New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4286330 = | 69 (0.890) | 3 (0.040) | 3/260 | NT | 4.3% | coding (1042/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase |
? | NC_000913 | 4286367 = | 67 (0.880) | coding (1005/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATC > NC_000913/4286182‑4286477 | cACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCtt > 1:536490/1‑149 (MQ=255) cACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCtt > 3:193866/1‑149 (MQ=255) aCTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTg > 4:488098/1‑149 (MQ=255) tCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGTCCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGTATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc < 4:458893/149‑1 (MQ=255) tCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc < 1:334302/149‑1 (MQ=255) tCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc < 2:438000/149‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTg > 1:641838/1‑145 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTg < 2:641838/145‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca < 3:638230/149‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca > 2:372304/1‑149 (MQ=255) ttCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCt > 3:253188/1‑149 (MQ=255) gTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCa > 2:362877/1‑149 (MQ=255) tAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATa < 2:591960/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCa < 3:488098/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCa < 1:599419/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAg < 4:625954/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAg < 3:143701/149‑1 (MQ=255) tCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGTGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAgg > 3:517122/1‑149 (MQ=255) 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cACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCg > 1:358566/1‑149 (MQ=255) gAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCa < 1:372304/149‑1 (MQ=255) aCCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGt < 1:509780/149‑1 (MQ=255) aCCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGA‑CAGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGtt < 4:519255/149‑1 (MQ=255) cGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTg > 1:473198/1‑149 (MQ=255) tctactggtgcaccgccgatgtgggctgggtgaccggacacagttacttgctgtacggcccgctggcctgcggtgcgaccacgctgatgtttgaaggcgtacccaacTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTgg > 1:309863‑M1/108‑149 (MQ=255) gagaATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGttcg > 4:399563/1‑147 (MQ=255) gagaATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTgg < 2:256722/149‑1 (MQ=255) tactggtgcaccgccgatgtgggctgggtgaccggacacagttacttgctgtacggcccgctggcctgcggtgcgaccacgctgatgtttgaaggcgtacccaacTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAg < 1:7250‑M1/38‑1 (MQ=255) tactggtgcaccgccgatgtgggctgggtgaccggacacagttacttgctgtacggcccgctggcctgcggtgcgaccacgctgatgtttgaaggcgtacccaacTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAg > 2:7250‑M1/106‑143 (MQ=255) aaTGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTa > 1:389667/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTa > 1:668413/1‑149 (MQ=255) aTGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTAc < 3:661948/149‑1 (MQ=255) cgcAGCGACGAACGGTCGGTGGCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATAGCCGTGGATGCGGTATAGAGAATTTTGACCTGATGCTTGTCCCCCATCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGcc < 3:421560/149‑1 (MQ=255) gCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCa > 1:9586/1‑149 (MQ=255) gacgaACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCaaa > 3:575981/1‑149 (MQ=255) acgaACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAAc < 4:352750/149‑1 (MQ=255) acgaACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTAATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGCTGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAAc < 3:394146/149‑1 (MQ=255) aCGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCa < 2:674496/149‑1 (MQ=255) gtGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGt < 2:536490/149‑1 (MQ=255) 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gCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGc > 3:431914/1‑149 (MQ=255) ttCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGt > 1:262868/1‑103 (MQ=255) ttCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGt < 2:262868/103‑1 (MQ=255) ttCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCACCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGt < 4:257272/149‑1 (MQ=255) tCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTa < 3:196313/149‑1 (MQ=255) ccGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTAc < 4:196399/149‑1 (MQ=255) 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gagaATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATcgg > 1:696165/1‑149 (MQ=255) aaTATTGACCTGTTGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATcggcgg > 3:388786/1‑149 (MQ=255) aaTATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCATCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATcggcgg > 4:573951/1‑149 (MQ=255) atatTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGt > 2:677809/1‑149 (MQ=255) atTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGc < 2:455114/149‑1 (MQ=255) atTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGc < 2:389667/149‑1 (MQ=255) aCCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCa > 2:554641/1‑149 (MQ=255) aCCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCa > 3:499845/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAg > 1:667159/1‑149 (MQ=255) tGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTa > 1:420902/1‑149 (MQ=255) aTGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAGACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGa < 4:253188/149‑1 (MQ=255) aTGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGa < 1:595055/149‑1 (MQ=255) ttGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATc > 1:132568/1‑149 (MQ=255) | CACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATC > NC_000913/4286182‑4286477 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |