New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3538406 | 65 (0.840) | 4 (0.050) | 4/250 | NT | 5.7% | coding (1022/2322 nt) | yhgF | putative transcriptional accessory protein |
? | NC_000913 | = 3538453 | 70 (0.960) | coding (1069/2322 nt) | yhgF | putative transcriptional accessory protein |
AATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGTTCCC > NC_000913/3538305‑3538601 | aaTCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCa > 1:592942/1‑149 (MQ=255) aTCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAt < 4:656921‑M2/149‑2 (MQ=255) aTCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAt > 3:305883‑M2/1‑148 (MQ=255) aTCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAt < 2:481696‑M2/149‑2 (MQ=255) aTCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCACGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAt < 4:443336‑M2/149‑2 (MQ=255) tCAACGTCTTTGGCCGTAACCTGCACGATCGGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGGGCAACGATGGGCCTCGAACCGGGTCGGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGTCGGTCGccaccagt < 2:61353/149‑3 (MQ=255) aaCGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 4:3321‑M2/149‑5 (MQ=255) aaCGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 1:615637‑M2/149‑5 (MQ=255) aCGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttac < 3:95304‑M2/149‑6 (MQ=255) tttGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGca > 1:177807/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACGCCATTTACCCGcac > 2:138271/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGcac > 2:184330/1‑149 (MQ=255) gTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGa < 3:517343/149‑1 (MQ=255) gTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGa < 4:573113/149‑1 (MQ=255) aCCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAg < 3:3321/149‑1 (MQ=255) tGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGcc > 2:537304/1‑149 (MQ=255) cACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGc > 2:283001/1‑149 (MQ=255) cACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGc > 2:234078/1‑149 (MQ=255) 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cAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGaaaaa < 2:401848/149‑1 (MQ=255) atcGATGGGCCTCGATGCAGGTCTACGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAAc > 4:605018/3‑149 (MQ=255) aaCGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAAc < 1:481696/149‑1 (MQ=255) aTGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATaa < 2:291173/149‑1 (MQ=255) aTGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATaa < 3:656921/149‑1 (MQ=255) gggCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAATATAACg > 1:683231/1‑149 (MQ=255) ggCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGt > 4:292834/1‑149 (MQ=255) gCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGtt > 1:538184/1‑149 (MQ=255) gCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGtt > 3:46124/1‑149 (MQ=255) gCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGtt < 1:465532/149‑1 (MQ=255) gCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGtt < 4:645479/149‑1 (MQ=255) ccTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAACCTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTg > 2:573373/1‑149 (MQ=255) ccTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTg > 4:353422/1‑149 (MQ=255) cTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGa > 4:322130/1‑149 (MQ=255) tCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGaa < 3:442598/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) accgacACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGaa < 2:592942/149‑1 (MQ=255) accgacACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGaa < 2:177807/149‑1 (MQ=255) ccgacACCATTTACCCGCACACAGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTACCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAg < 4:561747/149‑1 (MQ=255) gacACCATTTACGCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCa < 1:100183/149‑1 (MQ=255) cacCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGt > 3:71271/1‑149 (MQ=255) acCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGtt > 4:75495/1‑149 (MQ=255) ccATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGATCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGTTc < 1:573373/149‑1 (MQ=255) aTTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGTTccc > 4:571085/1‑149 (MQ=255) aTTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGTTccc < 3:404062/149‑1 (MQ=255) | AATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGTTCCC > NC_000913/3538305‑3538601 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |