| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 265243 | 70 (0.960) | intergenic (‑37/+61) | yafX/ykfF | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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aaCGCCAGCGGCGATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGc < 2:63388/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGCGGCGATGGCTGGCGTtttttattcacggagacatacccatgacaacacagacacagtacgacctcgtacccgctaac < 1:445223‑M1/85‑63 (MQ=255) aCGCCAGCGGCGATGGCTGGCGCtttttattcacggagacatacccatgacaacacagacacagtacgacctcgtacccgctacc > 2:445223‑M1/1‑23 (MQ=255) ACGCCAGCGGCGATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCt < 4:671139‑M1/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGCGATGgctggcgtttttattgacggagacatacccatgacaacacagacgcagcacgacctcgcacccgctaaccaac < 2:662822‑M2/85‑74 (MQ=255) ccAGCGGCGATGgctggcgtttttattgacggagacatacccatgacaacacagacgcagcacgacctcgcacccgctaaccaac > 1:662822‑M2/1‑12 (MQ=255) CAGCGGCGATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCaaa > 4:391843‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGCGGCGATCGCTGGTGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGAATGCCTGAGGTGCGGATATACCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCaaa > 4:583795‑M1/1‑149 (MQ=255) ggcgATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCAAAGTTc < 2:476217/149‑1 (MQ=255) gcgATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCAAAGTTcc < 1:332066/149‑1 (MQ=255) gcgATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCAAAGTTcc < 2:91763/149‑1 (MQ=255) gATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCAAAGTTCCAt > 4:159791/1‑149 (MQ=255) gATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCAAAGTTCCAt > 2:161175/1‑149 (MQ=255) | CAAAGTACTGTGGCCAGAAATCGATACGCTGTTCATCGGGGACCGGCGTGACGGTCAGTTCAAATTCGGGTTGGTTAGCGGGTGCGAGGTCGTGCTGCGTCTGTGTTGTCATGGGTATGTCTCCGTCAATAAAAACGCCAGCGGCGATGGCTGGCGTATGGGGATATAAAGTGTGTTCGGGGAGGTGAATGCGGGTAAATGCTTCGCGATCAGCGGGTGGCCGTGTCTGTACGGATGCCTGAGGTGCGGATATAGCGGTTAAGACCTTCACCGGCATCCGGCTCAAAGTTCCAT > NC_000913/265095‑265388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |