑272 (MQ=2) gcttgccgcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTTCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGGTGGTTCATTTTTCa > 2:230886/7‑274 (MQ=255) cttgccgagTCTTATCAGGCCTAAGCCAGAC‑AACGAAATAGCCTGATTTAGCTTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 1:55313/267‑1 (MQ=11) tATCAGGCCTACGCCAGAC‑AGCGAAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCACCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc < 1:25150/274‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACGCCAGAA‑ACGGAAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc < 1:415913/274‑1 (MQ=255) gaTCAGGCCTACGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc < 2:167386/273‑1 (MQ=255) gCCTACGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGCCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTacc > 1:295816/1‑273 (MQ=255) tACGCAAGAA‑AGCGCAATGGCCTGATTTAGCGTGAGTGTGTAGGTCG‑AATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 1:93588/275‑1 (MQ=14) aCGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:358373/274‑1 (MQ=255) aCGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:597789/274‑1 (MQ=255) cGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc > 1:344732/1‑275 (MQ=255) cGCCAGAC‑AGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAACGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATCTTGTCGGTCGGATACGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATAATTGCCTGATGCGACGTTTGCCGCCTCTTCTACAGCCTATCCTACCTGTTGGTTCATTTTTCTAACTCTTTACACCCGCTATccatc > 3:411956/1‑270 (MQ=11) gaGAC‑AGCGCAATAGCCTGTTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCTGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCtt < 2:670925/274‑1 (MQ=255) cAGAC‑AGCACATTAGCCTGATTTAGCGTTATTTGGTGGGTCG‑GCTACGGCGTTGATGCCGCAGCCTACATCAACGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACGCAAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCtt < 3:550467/275‑1 (MQ=17) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGTCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATCAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CCCATCCGACATACATGCCTGCTGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTCTCTTAACCGTTGGCTAATCTTTTAAATTCTCCCCACCACGTATCAAACCCtccaacaca > 3:615413/1‑267 (MQ=11) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACCGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCACTGCCTGATGCTCCCCTTTCCGCGTCTTATCCGGCCTATCTTAACCGTTGGTTACTTTTTCCAACTCTTCACCCCCTGTATCACACCTTTctctta > 1:453797/1‑269 (MQ=14) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACa > 2:420540/1‑275 (MQ=255) aaTAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCt < 2:294775/275‑1 (MQ=255) acttgtttAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:89586/270‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGtt > 1:825493/1‑274 (MQ=255) gATTTGGCTGGAGTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCACCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 2:542888/272‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 2:239768/272‑1 (MQ=255) tttAGCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATAc > 3:463537/1‑261 (MQ=255) taccggtaTTTTGGAGGTCG‑GATAAGGCGTTTAGGCCGCATCCGACATCCACGCCTTATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTc < 4:592140/263‑1 (MQ=17) gCGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCt < 1:463537/261‑1 (MQ=255) cGTGATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGCTGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTCTCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTTCATACAGCTCCGGTTCAACCattc > 4:454801/1‑272 (MQ=255) agTGATTGCGTAGGTCGTGAT‑AGGCATTTATTCACCATCCGACAGTAAAGCCTAAGGCAACGCGTACCGCTTCTTTTCATGCCTAGGCCAGGCAGCACAGTAGCCGGATTGTGCGTGATTTTGTAGGTCGGATCGTTCCTTTACA‑‑C‑‑CTCAGCCGACATCAAGGCCTGATTCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTTACCGTGGGTTAATTTTTCGAACTCATCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTg < 4:484036/274‑1 (MQ=255) gATTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc < 3:825493/273‑1 (MQ=255) aTTTTGTAGGTCG‑GATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCCTCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCTGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCCGGTTCAATCAGCGCat > 2:349886/1‑273 (MQ=255) cG‑GATAAGGGGTTTATGCCCCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCTTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑CGACGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGc < 1:801139/273‑1 (MQ=255) gCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTtcttct < 1:663375/275‑1 (MQ=255) agTTTATGCCGCATCCTACATAAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAATGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTtcttct < 2:691825/273‑1 (MQ=255) tATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCCCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATa > 2:315254/1‑275 (MQ=255) gCCGCATGCGCCAACAACGCCTAATGCGGCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGTCGTCACAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGGAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATaaa < 4:598487/274‑1 (MQ=21) gCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATaaa < 2:454801/274‑1 (MQ=255) ccgcgaccGACATCAACGCCGTATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATaaaa < 2:108125/268‑1 (MQ=255) cGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATCTATCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCACTGCCTGATGCGAAGCTCGCCGCGTCCTATAAGGCCTATCCTAACCGTTGGTTACTTTTTCAAACTCTTCACACCCCTTATCAAACCCCTCCATCCACCCATGGATCAACCCGTACTCCGCCTTTGGCTGGTTCTTCTCGCTAAAccc > 3:768529/1‑275 (MQ=17) gCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCATTGCCTGATGCGACTCTTGCCGCCTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTTAACCTTCTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCACACAGCTTAGGTTCAACCCATGCAGCGACTTTTTCTTGTTCTTTTCGCTAAAACct > 4:475333/1‑275 (MQ=18) gCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGt > 1:34013/1‑205 (MQ=255) cATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATTCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCATTGCAGCGCCTTTTTCTTGTGCCTCTCGCTCAAACctt > 1:721860/1‑275 (MQ=21) cggccagcAACGCCGGATGCGACGTTTCCTGAGTTTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTCATTTAGCGTGATTTTTGAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACcttctt < 4:68784/268‑1 (MQ=25) 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ccTGATGCTACGTTTATCGCGTCTTATAAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGTTTTCGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATAAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAg < 3:613896/274‑1 (MQ=25) ggaggCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCCTCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAAc < 2:460037/271‑1 (MQ=255) taTGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCTCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTAGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGGTGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAGAACCTTCTTCACCGTTTAAGAAca < 2:245832/274‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |