New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3225107 = | 51 (0.660) | 5 (0.070) | 5/254 | NT | 9.1% | coding (2475/3093 nt) | ebgA | evolved beta‑D‑galactosidase, alpha subunit |
? | NC_000913 | 3225132 = | 51 (0.690) | coding (2500/3093 nt) | ebgA | evolved beta‑D‑galactosidase, alpha subunit |
AAGGGCTGTGGCAACCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTGGACCGGG > NC_000913/3224959‑3225253 | cctgctggctgtcggcgtagttttcgcccggtccacgaccgtaatacgccacctgatcgtattcgccgttaattcccatggtgaaaccgatgcacggaatgatgtgcggatagtcgccgtaacgctcgccggaaagcgccacgttaacc > 2:368081‑M1/149‑149 (MQ=255) cctgctggatgtcggcgtagttttcgcccggtccacgaccgtaatacgccacctgatcgtattcgccgttaattcccatggtgaaaccgatgcacggaatgatgtgcggatagtcgccgtaacgctcgccggaaagcgccacgttaacc < 1:294556‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgctggctgtcggcgtagttttcgcccggtccacgaccgtaatacgccacctgatcgtattcgccgttaattcccatggtgaaaccgatgcacggaatgatgtgcggatagtcgccgtaacgctcgccggaaagcgccacgttaacCt < 4:50048‑M1/2‑1 (MQ=255) tgctggctgtcggcgtagttttcgcccggtccacgaccgtaatacgccacctgatcgtattcgccgttaattcccatggtgaaaccgatgcacggaatgatgtgcggatagtcgccgtaacgctcgccggaaagcgccacgttaacCTg > 2:630727‑M1/147‑149 (MQ=255) gggCTGTGGCAACCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTg < 4:276932/149‑1 (MQ=255) cTGTGGCAACCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGTGCTGCACCTACATCTGgcg > 4:316969/1‑149 (MQ=255) ggCAACCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATc < 2:145286/149‑1 (MQ=255) aaCCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATc < 2:4348/146‑1 (MQ=255) aaCCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATc > 1:4348/1‑146 (MQ=255) aCCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTg > 4:526883/1‑149 (MQ=255) aaTCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCGGCCGGTGTATGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGa > 3:439930/1‑149 (MQ=255) tCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATg > 1:417766/1‑149 (MQ=255) aTTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑Gc > 3:558863/1‑149 (MQ=255) cccggtccacgaccgtaatacgccacctgatcgtattcgccgttaattcccatggtgaaaccgatgcacggaatgatgtgcggatagtcgccgtaacgctcgccggaaagcgccacgttaacCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGt > 4:668185‑M1/123‑149 (MQ=255) aGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGtt > 1:110667/1‑149 (MQ=255) gATCATGGAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCGGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACAGCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTa > 4:404425/1‑149 (MQ=255) ggtccacgaccgtaatacgccacctgatcgtattcgccgttaattcccatggtgaaaccgatgcacggaatgatgtgcggatagtcgccgtaacgctcgccggaaagcaccacgttaacCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTaa > 2:24674‑M1/120‑149 (MQ=255) tCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAAc < 3:332523/149‑1 (MQ=255) tCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAAc < 4:517873/149‑1 (MQ=255) tCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAAc < 4:144047/149‑1 (MQ=255) aTGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGAGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGt > 1:633178/1‑149 (MQ=255) aGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGgcg > 1:402195/1‑149 (MQ=255) cgACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGc < 4:439930/149‑1 (MQ=255) gTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGa > 1:660128/1‑149 (MQ=255) gTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGa > 3:50048/1‑149 (MQ=255) gTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGa < 3:207136/149‑1 (MQ=255) gTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGa > 2:294556/1‑149 (MQ=255) tGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCAcatca > 1:63771/1‑149 (MQ=255) aaGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCg > 1:391585/1‑149 (MQ=255) aGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGt < 1:210733/149‑1 (MQ=255) gTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTg > 4:308230/1‑149 (MQ=255) tGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAGCGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGc > 2:692147/1‑149 (MQ=255) tGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATc > 4:333951/1‑149 (MQ=255) gATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCg > 2:520887/1‑149 (MQ=255) gATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACCGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCg > 2:238503/1‑149 (MQ=255) catcaGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGtt < 1:520887/149‑1 (MQ=255) gCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTgg < 2:274137/87‑1 (MQ=255) gCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTgg > 1:274137/1‑87 (MQ=255) gCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATg < 1:394874/149‑1 (MQ=255) cacaGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATgg < 1:131918/149‑1 (MQ=255) cacaGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATgg < 1:239300/149‑1 (MQ=255) gTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAAt > 3:613034/1‑149 (MQ=255) ttATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGaa > 4:523988/1‑147 (MQ=255) ttATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGaa < 3:523988/147‑1 (MQ=255) ccgGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATa > 3:393931/1‑149 (MQ=255) gtgtTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGa < 1:116847/149‑1 (MQ=255) tttGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCa > 4:348097/1‑149 (MQ=255) ttGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAg < 1:627345/149‑1 (MQ=255) ttGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAg < 4:413684/149‑1 (MQ=255) tGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAgg > 3:586421/1‑149 (MQ=255) cTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCG‑ACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGc < 2:110667/149‑1 (MQ=255) ttCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGc > 1:309997/1‑149 (MQ=255) ttCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGc > 1:416216/1‑149 (MQ=255) ttCAGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGTGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGc > 3:413356/1‑149 (MQ=255) gggATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTa < 4:393931/149‑1 (MQ=255) gcTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGt > 2:306521/1‑149 (MQ=255) cacgttaacCTGGC‑CATCGGCAGCGATGCGCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTg < 1:63056‑M1/140‑1 (MQ=255) cACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTg < 2:618704/149‑1 (MQ=255) cgttaacCTGGC‑CATCGGCAGCGATGCGCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATgg > 1:159763‑M1/8‑105 (MQ=255) cgttaacCTGGC‑CATCGGCAGCGATGCGCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATgg < 2:159763‑M1/98‑1 (MQ=255) cTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTGGAc > 2:221503/1‑149 (MQ=255) aTCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTGGACCggg < 1:318382/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTGGACCggg < 4:235868/149‑1 (MQ=255) | AAGGGCTGTGGCAACCGAATCATTTGCAGATCATGCAGGAACATCTGCGCGACTTTGCCGTAGAACAGAGCGATGGTGAAGTGCTGATCATCAGCCGCACAGTTATTGCCCCGCCGGTGTTTGACTTCGGGATGCGCTGCACCTACATCTGGCGCATCGCTGCCGATG‑GCCAGGTTAACGTGGCGCTTTCCGGCGAGCGTTACGGCGACTATCCGCACATCATTCCGTGCATCGGTTTCACCATGGGAATTAACGGCGAATACGATCAGGTGGCGTATTACGGTCGTGGACCGGG > NC_000913/3224959‑3225253 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |