| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGATTCCGTTC > NC_000913/4356995‑4357290 | gATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAggg < 4:66793/149‑1 (MQ=255)gATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAggg > 2:68482/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCGGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGtgact < 1:337701‑M2/149‑6 (MQ=255) 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acaggaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCggg > 1:483728/1‑149 (MQ=255) gaacagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCaa > 2:520228/1‑149 (MQ=255) acagCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGa < 4:52145/149‑1 (MQ=255) cagGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACa < 4:589178/149‑1 (MQ=255) cagGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACa < 2:408651/149‑1 (MQ=255) agGTTATACGGACCGGTTTTCTCCACACCGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGACTACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACAt < 3:681644/149‑1 (MQ=255) agGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACAt < 4:431391/149‑1 (MQ=255) agGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGACATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACAt > 3:431878/1‑149 (MQ=255) ttATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACAtgtg > 3:670104/1‑149 (MQ=255) taCGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCTATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTc > 2:286073/1‑149 (MQ=255) 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ttttCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGGCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATg > 4:364467/1‑149 (MQ=255) ttCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGtt > 4:613974/1‑149 (MQ=255) tctcAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGttt < 4:590231/149‑1 (MQ=255) ctcAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGtttt < 1:97426/149‑1 (MQ=255) ctcAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGCGCTCGTTATCGATGtttt < 3:561884/149‑1 (MQ=255) 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tCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAAACAg < 3:135495/149‑1 (MQ=255) cccGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGcc < 4:521990/149‑1 (MQ=255) ccGGAGTCAGCAGGGtgactccggggatggaaaaagacggcaccatgagcgactttggtattccggccagcatcgtggcgtaatacctctacgaacatggcatcgttgttgagaaaaccggtccgtataacctgctgttcctgttcagc < 2:500146‑M2/149‑135 (MQ=255) ggAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATc < 1:199914/149‑1 (MQ=255) ggAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATc < 1:14663/149‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGa < 4:636074/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGAt > 4:30189/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGAt < 3:35608/149‑1 (MQ=255) gcagGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGATTcc > 2:645679/1‑149 (MQ=255) gcagGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGATTcc > 1:18371/1‑149 (MQ=255) gggTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATAAGATTCCGtt < 4:328988/149‑1 (MQ=255) ggTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGATTCCGTtc > 2:392982/1‑149 (MQ=255) | GATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATACATGTGCTCGTTATCGATGTTTTTGAAGCCGTGCCAGGTGCTGTCAGAACGCAGCGGCCAGCATTCAGTCGTATCGATATGATCCGGCTGCCATACATCAAAGAACCAGCCATCAGATTCCGTTC > NC_000913/4356995‑4357290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |